Curriculum - irccs crob

Katia Todoerti
Dati Personali:
Data e luogo di nascita: 27/11/1978, Casale Monf.to (AL), Italia
Cittadinanza: Italiana
Indirizzo Struttura: Laboratorio di Ricerca Pre-Clinica e Translazionale, IRCCS-CROB, Centro di
Riferimento Oncologico della Basilicata, Rionero in Vulture, (PZ).
Tel: +39-0972-726528
Email: [email protected]
Istruzione e Formazione:
2013: Principal Investigator del Progetto di Ricerca Giovani Ricercatori - Ricerca Finalizzata 2010
"Definizione della signature epigenetica nel Mieloma Multiplo mediante analisi ad alta risoluzione
del profilo di metilazione globale del DNA ed analisi integrata con alterazioni genomiche,
espressione genica e di microRNA", Destinatario Istituzionale Centro di Riferimento Oncologico di
Basilicata, selezionato per il finanziamento dal Ministero della Salute.
2006–2008: Ph.D. in Ematologia Sperimentale, Dipartimento di Scienze Mediche, Università degli
Studi di Milano, titolo della Tesi di Dottorato “Approccio genomico integrato nell’analisi
molecolare del Mieloma Multiplo”.
1997–2003: Corso di Laurea in Biotecnologie indirizzo Medico, Università degli Studi di Bologna; titolo
della Tesi di Laurea “Analisi funzionale delle proteine codificate dal gene WHSC1/MMSET, coinvolto nella
t(4;14) nel Mieloma Multiplo: reclutamento di molecole ad attività iston-deacetilasica” (110/110 con lode)
1996-1997: Diploma di maturità scientifica (60/60), Liceo Scientifico Statale “Leon Battista
Alberti” Valenza (AL).
Esperienze Professionali:
2013: Titolare di contratto in qualità di Principal Investigator di Progetto di Ricerca Giovani Ricercatori Ricerca Finalizzata 2010, Destinatario Istituzionale Laboratorio di Ricerca Pre-Clinica e Translazionale
Centro di Riferimento Oncologico di Basilicata, IRCCS-CROB, Rionero in Vulture (PZ).
2011-2012: Titolare di assegno di ricerca Post doc-di tipo A (rinnovo), Dip. Scienze Mediche, Università
degli Studi di Milano.
2009-2010: Titolare di assegno di ricerca Post doc-di tipo A, Dip. Scienze Mediche, Università degli Studi di
Milano.
2006-2008: Titolare di borsa di studio triennale FIRC.
2005: Titolare di borsa di studio annuale finanziata dall' Ospedale Maggiore Policlinico IRCCS di Milano.
2004: Titolare di borsa di studio annuale FIRC.
Attività Scientifica:
Tecniche di laboratorio e di analisi bioinformatica acquisite:
Colture cellulari: mantenimento in coltura di linee cellulari umane (293T, Hela, linee di MM);
transfezioni di DNA plasmidico in cellule in coltura adese (precipitazione del DNA con calciofosfato).
Analisi di attività trascrizionale: Sistemi di co-transfezione e analisi attività Luciferasica (Dual
Luciferase Reporter Assay – Promega).
Analisi di espressione di proteine: Estrazione di proteine; analisi in Western blotting. Purificazione
di anticorpi policlonali da siero mediante cromatografia d’affinità. Immunoprecipitazione. Analisi in
immunofluorescenza indiretta.
Clonaggio genico: PCR, RT-PCR; clonaggio di geni di interesse ( RT-PCR ) in vettori di
espressione; manipolazione di DNA plasmidico da procarioti; purificazione di DNA plasmidico in
gradiente di Cloruro di Cesio; analisi elettroforetica di DNA plasmidico su gel di agarosio.
Analisi di espressione genica, di microRNA e genomica con tecnologia microarray Affymetrix:
Purificazione di plasmacellule da campioni di pazienti con Mieloma Multiplo; estrazione e
purificazione di RNA; processazione dell’RNA e preparazione del target (cRNA marcato
frammentato) per ibridazione su arrays di espressione (GeneChip® HG-U133A, HG-U133 Plus 2.0,
Gene 1.0 ST, Exon 1.0 ST Array; GeneChip® miRNA Array); procedure di ibridazione, lavaggio,
marcatura e scansione degli arrays (Affymetrix). Processazione campioni DNA secondo protocollo
Affymetrix per ibridazione su SNP-array (GeneChip® Human Mapping 250K Nsp Array;
CytoScan™ HD Array); procedure di ibridazione, lavaggio, marcatura e scansione.
Tecniche di analisi di tipo bioinformatico: Analisi qualitativa degli array di espressione genica e di
miRNA, conversione in valori di espressione e normalizzazione dei dati di espressione (Affymetrix
Expression Console software; Affymetrix microRNA QC Tool software); analisi non supervisionate
di clustering gerarchico (dChip software); analisi supervisionate (Significant Analysis of
Microarrays, SAM software, RankProd R package); metanalisi (Prediction Analysis of Microarrays,
PAM software); Elementi di base del pacchetto Bioconductor (RMA); analisi di annotazione
funzionale (Affymetrix NetAffx, DAVID 6.7, IPA, TAM V2). Analisi qualitativa degli array di
genotipizzazione, acquisizione e analisi dei dati mediante software Affymetrix Chromosome
Analysis Suite.
Attività di Ricerca:
2013 presso Laboratorio di Ricerca Pre-Clinica e Translazionale Centro di Riferimento Oncologico di
Basilicata, IRCCS-CROB, Rionero in Vulture. Acquisizione di tecniche di analisi di espressione genica e di
metilazione globale su Piattaforma Illumina nell'ambito del Progetto Progetto di Ricerca Giovani Ricercatori.
2003-2012 presso O.U. Ematologia 1, Fondazione IRCCS Ca’ Granda Ospedale Maggiore Policlinico,
Dipartimento di Scienze Cliniche e di Comunità, Università degli Studi di Milano. Attività di ricerca
principalmente collegata a studi dei profili di espressione genica e di microRNA (Piattaforma Affymetrix),
riguardanti campioni di plasmacellule purificate da pazienti affetti da Mieloma Multiplo, allo scopo di
definire le caratteristiche trascrizionali e molecolari associate alla trasformazione maligna delle
plasmacellule e la progressione verso la forma più aggressiva di leucemia plasmacellulare. In numerosi
progetti di collaborazione con altri gruppi di ricerca, la stessa tecnologia microarray di indagine ad alta
risoluzione è stata applicata nella caratterizzazione molecolare delle cellule del microambiente midollare di
MM, quali le cellule endoteliali, mesenchimali ed osteoblasti, in relazione ad altre diverse neoplasie
ematologiche quali la Leucemia Linfatica Cronica, nello studio della risposta a farmaci su linee cellulari.
Acquisizione di tecniche di analisi genomica e genotipizzazione globale mediante microarray su Piattaforma
Affymetrix, nello studio del profilo di alterazioni genomiche globali acquisite nell'evoluzione del MM, a
seguito di trattamento farmacologico dei pazienti.
Lingue straniere:
INGLESE corrente, scritto e parlato.
(Autorizzo al trattamento dei dati personali ai sensi della legge 675/96)
Rionero in Vulture, 19 Luglio 2013
Dott. Katia Todoerti