UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA: CARTA DEI SERVIZI (2013)

RTI_0275
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 1 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
AZIENDA COMPLESSO OSPEDALIERO SAN FILIPPO NERI – ROMA
DIPARTIMENTO DI SCIENZE RADIOLOGICHE E MEDICINA DI LABORATORIO
UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA:
CARTA DEI SERVIZI (2013)
INDICE
1.
OBIETTIVO DEL DOCUMENTO ....................................................................................................................................... 2
2.
SETTORI E PERSONALE COINVOLTO .......................................................................................................................... 2
3.
TERMINOLOGIA E ABBREVIAZIONI ............................................................................................................................. 2
4.
ATTIVITÀ ................................................................................................................................................................................. 3
Finalità e impegni del laboratorio specialistico ........................................................................................................ 3
Elenco analisi effettuate .......................................................................................................................................................... 4
Attività e orario del laboratorio ...................................................................................................................................... 14
Elenco degli esami urgenti .................................................................................................................................................. 15
Lavorazioni prioritarie diurne .......................................................................................................................................... 18
Tempi di risposta delle analisi . Turn Around Time (TAT) ............................................................................... 21
Consultazione degli esami e ritiro dei referti ......................................................................................................... 30
Come contattare il personale del laboratorio .......................................................................................................... 31
Osservatorio epidemiologico e attività scientifiche .............................................................................................. 32
Attività formativa..................................................................................................................................................................... 32
Specificità e qualità del laboratorio (in 10 punti riassuntivi) ....................................................................... 33
5.
ALLEGATI .............................................................................................................................................................................. 34
7.
CRITERI E TEMPISTICA DELLE REVISIONI della carta ..................................................................................... 34
Rev1 del 29/01/2013
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 2 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
1. OBIETTIVO DEL DOCUMENTO
Far conoscere – a operatori sanitari, pazienti e utenti dell’ospedale – l’organizzazione di base, le
attivit{ e l’offerta del laboratorio (Unit{ Operativa Complessa - UOC) di Microbiologia-Virologia.
2. SETTORI E PERSONALE COINVOLTO
Tutto il personale di UOC MV è coinvolto nell’assicurare - e possibilmente migliorare - i servizi di
base e l’offerta del presente documento.
Sono interessate alla presente “carta” – in qualità di possibili utenti interni - tutte le Unità
Operative dell’Azienda Ospedaluera (ricovero ordinario, Day Hospital, Week Sugery, Terapia Intensiva,
ambulatorio di reparto, preospedalizzazione, dimissioni protette e servizi ambulatoriali SGAA),
l’utenza ambulatoriale che accede all’ospedale o intende fruire dei servizi dell’ospedale stesso, nonché
la associazioni di pazienti e di cittadini.
3. TERMINOLOGIA E ABBREVIAZIONI
DNweb: applicativo informatico per la richiesta degli esami di laboratorio, dai reparti di ricovero,
e la visualizzazione/stampa dei referti.
H24: nell’arco di 24 ore, 365 giorni l’anno.
ESAME (test): l’indagine di laboratorio per verificare o escludere una certa condizione; nel caso
della microbiologia-virologia un esame (test) è frequentemente usato per determinare la presenza
di un microrganismo patogeno, comprendere il suo ruolo (agente di infezione o semplice
colonizzante), supportare la scelta di una terapia appropriata (antibiogramma).
LABORATORIO: il luogo fisico dove vengono eseguiti i test.
LAVORAZIONE PRIORITARIA (diurna): esame di routine per il quale può essere attivato un
percorso prioritario per eseguirlo – nella SOLA fascia 8-20 feriale – come urgenza.
RICHIESTA: secondo Bailey & Scott's Diagnostic Microbiology, “è un modulo ordinativo di un test,
inviato in laboratorio unitamente a un campione biologico”
TAT: il tempo di risposta delle analisi; letteralmente, il tempo che trascorre tra la presa in carico
del materiale biologico e il referto firmato (receipt to report Turn Around Time - TAT),
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 3 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
TSLB: Tecnico Sanitario di Laboratorio Biomedico
UO: Unità Operativa
UOC MV: Unità Operativa Complessa Microbiologia e Virologia
URGENZA: lavorazione indifferibile del laboratorio, effettuata nell’arco delle 24 ore
(eventualmente chiamando il personale in pronta disponibilit{) per 365 giorni l’anno.
4. ATTIVITÀ
Finalità e impegni del laboratorio specialistico
L’Unit{ Operativa Complessa di Microbiologia e Virologia (di seguito indicata come UOC MV) è un
laboratorio mono-specialistico, riservato alla patologia infettiva. La struttura è censita nel Piano per la
Riorganizzazione delle strutture che erogano prestazioni di laboratorio nella Regione Lazio (D.C. R.
Lazio. N.8 del 23 gennaio 2009).
UOC MV è nata nel 1997, per l’esigenza di dedicare stabilmente un gruppo di operatori alle
aree specialistiche della virologia (molecolare e immuno-diagnostica) e della batteriologia clinica. La
struttura si è poi modificata per affiancare le necessit{ Dipartimento di Emergenza (DEA), dell’area
critica (Terapie Intensive), la progressiva specializzazione di alcuni reparti ospedalieri, la
Commissione Infezioni Ospedaliere (CIO). Nell’organizzazione attuale, UOC MV è compresa nel
Dipartimento di Scienze Radiologiche e Medicina di Laboratorio ed è situata al 1° piano dell’edificio C
dell’ospedale.
UOC MV ha la missione di fornire servizi avanzati di laboratorio e supporto specialistico
professionale/scientifico nel campo della Microbiologia Clinica e del Controllo Infezioni. Per questo, si
impegna a:
utilizzare adeguati metodi analitici, privilegiando metodiche validate dalla normativa europea
sulla diagnostica in vitro (CE-IVD), in modo da fornire risultati clinicamente fruibili, in accordo alla
attuale vocazione ospedaliera (che è assistenziale primariamente);
verificare che i campioni e i materiali biologici lavorati siano idonei e appropriati per trarne referti
clinicamente significativi;
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 4 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
perseguire programmi di garanzia della qualità che assicurino la corretta determinazione,
elaborazione, gestione e comunicazione dei risultati ai clinici e ai pazienti;
assicurarsi che l'ambiente e le attrezzature di laboratorio siano continuamente monitorati per
garantire la sicurezza del personale;
promuovere un clima che indirizzi gli operatori verso la formazione e la crescita professionale,
anche attraverso la partecipazione a iniziative educative e partecipazione a progetti di ricerca;
fornire un luogo per la formazione di tecnici (TSLB), medici, biologi e altri operatori che intendono
avvicinarsi al mondo della microbiologia clinica applicata.
Elenco analisi effettuate
Le analisi di microbiologia-virologia sono richiedibili:
a) dalle UUOO ospedaliere: attraverso l’interfaccia informatica “DNweb” (vedi “microbiologia
pagina 1” o “microbiologia pagina 2”); da ricordare che sul DNweb non figurano tutte le analisi
potenzialmente richiedibili: per ogni dubbio, consultare l’elenco a seguire o consultare il
laboratorio;
b) dagli ambulatori SGAA, attraverso il programma “DNlab”;
c) dal Pronto Soccorso, attraverso usuale modulistica cartacea;
d) da ASL e ospedali esterni al S.Filippo Neri, attraverso modulistica dedicata (cosiddetto
“allegato A” disponibile presso la Direzione Sanitaria di Presidio del San Filippo Neri);
e) dagli sportelli ReCUP (Centro Unico di Prenotazione) dei centri prelievo aziendali: San Filippo
Neri (via Martinotti, 20), presidio S.Andrea (via Cassia, 721), clinica Salus Infirmorum (via
della Lucchina, 41).
L’elenco completo delle prestazioni erogabili – suddivise per settore di attività - è mostrato nella
seguente tabella. Da ricordare sempre che molte delle analisi del presente elenco sono “multimateriale”, cioè possono essere eseguite su più materiali biologici (per ogni dubbio o richiesta si
suggerisce di consultare il laboratorio).
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 5 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
BATTERIOLOGIA – MICOLOGIA
ANTIBIOGRAMMA KIRBY BAUER
ANTIBIOGRAMMA MIC
ANTIBIOGRAMMA MICOBATTERI
ANTIBIOGRAMMA LIEVITI
BATTERI IDENTIFICAZIONE BIOCHIMICA (CARD, GALLERIA)
LIEVITI IDENTIFICAZIONE BIOCHIMICA (CARD, GALLERIA)
CLOSTRIDIUM DIFFICILE ANTIGENE COMUNE GDH
CLOSTRIDIUM DIFFICILE TOSSINA A+B
COLTURA STREPTOCOCCO BETA EMOLITICO (A LIVELLO FARINGEO)
COLTURA STREPTOCOCCO BETA EMOLITICO (A LIVELLO VAGINALE, RETTALE, PERIANALE,
VAGINO-RETTALE)
COLTURA C.DIPHTERIAE
COLTURA C.DIPHTERIAE + N.MENINGITIDIS
COLTURA CANDIDA SPP. (MATERIALI VARI)
COLTURA SORVEGLIANZA CANDIDA (5 SITI; ESAME PER INTERNI - AREA INTENSIVA;
SORVEGLIANZA ATTIVA COLONIZZAZIONI)
COLTURA E.COLI O:157 (E.COLI ENTEROEMORRAGICI)
COLTURA LIQUIDO SEMINALE (BATTERIOSCOPICO, RICERCA TRICHOMONAS, COLTURA PER
G.C, GONOCOCCO E GARDNERELLA)
COLTURA MICOPLASMI UROGENITALI (UREAPLASMA UREALITYCUM, MYCOPLASMA
HOMINIS) - VARI MATERIALI
COLTURA N.GONORRHOEAE
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 6 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
COLTURA N.MENINGITIDIS
COLTURA S.AUREUS (COLTURA SORVEGLIANZA NASO/FARINGE)
COLTURA YERSINIA ENTEROCOLITICA
COPROCOLTURA PER SALMONELLA, SHIGELLA, CAMPYLOBACTER
COPROCOLTURA PER ENTEROPATOGENI (SALM. + SHIG. + CAMPY. + E.COLI157)
EMOCOLTURA (AEROBI + ANAEROBI)
ES. BATTERIOSCOPICO MICOBATTERI (KINYIOUN)
ESAME BATTERIOLOGICO SECREZIONI BRONCHIALI (MICROSCOPICO + COLTURALE
QUANTITATIVO)
ESAME BATTERIOSCOPICO (MATERIALI VARI)
ESAME COLTURALE MATERIALI LIQUIDI (LIQUIDI CAVITARI, PUS, ETC.)
ESAME COLTURALE MATERIALI DIVERSI (TIPICAMENTE SECREZ.FERITA PRELEVATE CON
TAMPONE)
COLTURA SORVEGLIANZA (PER BATTERI MULTIRESISTENTI SU MATERIALI VARI; ESAME PER
INTERNI; SORVEGLIANZA ATTIVA COLONIZZAZIONI)
ESAME COLTURALE PER MICOBATTERI (MGIT® + LOW.JENSEN)
ESAME MICROBIOLOGICO LIQUIDO CEFALORACHIDIANO (BATTERIOSCOPICO, ANTIGENI
H.INFLUENZAE B, S.PNEUMONIAE, S.AGALACTIAE, N.MENINGITIDIS A-Y-C-W135, E.COLI K1,
C.NEOFORMANS, COLTURA)
HELICOBACTER PYLORI ANTIGENE FECI
QUANTIFERON-TB GOLD® (ANTIGENE, NIL)
QUANTIFERON-TB GOLD® (MITOGENO)
RICERCA GONOCOCCO (BATTERIOSCOPICO, COLTURA)
RICERCA MICETI (COLTURALE + OSSERVAZIONE MORFOLOGICA MICROSCOPICA)
TAMPONE (COLTURA) NASALE-AURICOLARE-OCULARE
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 7 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
TAMPONE FARINGEO (COLTURA, IDENTIFICAZIONE DI LANCEFIELD)
TAMPONE URETRALE (ES.MICROSCOPICO - ANCHE PER TRICHOMONAS - COLTURA
GONOCOCCO, CANDIDA, GERMI COMUNI, GARDNERELLA)
TAMPONE VAGINALE (ES.MICROSCOPICO, RICERCA TRICHOMONAS, COLTURA CANDIDA,
GARDNERELLA, S.AGALACTIAE, GERMI COMUNI)
URINOCOLTURA (CONTA COLONIE, COLTURA SU PIASTRA, VALUTAZIONE PIURIA)
PARASSITOLOGIA
CRYPTOSPORIDIUM PARVUM ANTIGENE (DA GESTIRE UNITAMENTE A GIARDIA INTESTINALIS
ANTIGENE)
GIARDIA INTESTINALIS ANTIGENE (DA GESTIRE UNITAMENTE A CRYPTOSPORIDIUM PARVUM
ANTIGENE)
ENTAMOEBA HISTOLYTICA/DISPAR ANTIGENE
ESAME COMPLETO FECI (CHIMICO, PARASSITI, SANGUE OCCULTO)
ESAME PARASSITOLOGICO (ALTRI MATERIALI)
ESAME PARASSITOLOGICO (PARASSITI INTESTINALI)
MALARIA TEST (RICERCA IMMUNOCROMAT. AG P.FALCIPARUM SU SANGUE INTERO)
PNEUMOCISTIS CARINII RICERCA DIRETTA (IF)
RICERCA A FRESCO T.VAGINALIS
SANGUE OCCULTO FECI
SCOTCH TAPE TEST
SIEROLOGIA, IMMUNODIAGNOSTICA MICROB.-VIROLOGICA
ANTICORPI ANTI BRUCELLA (SIERODIAGNOSI WRIGHT)
BRUCELLA IGG (EIA)
BRUCELLA IGM (EIA)
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
SIERODIAGNOSI PER SALMONELLA (TIFO E PARATIFO / WIDAL)
SIEROSIAGNOSI PER TIFO, PARATIFO E MELITENSE (WIDAL + WRIGHT)
WEIL FELIX SIERODIAGNOSI (RICKETTSIA): OX2, OX19, OXK
RICKETTSIA CONORII IGG
RICKETTSIA CONORII IGM
LEISHMANIA IGG
LISTERIA MONOCYTOGENES ANTICORPI (FISSAZIONE COMPLEMENTO)
INFLUENZA A VIRUS ANTICORPI (FISSAZIONE COMPLEMENTO)
INFLUENZA B VIRUS ANTICORPI (FISSAZIONE COMPLEMENTO)
PARAINFLUENZA VIRUS ANTICORPI (FISSAZIONE COMPLEMENTO)
RSV (RESPIRATORIO SINCIZIALE VIRUS) ANTICORPI (FISSAZIONE COMPLEMENTO)
ADENOVIRUS ANTICORPI (FISSAZIONE COMPLEMENTO)
BORRELIA BURGDORFERI IGG
BORRELIA BURGDORFERI IGM
CHLAMYDIA 3 SPECIE (PNEUMONIAE, TRACHOMATIS, PSITTACI) IGG E IGM (M.I.F.)
CHLAMYDIA TRACHOMATIS IGG (EIA)
CHLAMYDIA TRACHOMATIS IGM (EIA)
CITOMEGALOVIRUS IGG
CITOMEGALOVIRUS IGM *
CITOMEGALOVIRUS IGG AVIDITÀ
COXSACKIEVIRUS A
COXSACKIEVIRUS B
ECHOVIRUS PNEUMOTROPI
Pagina 8 di 36
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
ECHOVIRUS NEUROTROPI
ECHINOCOCCUS AB IHA (ECHINOTEST)
HAV-AB IG TOTALI
HAV-AB IGM
HBCAB
HBC-IGM
HBEAB
HBEAG
HBSAB (QUANTITATIVO)
HBSAG *
HCV IMMUNOBLOTTING (LIA/RIBA)
HCV-AB *
HDV AB (DELTA V. ANTICORPI TOTALI)
HDV IGM (DELTA V. IGM)
HELICOBACTER PYLORI IGG (ELFA)
HELICOBACTER PYLORI IGG IMMUNOBLOTTING
HERPES SIMPLEX1+2 IGG
HERPES SIMPLEX 1+2 IGM
HIV 1-2 IMMUNOBLOTTING
HIV ANTIGENE P24 (+AB)
HIV1-2 AB EIA
CHLAMYDIA PNEUMONIAE IGM (EIA) 'SCREEN'
COXIELLA BURNETII IGM (EIA) 'SCREEN'
Pagina 9 di 36
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
MYCOPLASMA PNEUMONIAE IGM (EIA) 'SCREEN'
LEGIONELLA PNEUMONIAE IGM (EIA) 'SCREEN'
IGM (IFA) ANTI AGENTI PNEUMOTROPI (LEGIONELLA, MYCOPLASMA, C.BURNETII,
C.PNEUMONIAE, ADENOVIRUS, RSV, INFLU.VIRUS A-B, P.INFLU.VIRUS 1,2, 3)
LEGIONELLA PNEUMOPHILA ANTIGENE URINARIO
LEGIONELLA PNEUMOPHILA 1-7 IGG EIA
LEGIONELLA PNEUMOPHILA 1-7 IGM EIA
LEGIONELLA PNEUMOPHILA 1-14 IGG IFA
LEGIONELLA PNEUMOPHILA 1-14 IGM IFA
MONOTEST (AB ETEROFILI PER M.I.)
MORBILLO VIRUS IGG
MORBILLO VIRUS IGM
MYCOPLASMA PNEUMONIAE IGM EIA
PAROTITE VIRUS IGG
PAROTITE VIRUS IGM
PARVOVIRUS B19 IGG
PARVOVIRUS B19 IGM
PNEUMOCOCCO ANTIGENE URINARIO
ROSOLIA VIRUS IGG
ROSOLIA VIRUS IGM *
ROSOLIA VIRUS IGG AVIDITÀ
TOXOPLASMA IGG *
TOXOPLASMA IGM *
Pagina 10 di 36
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
TOXOPLASMA IGG AVIDITÀ
TOXOPLASMA IGA
TPHA (QUALITATIVO)
TPHA (QUANTITATIVO)
TREPONEMA PALLIDUM IG TOTALI ('SCREEN') CLIA
TREPONEMA PALLIDUM IGM EIA
VDRL (RPR / ANTI CARDIOLIPINA)
VARICELLA ZOSTER VIRUS IGG
VARICELLA ZOSTER VIRUS IGM
VIRUS EPSTEIN BARR EBNA IGG
VIRUS EPSTEIN BARR VCA IGG
VIRUS EPSTEIN BARR VCA IGM
VIRUS EPSTEIN BARR EA IGG
VIRUS EPSTEIN BARR EA IGM
ROTA VIRUS FECI
ADENO VIRUS FECI
NORO VIRUS FECI
BIOLOGIA MOLECOLARE (TEST DI INTERESSE MICROBIOLOGICO)
BK DNA
MTB PCR (TEST MOLECOLARE RAPIDO) & RIFAMPICINA RESISTENZA
IDENTIFICAZIONE MYCOB DA COLTURA
CLOSTRIDIUM DIFFICILE PCR (TOXB, TOXBIN,TCDCN117)
Pagina 11 di 36
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
GBS (STREP.AGALACTIAE) PCR (TEST MOLECOLARE RAPIDO)
MRSA (S.AURES - MDR - NASALE) PCR (TEST MOLECOLARE RAPIDO)
CHLAMYDIA PNEUMONIAE DNA
LEG.PNEUMOPHILA PCR
MYCOPLASMA PN. PCR
CHLAMYDIA TRACHOMATIS DNA
CYTOMEGALOVIRUS PCR
ENTEROVIRUS (ECHO, COXSACKIE, VARI) RICERCA BIOMOLECOLARE
EPSTEIN BARR VIRUS PCR
RSV PCR
HBV DNA
HBV GENOTIPO
HBV MUTAZIONI (RESISTENZA AI FARMACI)
HCV GENOTIPO
HCV RNA QUALITATIVO
HCV RNA QUANTITATIVO
HERPES SIMPLEX 1 DNA
HERPES SIMPLEX 2 DNA
HPV DNA SCREENING
HPV DNA TIPIZZAZIONE
VARICELLA ZOSTER VIRUS DNA
BIOLOGIA MOLECOLARE (TEST NON INFETTIVOLOGICI)
Pagina 12 di 36
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 13 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
ANALISI MUTAZIONI DNA FATTORI COAGULAZIONE (V, VR2, II, XIII, BETA-FIBRINOGENO, PAI1, AG PIASTRINICO, FATTORE GENOTIPO MTHFR, APOLIPOPROTEINA B100, ACE,
APOLIPOPROTEINA E): 14 MUTAZIONI
ANALISI MUTAZIONI DNA FATTORI COAGULAZIONE (V, VR2, II, FATTORE GENOTIPO MTHFR):
4 MUTAZIONI
INTERLEUCHINA 28B MUTAZIONI (RS12, RS80)
CELIACHIA TIPIZZAZIONE HLA (DQA1, DQB1, DRB)
EMOCROMATOSI (V53M, V59M, H63D, H63H, S65C, Q127H, E168Q, E168X, W169X, C282Y,
Q283P, Y250X ET AL.): 18 MUTAZIONI
VARIO
PRELIEVI VENOSI (PER PROVETTE VACUTAINER® E/O EMOCOLTURE)
TAMPONI, ASPIRATI, "SCRAPING", PRELIEVO ANNESSI CUTANEI, ETC.
ESTRAZIONE DNA/RNA
Il segno * indica alcune metodiche di cui sono disponibili più versioni in laboratorio (per effettuare
test di confronto/conferma sui risultati dubbi).
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 14 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Attività e orario del laboratorio
TUTTI campioni biologici vengono accettati:

i giorni feriali
dalle 8 alle 20;

domenica e festivi
dalle 8 alle 14
Alcuni campioni raccolti dopo tali orari possono essere conservati in reparto a temperatura ambiente
(ad esempio, i sistemi dotati di terreno di trasporto per liquidi – tipo Portagerm o tamponi “floccati Eswab) e consegnati il mattino successivo. Per i dettagli relativi alla conservazione di questi
materiali si prega di riferirsi al manuale prelievi aziendale (RICHIESTA, RACCOLTA ED INVIO DI
CAMPIONI PER ESAMI MICROBIOLOGICI, VIROLOGICI, BIOMOLECOLARI).
IMPORTANTE (EMOCOLTURE):

dal gennaio 2013, è operativa una strumentazione per emocolture posta fuori del
laboratorio e disponibile H24. Pertanto, i flaconi di sangue prelevati di notte e nel
pomeriggio dei giorni festivi non devono più essere lasciati sul bancone
dell’accettazione di microbiologia (1° piano edificio C, di fronte al Centro Trasfusionale),
bensì inseriti nello strumento “Bactec” presente nella stessa stanza.1
Da ricordare che:

gli orari sopra indicati indicano l’accettazione (presa in carico) dei campioni biologici e
delle relative richieste;
i tempi di effettiva lavorazione dei campioni biologici2 e di risposta sono mostrati,
sempre in questo documento, nel capitolo “Descrizione delle attività”, alle sezioni
“Esami urgenti”, “Lavorazioni prioritarie diurne” e “Tempi di risposta delle analisi-TAT”.
L’inserimento dei flaconi da emocoltura pochi minuti dopo il prelievo consente una riduzione dei tempi di
risposta, soprattutto per i pazienti critici.
1
2
A seconda che si tratti di routine, oppure di una richiesta di “urgenza” o di “lavorazione prioritaria diurna”.
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 15 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Elenco degli esami urgenti
Le seguenti lavorazioni sono eseguite in urgenza H24 (per i pazienti INTERNI dell’ospedale):
possono dar luogo ad una chiamata del personale tecnico e/o dirigente, in pronta disponibilità.
Quale esame
Come richiedere
(normalmente
attraverso il
programma
Dnweb; per il P.S.
la richiesta è
cartacea)
Esame microbiologico
rapido ed esame colturale
liquido cefalorachidiano
per sospetta meningite
batterica (Acute
Bacterial Meningitis ABM)
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; liquido
cefalo-rachidiano –
puntura lombare –
“COLT.LIQUOR”).
BK DIRETTO (sospetta
TBC polmonare attiva)
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; BKespettorato - "BK
DIRETTO")
Sierologia epatiti
(HBsAg, HCVAb) per
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
Quando
si
effettua
H24
Quanto tempo
per avere il
referto
(dalla
ricezione
del
campione
in
laboratorio.:
"Receipt-toReport TAT")
90 minuti
Pronta
disponibilità
(notturna
e/o festiva)
NOTE
Figure in pronta
disponibilità
(notturna e/o
festiva)
sì
H 24 / 7 gg
Fare anche le
emocolture!
Ricordarsi che
non basta
inviare il liquor
se c'è un
sospetto di ABM,
ma occore
prelevare due
set di
emocolture
Tecnico di
laboratorio +
Dirigente
(biologo/medico)
Richiesta su
consulenza dello
specialista
pneumologo o
dell'
infettivologo;
concomitante
indisponibilità di
locali per
isolamento
respiratorio (o
analoghe
possibilità di
gestire il
paziente in
sicurezza).
Dirigente
(biologo/medico),
limitatamente alla
MATTINA dei festivi
lun-sab
feriali: 820;
domenica
e festivi 814
120 minuti
nei festivi
solo dalle 8
alle 14
H24
120 minuti
sì
H 24 / 7 gg
Indicare
Tecnico di
CHIARAMENTE
laboratorio +
che la richiesta è Dirigente
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 16 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
emodialisi urgente
pag1”; profili –
“DIALISI
URGENTE”).
Sierologia epatite B per Richiesta via
profilassi
DNweb
(NEONATOLOGIA)
(“microbiologia
pag1”; “EPATITE
B”), oppue
cartacea.
Sierologia HIV per
Profilassi Post
Esposizione degli
operatori sanitari
(accertamento rapido su
paziente)
Esame rapido per
plasmodi malarici:
Emocolture
NEONATOLOGIA
(allestimento colture
"isolator") - VEDI NOTE
lun-sab
feriali: 820;
domenica
e festivi 814
120 minuti
per DIALISI.
(biologo/medico)
nei festivi
solo dalle 8
alle 14
richiesta per la
MADRE a cura
del
P.S.OstetricoGinecologico
(richiesta
cartacea);
indicare
CHIARAMENTE
che la richiesta è
per
PROTOCOLLO
PROFILASSI
NEONATALE
Dirigente
(biologo/medico),
limitatamente alla
MATTINA dei festivi
L'esame verrà
refertato - se
positivo - con la
dicitura
"Western Blot di
conferma in
corso"
Dirigente
(biologo/medico)
Richiesta mediante
modulistica
“consenso
informato HIV”. La
PPE è efficace solo
per poche ore dopo
l'esposizione.
Nell'impossibilità
del consenso,
valutara la
possibilità di
iniziare comunque
la PPE.
H24
30 minuti
sì
H 24 / 7 gg
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; sangue –
parassitologia –
“MALARIA TEST”).
H24
30 minuti
sì
H 24 / 7 gg
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; sangue –
emocolture
pediatriche –
“EMOCOLTURA”.
H24
non applicabile
(il referto
dell'emocoltura
dipende
dall'eventuale
crescita
microbica e non
può essere mai
contestuale al
prelievo)
sì
H 24 / 7 gg
Dirigente
(biologo/medico)
Per la richiesta
di emocolture
della
neonatologia, è
applicato un
protocollo
specifico
concordato con
la neonatologia.
E' possibile un
aggiornamento
del protocollo
durante il 2013.
Tecnico di
laboratorio
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 17 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Esami colturali materiali
biologici “critici” (ad es.,
tessuti prelevati in seduta
operatoria), non gestibili
mediante sistemi di
trasporto/conservazione VEDI NOTE
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; ferite;
tessuto
(frammento) –
COLTURA
MATERIALI
DIVERSI)
H24
non applicabile
(il referto della
coltura dipende
dall'eventuale
crescita
microbica e non
può essere mai
contestuale al
prelievo)
sì
H 24 / 7 gg
Si ricorda che
la reperibilità
è prevista solo
se il materiale
non è
Tecnico di
inseribile nei
laboratorio
flaconi
Portagerm
(tessuti, ad
es.) o Copan Eswab.
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 18 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Lavorazioni prioritarie diurne
Alcune lavorazioni sono eseguite nella fascia diurna o pomeridiana (lun.-sab.: 8-20) con tempi di
risposta in routine verificabili nell’apposita a sezione del documento (“Tempi di risposta delle analisi –
TAT”). Per le esigenze cliniche/organizzative dei pazienti ricoverati, possono essere lavorate –
sempre nella stessa fascia oraria – in modo prioritario.
Quale esame
Come richiedere
(normalmente
attraverso il
programma
Dnweb; per il P.S.
la richiesta è
cartacea)
LEGIONELLA ricerca
antigenica rapida urine
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.1”; Batteri
pneumotropi atipici
– “Legionella
antigene
urinario”.)
PNEUMOCOCCO ricerca
antigenica rapida urine
Ricerca molecolare
Streptococco B emolitico
gruppo B (GBS su
tampone vaginorettale) per profilassi
INTRAPARTO (IAP)
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.1”;
Pneumococco
ricerca mirata –
“Pneumococco
antigene”.)
richiesta richiesta
via DNweb
(“microbiologia
pag1”; “ESAMI
BIOMOLECOLARI”)
oppure cartacea.
Quando
si
effettua
Quanto tempo
per
avere
il
referto
(dalla
ricezione
del
campione
in
laboratorio.:
"Receipt-toReport TAT")
Pronta
disponibilità
(notturna
e/o festiva)
lun-sab
feriali: 820
3O minuti
no
lun-sab
feriali: 820
3O minuti
no
lun-ven:
8-18;
sabato 814
(no
domenica
e festivi)
120 minuti (a
regime);
il
test è in fase
pilota da
dicembre 2012
no
NOTE
Richiesta su
consulenza dello
specialista
pneumologo o
dell'
infettivologo;
condizioni
cliniche di
emergenza;
impossibilità di
gestire il
paziente
mediante
procedure di
terapia empirica
(CAP).
Figure in pronta
disponibilità
(notturna e/o
festiva)
no
no
Test applicabile
a pazienti non
precedentement
e indagate per
GBS; effettuare
prelievo vaginorettale;
attenzione
all'eccesso di
muco
(possibilità che
no
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 19 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
il test fallisca).
Sierologia epatiti
(HBsAg, HBcIgM,
HAVIgM, HCVAb) per
sospetto clinico epatite
acuta
richiesta richiesta
via DNweb
(“microbiologia
pag1”; profili –
“EPATITE ACUTA”).
Monotest esame
rapido - Ab eterofili
(mononucleosi infettiva)
richiesta richiesta
via DNweb
(“microbiologia
pag1").
Sierologia EBV (Ab
specifici), CMV, Rosoliavirus, Morbillo virus
richiesta richiesta
via DNweb
(“microbiologia
pag1”).
Sierologia HIV
(sospetto clinico
infezione da HIV)
Richiesta mediante
modulistica ad hoc
(richiesta cartacea
su modulo
“consenso
informato HIV”.
Emocolture pazienti
adulti (allestimento
colture)
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; sangue –
emocolture VP o
CVC –
“EMOCOLTURA”.
lun-ven
feriali: 818; sab e
prefestivi:
8-20
180 minuti
no
no
lun-sab
feriali: 820
30 minuti
no
no
lun-ven
feriali: 818;
sab feriali
: 8-20
lun-ven
feriali: 818;
sab
feriali: 820
lun-sab
feriali: 820
festivi: 814
180 minuti
240 minuti
non applicabile (il
referto
dell'emocoltura
dipende
dall'eventuale
crescita
microbica e non
può essere mai
contestuale al
prelievo)
no
Non prevista, in
urgenza,
l'esecuzione di
test di conferma
di eventuali
positività
no
no
Se richiesta la
lavorazione
prioritaria,
l'esame verrà
refertato - se
positivo - con la
dicitura
"Western Blot di
conferma in
corso"
no
no
Al di fuori di
questi orari,
inserire
direttamente i
flaconi nello
strumento
BACTEC posto
al di fuori del
laboratorio
(stanza
accettazione
della
microbiologia)
.
no
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 20 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Esami colturali vari
(allestimento colture per
urine, feci, tamponi,
liquidi, escreato, etc.)
Richiesta via
DNweb
(“microbiologia
pag.2”; …
Esame
batterioscopico su
materiali biologici
(escreato, liquidi) e colture
(emocolture positive)
Richiesta via
DNweb ("microb.
Pag2") dei
rispettivi esami +
accordi telefonici
Clostridium difficile
ricerca rapida su feci
richiesta richiesta
via DNweb
(“microbiologia
pag2”).
lun-sab
feriali: 820
festivi: 814
variabile
(mediamente, 30
minuti)
no
lun-sab
feriali: 820
60 minuti
no
Al di fuori di
questi orari,
usare i
contenitori
appropriati per
la
conservazione,
solitamente a
temperatura
ambiente;
ricordarsi che
per le feci il
campione deve
essere
estemporaneo;
per le urine è
ipotizzabile una
refrigerazione
massima di 2
ore, prima
dell'invio.
no
no
lun-sab
feriali: 820
60 minuti
no
Considerare la
possibilità di un
esito incerto del
test rapido (e la
necessità di
aspettare il
giorno feriale
successivo per
l'esito del test
molecolare).
no
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 21 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Tempi di risposta delle analisi . Turn Around Time (TAT)
Il tempo di risposta delle analisi o, più correttamente, il tempo che trascorre tra la presa in carico del
materiale biologico e il referto firmato (Turn Around Time - TAT), è un parametro comunemente
usato per misurare l’efficienza dei laboratori. Un TAT breve aiuta il clinico a prendere decisioni più
rapide per il paziente e indirettamente contribuisce a ridurre l’eventuale ospedalizzazione.
Occorre sottolineare che il TAT degli esami microbiologici è – per tipologia e anche per
complessità – mediamente più lungo di quello delle analisi di chimica clinica. In molti casi, trattandosi
di esami colturali (cioè legati alla curva di crescita di un microrganismo), è molto difficile ridurre il
TAT sotto un certo valore.
UOC MV è comunque impegnata a ridurre il TAT, compatibilmente con i vincoli tecnici,
economici e organizzativi. Nella tabella seguente è visualizzato il TAT medio di tutti gli esami
effettuati in laboratorio, nel 2009-2012.
2009
2010
2011
2012
2013
166
151
170
174
174
3,5
2,5
2,7
2,02
1,84
n° metodiche attivate
TAT medio analisi
(giorni)
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 22 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Com’è osservabile, il TAT medio si ridotto di un giorno e mezzo nell’arco del quinquennio, senza
peraltro ridurre il numero di metodiche diverse offerte dal laboratorio.
Il TAT delle analisi determina anche i giorni necessari – per gli utenti ambulatoriali – per
disporre dei referti. I giorni necessari a completare tutte le analisi, infatti, normalmente corrispondono
al TAT del test più laborioso che è stato richiesto3. Per gli utenti ambulatoriali tutto questo si traduce
nella “data di ritiro” (o di visualizzazione su Internet) stampata sulla ricevuta che viene consegnata al
termine del prelievo. Il TAT mediano dei diversi test microbiologici, virologici e biomolecolari è
indicato nella tabella seguente (valori 2012).
ANALISI
TAT
mediano
(giorni)
ARRICCHIMENTO BATT.ANAEROBI
5
ANTICORPI ANTI BORRELIA BURGDORFERI GROUP
6
ANTICORPI ANTI BORRELIA BURGDORFERI - RECOMBINANT TEST
3
BORRELIA BURGDORFERI WESTERN BLOT
8
MTB COMPLEX DNA (BK DNA)
7
ESAME COLTURALE PER MICOBATTERI
66
ES. BATTERIOSCOPICO MICOBATTERI
3
COLTURA CANDIDA SPP.
2
COLTURA CAMPYLOBACTER
4
CLOSTRIDIUM DIFFICILE TOSSINA A E/O B
0
Per gli utenti ambulatoriali tutto questo si traduce nella “data di ritiro” (o visualizzazione web) stampata sulla
ricevuta che viene consegnato dopo il prelievo o l’accettazione dei campioni biologici.
3
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 23 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
CLOSTRIDIUM DIFFICILE GDH ANTIGENE
0
COLTURA C.DIPHTERIAE / N.MENINGITIDIS
2
CLOSTRIDIUM DIFFICILE DNA
0
CELIACHIA TIPIZZAZIONE HLA
26
COPROCOLTURA PER ENTEROPATOGENI
3
RICERCA COLTURALE
3
CITOMEGALOVIRUS IGG AVIDITA'
1
CITOMEGALOVIRUS IGM TEST ELFA
1
CHLAMYDIA TRACHOMATIS DNA
6
ESAME COLTURALE SU MAT. LIQUIDI
6
ESAME COLTURALE
5
AGGLUT. CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS
0
COLTURA STREPTOCOCCO BETA EMOLITICO
3
COLT. SORV. CANDIDA (CANDIDA SCORE)
2
COLTURA DI SORVEGLIANZA
1
COPROCOLTURA PER SALMONELLA, SHIGELLA, CAMPYLOBACTER
3
COLTURA S.AUREUS
2
COLTURA YERSINIA ENTEROCOLITICA
5
CYTOMEGALOVIRUS PCR
2
VIRUS EPSTEIN BARR EA IGG
2
VIRUS EPSTEIN BARR EA IGM
2
EPSTEIN BARR VIRUS PCR
2
HIV P24 AG + HIV AB
1
EMOCOLTURA
8
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 24 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
EMOCOLTURA AEROBI - TEMPO DI POSITIVIZZAZIONE
2
EMOCOLTURA ANAEROBI - TEMPO DI POSITIVIZZAZIONE
2
ENTAMOEBA HISTOLYTICA/DISPAR AG
0
ENTEROVIRUS RICERCA BIOMOLECOLARE
6
ESAME COMPLETO FECI
0
ESAME FECI
0
ESAME BATTERIOLOGICO SECREZIONI BRONCHIALI
2
MTHFR C677T
13
FATTORE V (LEIDEN)
13
ANALISI MUTAZIONI / POLIMORFISMI: TROMBOFILIA E CVD
15
ANALISI MUTAZIONI / POLIMORFISMI TROMBOFILIA (PROFILO BASE)
9
FATTORE II (PROTROMBINA)
13
HBV GENOTIPO
19
HBSAG (METODICA ELFA)
HBV DNA
HCV RNA QUANTITATIVO
HCV GENOTIPO
HCV RNA QUALITATIVO
ANALISI MUTAZIONI / POLIMORFISMI: EMOCROMATOSI
0
11
4
10
4
18
HIV (AB / AG) TEST
0
HIV -1/2 TEST RAPIDO
0
HELICOBACTER PYLORI ANTIGENE
2
HPV DNA
HPV DNA TIPIZZAZIONE
10
6
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 25 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
HERPES SIMPLEX 1 DNA
2
HERPES SIMPLEX 2 DNA
7
INDICE DI COLONIZZAZIONE
2
CHLAMYDIA PNEUMONIAE DNA
2
LEGIONELLA PNEUMOPHILA DNA
3
MYCOPLASMA PNEUMONIAE DNA
2
ESAME MICROBIOLOGICO LIQUIDO CEFALORACHIDIANO
7
LEGIONELLA PNEUMOPHILA IGG
6
LEGIONELLA PNEUMOPHILA AG
0
LEGIONELLA ANTIGENE URINARIO
0
LEGIONELLA PNEUMOPHILA AB
6
LEGIONELLE ANTICORPI I.F. TITOLO
2
MALARIA TEST
0
COLTURA N.MENINGITIDIS
2
RICERCA MICETI
MTB COMPLEX PCR & RIFAMPICINA RESISTENZA
HBV MUTAZIONI
COLTURA MICOPLASMI UROGENITALI
IDENTIFICAZIONE MYCOB DA COLTURA
13
2
12
3
25
MTHFR A1298C
0
ESAME PARASSITOLOGICO
0
PARASITE PANEL EIA
0
PNEUMOCISTIS CARINII RICERCA DIRETTA
2
IGM ANTI AGENTI PNEUMOTROPI
4
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 26 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
PNEUMOCOCCO ANTIGENE
0
QUANTIFERON-NIL
15
QUANTIFERON-MIT
10
QUANTIFERON-TB GOLD
15
RSV PCR
21
ROSOLIA VIRUS AB
0
ROSOLIA VIRUS IGG AVIDITA'
2
SCOTCH TAPE TEST
0
COLTURA LIQUIDO SEMINALE
3
SANGUE OCCULTO FECI
0
RICERCA GONOCOCCO
3
TAMPONE FARINGEO
2
TOXOPLASMA IGA
1
TOXOPLASMA IGG AVIDITA'
1
TAMPONE URETRALE
3
URINOCOLTURA
1
COLTURA TAMPONE VAGINALE
3
VIRUS EPSTEIN BARR VCA IGM
1
VARICELLA ZOSTER VIRUS DNA
2
HBSAG QUANT
0
ANTI-HBS
0
ANTI-HBC
0
HBEAG
0
ANTI-HBE
0
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 27 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
HBC IGM
0
ANTI-HAV (IG TOTALI)
0
HAV IGM
0
HCV-AB EIA
1
HCV-AB ELFA
3
HCV ANTICORPI
0
TOXOPLASMA AB
0
ROSOLIA VIRUS IGG
3
HERPES SIMPLEX 1+2 AG
0
MORBILLO IGG
3
VARICELLA ZOSTER VIRUS IGG
3
VARICELLA ZOSTER VIRUS IGG
11
TREPONEMA PALLIDUM IG TOTALI
1
TREPONEMA PALLIDUM IG TOTALI
0
MONOTEST
0
TPHA
1
TPHA QUANTITATIVO
1
VDRL
1
SIERODIAGNOSI WEIL-FELIX
2
SIERODIAGNOSI WIDAL-WRIGHT
3
ECHINOTEST
4
CITOMEGALOVIRUS IGM TEST DI CONFRONTO
0
ROSOLIA IGM 'CATTURA' EIA
2
TOXOPLASMA IGM ('CATTURA' ELFA)
1
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 28 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
TREPONEMA PALLIDUM IGM
1
HCV IMMUNOBLOTTING (T.CONFERMA)
4
HIV 1-2 IMMUNOBLOTTING
3
HELICOBACTER PYLORI IGG IMMUNOBLOTTING
2
CITOMEGALOVIRUS ANTICORPI
0
CITOMEGALOVIRUS ANTICORPI
0
EPSTEIN BARR VIRUS ANTICORPI
0
HERPES SIMPLEX 1+2 AB
0
HERPES SIMPLEX 1/2 ANTICORPI
0
MORBILLO AB
2
PAROTITE AB
4
VARICELLA ZOSTER VIRUS AB
2
VARICELLA ZOSTER VIRUS AB
1
HDV AB
3
CHLAMYDIA ANTICORPI IFA
7
COXSACKIEVIRUS A AB
1
COXSACKIEVIRUS B AB
1
ECHOVIRUS PNEUMOTROPI AB
1
ECHOVIRUS NEUROTROPI AB
1
LISTERIA AB
1
INFLUENZAVIRUS A AB
3
INFLUENZAVIRUS B AB
3
PARAINFLUENZAVIRUS AB
5
RSV AB
2
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 29 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
ADENOVIRUS AB
2
ROTAVIRUS AG FECI
0
ADENOVIRUS AG FECI
0
NOROVIRUS AG FECI
0
LEISHMANIA IGG
4
RICKETTSIA CONORII IGG
5
RICKETTSIA CONORII IGM
5
BRUCELLA IGG
4
BRUCELLA IGM
4
CHLAMYDIA PNEUMONIAE IGM (EIA SCREEN)
2
COXIELLA BURNETII IGM (EIA SCREEN)
2
MYCOPLASMA PNEUMONIAE IGM (EIA SCREEN)
2
LEGIONELLA PNEUMOPHILA IGM (EIA SCREEN)
2
H.PYLORI IGG (ELFA)
1
SIER.WIDAL (SALMONELLA)
1
CHLAMYDIA TRACHOMATIS IGG
6
CHLAMYDIA TRACHOMATIS IGM
5
PARVOVIRUS B19 IGG
6
PARVOVIRUS B19 IGM
6
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 30 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Consultazione degli esami e ritiro dei referti
I referti di laboratorio, completi e validati con doppio controllo – prima da parte del TSLB poi del
medico o del biologo - sono firmati in modalità digitale4 e resi disponibili ai clinici (richieste interne) o
ai pazienti (richieste ambulatoriali).
Gli utenti interni (reparti) usano l’interfaccia “DNweb” per richiedere, consultare o ritirare i
referti di laboratorio. I pazienti esterni (ambulatoriali) possono ritirare i referti cartacei in ospedale,
dove hanno effettuato i prelievi, oppure usare il comodo “portale referti” (Internet), senza doversi
allontanare da casa e ottenendo una documentazione clinica valida a tutti gli effetti di legge.5 Per fruire
del servizio, occorre avere le credenziali di accesso (rilasciate al momento del prelievo) e collegarsi al
sito http://www.sanfilipponeri.roma.it/preferti/index.html. Attualmente, circa il 50% dei pazienti
ambulatoriali utilizza il servizio.
Entro la fine del 2014, inoltre, sarà possibile fruire della piattaforma di ritiro referti della Regione
Lazio.6
4
vedi “Agenzia per l’Italia Digitale” http://www.digitpa.gov.it/firme-elettroniche-certificatori.
È necessario un computer (o tablet o smartphone), una conessione Internet e una stampante se si desiderano i
documenti cartacei.
5
6
Progetto ESCAPE; https://iltuoreferto.regione.lazio.it/referto
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 31 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Come contattare il personale del laboratorio
UOC MV è composta dalle seguenti SEZIONI OPERATIVE
1. Batteriologia / micobatteriologia / micologia / parassitologia
tel. 06 3306 2650
2. Sierologia infettivologica
tel. 06 3306 2640
3. Biologia molecolare
tel. 06 3306 2651
L’ELENCO COMPLETO DEI RECAPITI TELEFONICI INTERNI DELLA UOC MV È RIPORTATO
NELL’ALLEGATO 2 DEL PRESENTE DOCUMENTO.
È attivo, nella fascia oraria 12-13 (lun.-sab., presso i i numeri indicati), il servizio di phone-consulting
(per avere informazioni sullo stato di avanzamento di colture, antibiogrammi, test
microbiologici/virologici in genere e per la richiesta di informazioni). SI CONSIGLIA DI FRUIRE DEL
SERVIZIO DI PHONE CONSULTING NELLA FASCIA ORARIA INDICATA.
PRESENZA ATTIVA DEL PERSONALE
La presenza attiva del personale TSLB è prevista nell’orario lun-sab (8-20) e domenica (8-14).
Al di fuori di questo orario, la presenza è legata alle chiamate in pronta disponibilità.
La presenza attiva di almeno 1 dirigente (biologo o medico) per turno (8-14; 14-20) è garantita
dal lunedì al sabato. Al di fuori di questo orario, la presenza è legata alle chiamate in pronta
disponibilità.
L’ELENCO COMPLETO DEGLI OPERATORI IN SERVIZIO DELLA UOC (status a dicembre 2013) È
RIPORTATO NELL’ALLEGATO 1 DEL PRESENTE DOCUMENTO.
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 32 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Osservatorio epidemiologico e attività scientifiche
Dal 2000, UOC MV lavora in stretta collaborazione con la Direzione Sanitaria e con la commissione per
il controllo delle infezioni ospedaliere (CIO) www.sanfilipponeri.roma.it/cio.
Report periodici su epidemiologia di microrganismi e resistenze antibiotiche vengono prodotti
per supportare interventi preventivi o regolare la terapia empirica. In laboratorio, è attivo un sistema
giornaliero di allerta su microrganismi sentinella e sospette epidemie di infezioni correlate
all’assistenza (ICA). Nel 2003 la Microbiologia, insieme con altre strutture dell’ospedale, è stata
onorata dall’assegnazione del "premio Regionale all'eccellenza in Sanit{ per il sistema di sorveglianza
attiva delle infezioni ospedaliere in area intensiva".
Dal 2007, l’UOC MV ha aderito al progetto pilota nazionale di sorveglianza basata sui dati di
laboratorio Micronet (CCM) http://micronet.cineca.it. Nel 2011, i dati di sorveglianza delle resistenze
microbiche del S. Filippo, raccolti attraverso il protocollo Micronet, fluiscono all’Istituto Superiore di
Sanità e, successivamente, al centro europeo delle malattie infettive ECDC (www.ecdc.europa.eu),
nell’ambito del progetto EARS-Net.
Dal 2010 al 2012 la struttura è stata individuata quale sede della sezione regionale di SIMPIOS
(www.simpios.org), la società scientifica italiana per lo studio e la prevenzione delle infezioni nelle
organizzazioni sanitarie.
Nell’ultimo triennio, UOC MV è stata coinvolta in studi e collaborazioni scientifiche con
l’Istituto Nazionale di Malattie Infettive “Lazzaro Spallanzani”, l’Universit{ di Roma Tor Vergata,
l’Istituto Superiore di Sanit{, l’Agenzia di Sanit{ Pubblica Lazio.
Attività formativa
UOC MV è sede di attivit{ formative nell’area biomedica, con particolare riferimento all’attivit{ teoricopratica del laboratorio clinico e alla sorveglianza delle infezioni correlate all’assistenza.
Sinteticamente, segue un elenco delle strutture che – negli ultimi cinque anni – hanno inviato studenti
e allievi in formazione, oppure per svolgere tesi di Laurea:
Università Cattolica del Sacro Cuore - Roma. Facoltà di Medicina e Chirurgia – Corsi paralleli di
Laurea (triennale) per TSLB.
Università Cattolica del Sacro Cuore - Roma. Facoltà di Medicina e Chirurgia – Corsi paralleli di
Laurea (triennale) in Infermieristica.
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 33 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
Università della Tuscia. Facoltà di Scienze di Mat.Fis.Nat. Corsi di Laurea (triennale e
specialistica) in Scienze Biologiche.
Università Roma Tre. Facoltà di Scienze di Mat.Fis.Nat. Corsi di Laurea (triennale) in Scienze
Biologiche.
Università la Sapienza - Roma. Facoltà di Farmacia. Scuola di Specializzazione in Farmacia
Ospedaliera.
Università la Sapienza - Roma. Facoltà di Medicina e Chirurgia – S.Andrea. Corsi di Laurea
(triennale) per TSLB.
Università la Sapienza - Roma. Facoltà di Medicina e Chirurgia. Scuola di Specializzazione in
Microbiologia e Virologia.
Istituto Tecnico Industriale “Enrico Fermi” – Roma.
UOC MV accoglie frequentemente – compatibilmente con gli spazi e l’organizzazione del laboratorio anche domande di tirocinio volontario, a fini professionalizzanti, da parte di biologi o medici
interessati alla microbiologia clinica.
Il personale della UOC MV anima e organizza regolarmente, da anni, progetti formativi
aziendali (ECM), incontri interdisciplinari e convegni sulle tematiche della best practice in
microbiologia clinica, sulla sorveglianza delle infezioni correlate all’assistenza e sull’appropriatezza
delle terapie antibiotiche.
Specificità e qualità del laboratorio (in 10 punti riassuntivi)
1. Antibiogramma: in automazione (Vitek 2) + eventuali integrazioni per misurare la MIC
puntuale (MIC-strip); adesione, da gennaio 2011, agli standard europei EUCAST; refertazione
“intelligente” per mascherare le molecole ad alto impatto economico/ecologico.
2. Emocolture: disponibilità di due stazioni Bactec 960; esecuzione
dell’antibiogramma diretto (rapido) mediante MIC-strip sui flaconi positivi.
di
routine
3. Identificazione microbica: disponibilità di tecnologia MALDI-TOF per l’identificazione
batterica e fungina in pochi minuti, sia su colonia isolata, sia su emocoltura positiva.
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 34 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
4. Informatizzazione: interfaccia web per richieste/referti; firma digitale certificata secondo
standard Agenzia Italia Digitale; portale web dei referti ambulatoriali.
5. Biologia molecolare: ampia sezione con sub-aree separate; identificazione di batteri e virus
anche in urgenza; disponibilità dei sistemi Taqman, Genexpert, Smart Cycler, Rotorgene,
Applied 7300, Innolipa.
6. Organizzazione: team mono-specialistico, dedicato da 15 anni alla patologia infettiva e con
significativa propensione alla collaborazione multidisciplinare e alla formazione. Attività di
laboratorio “DEA-compatibile” (operativit{ 12 ore, su 6 gg & pronta disponibilit{).
7. Osservatorio epidemiologico: disponibilità sistemi Mercurio e VigiGuard®, in grado di
interfacciarsi ai database sanitari e supportare la sorveglianza di infezioni correlate
all’assistenza, alert organism e resistenze antibiotiche; interfacciamento del laboratorio con la
rete nazionale di sorveglianza Micronet (CCM/ISS) e con il sistema europeo EARS-NET.
8. Qualità: lavorazione secondo procedure definite e scritte, anche per quanto riguarda gli aspetti
di sicurezza degli operatori; revisione periodica del manuale prelievi; controllo continuo delle
non conformità della fase pre-analitica; adesione pluriennale al programma internazionale di
controllo qualità esterno (VEQ) gestito da UK Neqas.
9. Sierologia virale e immunodiagnostica: in chemiluminescenza (nella quasi totalità), con
refertazione in giornata anche dei parametri “minori”; disponibilit{ anche di sistemi EIA, ELFA,
FC della microscopia a fluorescenza.
10. Strumentazioni e reagentario: acquisiti (da un decennio) mediante gare di service
regolarmente aggiornate.
5. ALLEGATI
1. Personale in servizio (2012) e profili professionali
2. Elenco telefonico del laboratorio per sezione.
7. CRITERI E TEMPISTICA DELLE REVISIONI DELLA CARTA
Le revisioni del documento saranno curate dalla UOC MV, in concomitanza con i cambiamenti
tecnologici e organizzativi che modifichino l’offerta dei servizi stessi.
ALLEGATO 1 - Personale in servizio (2013) della UOC Microbiologia Virologia
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 35 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
DIRIGENTI
EQUIPE TECNICA
Marcello Meledandri
[email protected]
(biologo; direttore del laboratorio)
Annunziata Tamburro
[email protected]
(coordinatore TSLB)
Milva Ballardini
[email protected]
(biologo; referente per la batteriologia, la
micobatteriologia
e
lo
studio
della
suscettibilità agli antimicrobici)
Simonetta Chiatti
(tecnico di laboratorio biomedico)
Marina Cattivelli
[email protected]
(medico; referente per la microbiologia clinica
e la diagnostica delle infezioni sessualmente
trasmesse)
Silvana Maiorano
[email protected]
(medico; referente per la diagnostica
microbiologico / virologica classica)
Maria Letizia Schiavone
[email protected]
(biologo; referente per la biologia molecolare)
Giuseppe Testa
[email protected]
(medico; referente per la
clinica)
Franca Chilese
(tecnico di laboratorio biomedico)
Barbara Ioppi
(tecnico di laboratorio biomedico)
Elvira de Marchis
(tecnico di laboratorio biomedico)
Isabella Giraldi
(tecnico di laboratorio biomedico)
Sabrina Girolami
(tecnico di laboratorio biomedico)
parassitologia
Viviana Proietti
(tecnico di laboratorio biomedico)
Stefania Tufani
(tecnico di laboratorio biomedico)
Mauro Mancini
(operatore tecnico)
ALLEGATO 2 – Elenco telefonico per sezione della UOC Microbiologia Virologia
Dipartimento di Scienze Radiologiche
e Medicina di Laboratorio
UOC Microbiologia e Virologia
Direttore: dott. Marcello Meledandri
00135 Roma, via G. Martinotti 20
tel./fax 06.3306.2314
[email protected]
www.sanfilipponeri.roma.it
Pagina 36 di 36
CARTA SERVIZI (2013) DELLA UOC MICROBIOLOGIA-VIROLOGIA
UOC MICROBIOLOGIA VIROLOGIA: N.TELEFONO ATTIVI al 31-12-2012
stanza
tel.
Batteriologia area semine
2933
Batteriologia area identificazione
2650
Emocolture
2934
Refertazione
2929
Sierologia
2640
Coordinatore tecnico
2224 anche fax
Direzione
2314 anche fax
Biologia molecolare
2651