Biologia e Biotecnologie

9-04-2014
Biologia e Biotecnologie
“Virtual Labs” di Biotecnologie Ricombinanti
GIORNO 1
!  METODICHE DI BASE:
! Laboratorio virtuale di “Estrazione del DNA”
! Laboratorio virtuale di “Elettroforesi del DNA”
! Laboratorio virtuale di “Reazione a catena della
polimerasi (PCR)”
! LABORATORIO VIRTUALE DI CLONAGGIO
! Preparazione del vettore e del DNA da clonare
! Trasformazione di batteri “competenti”
! Selezione delle colonie batteriche ricombinanti
! GIOCO: Clonare con un Click
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DNA extraction “virtual lab”
Gel Electrophoresis “virtual lab”
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PCR Virtual Labs
DNA Cloning “virtual lab”
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DNA Cloning “virtual lab” - II
Games: Clonaggio o clonazione ?
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I Potenti Mezzi della Postgenomica !
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“Virtual Labs” di Biotecnologie Ricombinanti
GIORNO 2
! IL GENOMA:
DNA fingerprinting Virtual Lab
! IL TRASCRITTOMA:
! DNA Microarray Virtual Lab
!  IL MICROBIOMA:
! Bacterial identification Virtual Lab
! Microbioma simulator
! GIOCO: Antibiotici contro batteri
Distribuzione di sequenze nel genoma
umano
Genoma Umano
3200 Mb
Geni e sequenze correlate
1200 Mb
Geni
48 Mb
Sequenze
correlate
1152 Mb
Pseudogeni
Frammenti genici
Introni, UTR
DNA intergenico
2000 Mb
Ripetizioni
intersperse
1400 Mb
LINE
640 Mb
SINE
420 Mb
Elementi LTR
250 Mb
Altre regioni
intergeniche
600 Mb
Microsatelliti
90 Mb
Varie
510 Mb
Trasposoni DNA
90 Mb
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I MICROSATELLITI
5’-GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA-3’
5’-TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT-3’
! 1 base 120.000
!  6 basi
49.000
! 2 basi
140.000
!  7 basi
27.000
! 3 basi
37.500
!  8 basi
35.500
! 4 basi
105.000
!  9 basi
27.500
! 5 basi
56.000
! 10 basi
27.500
DNA Fingerprinting Virtual Lab
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Microarrays a DNA consentono l’analisi dei “profili
di espressione” di tutti i geni del genoma umano
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DNA Microarray Virtual Lab
Un esempio di analisi del trascrittoma
Giovanna
D’Agostino
Mario
Coiro
Vincenzo
De Simone
Luisa
de
Magistris
Michele
Olivieri
Francesca
Bergantino
Francesco
Vuolo
Dipartimento di Medicina Molecolare
e Biotecnologie Mediche
Università di Napoli “Federico II”
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Bacterial Identification Virtual Lab
Microbioma Simulator
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Gioco: antibiotici contro batteri !
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Laboratorio di Biotecnologie Ricombinanti
GIORNO 3
!  ANALISI DEL DNA DEI PARTECIPANTI:
! Estrazione del DNA dalla mucosa orale
! Elettroforesi del DNA estratto
! Assemblaggio di una reazione di PCR
! ANALISI DEL DNA PLASMIDICO
! Digestione del DNA con enzimi di restrizione
! Elettroforesi del DNA digerito
! Analisi dei risultati
! GIOCO: Clonare con un Click
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