Metaboliti secondari I METABOLITI SECONDARI rappresentano il differenziamento chimico di alcuni microrganismi, spesso coincidente con il loro differenziamento morfologico. Sono molecole insolite prodotte dal metabolismo secondario (tipico della fase stazionaria o idiofase) e non sono indispensabili, al punto che solo un numero limitato di classi di microrganismi sono in grado di produrli. Nel microrganismo produttore possono svolgere diversi ruoli quali: •Protezione da agenti fisici, •Mediatori del quorum sensing, •Mediatori nel differenziamento cellulare, e… • funzione antagonista rispetto ad altri organismi competitori! Le vie biosintetiche Metaboliti secondari ed antibiotici possono essere molecole molto complesse, per la sintesi è spesso richiesto l’intervento ordinato e sequenziale di numerosi enzimi. Cluster genici molto grandi (da 15 a 150 Kb), spesso associati a geni regolativi che controllano l’onset della produzione Sintesi di monomeri specializzati (reazioni di modificazione di metaboliti primari che possono fornire il prodotto finale o più spesso una unità che entra a far parte di una molecola più complessa) Reazioni di oligomerizzazione Reazioni di decorazione Diverse tipologie di monomeri specializzati (alcuni esempi) Precursori di antibiotici polichetidici (condensazione di acidi carbossilici) Precursori di antibiotici peptidici (condensazione di aminoacidi, spesso non proteici) Le vie biosintetiche Metaboliti secondari ed antibiotici possono essere molecole molto complesse, per la sintesi è spesso richiesto l’intervento ordinato e sequenziale di numerosi enzimi. Cluster genici molto grandi (da 15 a 150 Kb), spesso associati a geni regolativi che controllano l’onset della produzione Sintesi di monomeri specializzati (reazioni di modificazione di metaboliti primari che possono fornire il prodotto finale o più spesso una unità che entra a far parte di una molecola più complessa) Reazioni di oligomerizzazione (reazioni di assemblaggiodi metaboliti primari e secondari. Quattro classi di metaboliti secondari ottenibili: polichetidi, peptidi, oligosaccaridi e isoprenoidi) Reazioni di decorazione (reazioni che aggiungono una serie di gruppi funzionali alla molecola.Sono spesso determinanti per l’attività biologica del prodotto maturo) Metaboliti secondari da Steptomyces • antibiotici come: streptomicina, cloranfenicolo, tetraciclina • Immunosoppressori come:rapamicina • Antifungali come: amofotericina e nistatina • Antitumorali come: daunorubicina • ecc… Da altri attinomiceti: • rifamicina e vancomicina (Amycolatopsis) • eritromicina e l’insetticida spinosina (Saccharopolyspora) • gentamicina e l’antitumorale dienamicina (Micromonospora) Da funghi filamentosi: • penicilline (Penicillium) • Cefalosporine da (Cephalosporium) Antibiotici DEFINIZIONE DI ANTIBIOTICO Per antibiotico si intende una molecola naturale, metabolita secondario di Eubatteri, Actinomiceti e Funghi inferiori Differiscono da altri composti ad azione antimicrobica (es. tossine) per le loro proprietà di bassa tossicità per l’uomo e per gli animali Discovery of penicillin 1928 Picture of Penicillium notatum Alexander Fleming 6 August 1881 – 11 March 1955 Howard Walter Florey (1898-1968) Ernst Boris Chain (1906-1979) Discovery of terapeutic effects of penicillin 1945 - Nobel Prize in Physiology or Medicine “for the discovery of penicillin and its therapeutic effects” Sir Alexander Fleming Sir Ernst Boris Chain Baron Howard Walter Florey penicillin production at the Sir William Dunn School of Pathology Oxford, England, 1940 A poster from World War Two ANTIBIOTICI • ALTA TOSSICITA’ SELETTIVA tossicità selettiva per i batteri – battericidi (uccidono i batteri) – batteriostatici (inibizione della crescita) • BASSA TOSSICITA’ RESIDUA tossicità nulla o scarsa per il paziente INDICE TERAPEUTICO = dose tossica/dose terapeutica 1 Bersagli degli antibiotici 2 5 3 4 Classificazione:Meccanismo d’azione Beta-lattamici: Glicopeptidi: BLOCCO DELLA SINTESI PEPTIDOGLICANO “ “ Tetracicline: Aminoglicosidici: Macrolidi: INIBIZIONE DELLA SINTESI PROTEICA “ “ “ “ “ “ “ “ Fluorochinolonici: Rifampicine: INTERFERENZA CON LA FUNZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI “ “ “ “ Sulfamidici: ANTIMETABOLITI Classificazione: struttura Beta-lattamici Glicopeptidi Aminoglicoside Macrolide Peptide Ansamicine Macrolide polienico Produzione mondiale di antibiotici Spettro d’azione degli antibiotici Antibiotici Beta-Lattamici Penicilline e Cefalosporine Anello Tiazolidinico PENICILLINA NATURALE Benzilpenicillina o PenG Attiva su Gram+, sensibile alle -lattamasi PENICILLINE SEMISINTETICHE Meticillina Stabile in ambiente acido, resistente alle -lattamasi Oxacillina Stabile in ambiente acido, resistente alle -lattamasi Ampicillina Ampio spettro di attività (specialmente contro batteri Gram-), stabile in ambiente acido, resistente alle -lattamasi Carbenicillina Ampio spettro di attività (specialmente contro Pseudomonas aeruginosa), stabile in ambiente acido ma inefficiente per via orale, sensibile alle -lattamasi CEFALOSPORINE Gram + Gram P. aeruginosa Anaerobi Il monomero del Peptidoglicano NAM= N-Acetil muramico NAG= N-Acetil glucosoammina, Struttura del peptidoglicano GRAM+ Staphylococcus aureus GRAME. coli Meccanismo d’azione dei beta-lattamici Bersaglio molecolare: Transpeptidasi, enzima che interviene nella formazione dei legami crociati del PEPTIDOGLICANO METODI INNOVATIVI PER LA RICERCA DI NUOVE MOLECOLE AD AZIONE ANTIBIOTICA Esempi di screening: ricerca di una molecola antibiotica in grado di inibire la biosintesi degli acidi grassi FAS, fatty acid synthase Nei procarioti, complesso multienzimatico Negli eucarioti, proteina multidominio Ricerca di inibitori di FabF/H Costruzione di uno strain di Staphylococcus aureus fabF AS RNA. E’ 4-8 volte più sensibile alla tiolattomicina del wt mentre è ugualmente sensibile agli altri antibiotici Esempi di screening: ricerca di una molecola antibiotica in grado di inibire la biosintesi degli acidi grassi Ricerca di inibitori di FabF/H Costruzione di uno strain di Staphylococcus aureus fabF AS RNA. E’ 4-8 volte più sensibile alla tiolattomicina del wt mentre è ugualmente sensibile agli altri antibiotici Library: circa 250.000 estratti microbici ottenuti da colture di attinomiceti e funghi Isolato da un ceppo di Streptomyces plantensis