IL CICLO DI KREBS pag. 1 IL CICLO DI KREBS = CICLO DEGLI ACIDI TRICARBOSSILICI = CICLO DELL’ACIDO CITRICO Il ciclo di Krebs è costituito da una serie di 8 reazioni Si compie nella matrice mitocondriale E’ una via metabolica anfibolica (partecipa sia a processi catabolici che anabolici) pag. 2 IL CICLO DI KREBS = CICLO DEGLI ACIDI TRICARBOSSILICI = CICLO DELL’ACIDO CITRICO Il ciclo di Krebs è anche detto ciclo degli acidi tricarbossilici o ciclo dell'acido citrico. E’ un ciclo metabolico di importanza fondamentale in tutte le cellule aerobie (ovvero che utilizzano ossigeno nel processo della respirazione cellulare). Il ciclo di Krebs è l'anello di congiunzione delle vie metaboliche responsabili della degradazione (catabolismo) dei carboidrati, dei grassi e delle proteine in anidride carbonica e acqua con la formazione di energia chimica. Il ciclo di Krebs fornisce inoltre anche molti precursori per la produzione di alcuni amminoacidi quali α-chetoglutarato e ossalacetato pag. 3 pag. 4 pag. 5 IL CICLO DI KREBS = CICLO DEGLI ACIDI TRICARBOSSILICI = CICLO DELL’ACIDO CITRICO Il ciclo è deputato alla demolizione di acetil-CoA in CO2 Quattro delle reazioni che lo compongono sono catalizzate da ossido-reduttasi tre delle quali sono NAD-dipendenti e una è FAD-dipendente Le quattro reazioni di ossido-riduzione producono: 3 NADH + H+ e 1 FADH2 la cui riossidazione darà luogo in catena respiratoria alla sintesi di 11 ATP 1 NADH riossidato 3 ATP 1 FADH2 riossidato 2 ATP pag. 6 IL CICLO DI KREBS = CICLO DEGLI ACIDI TRICARBOSSILICI = CICLO DELL’ACIDO CITRICO Il ciclo di Krebs produce direttamente “a livello del substrato” una molecola di GTP, che successivamente viene trasformato in ATP Il bilancio totale della demolizione di 1 acetil-CoA è quindi di: 12 ATP pag. 7 CICLO DI KREBS Per ogni ciclo si ha: Acetyl-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 3 H2O ---> ---> 3 NADH + H+ +FADH2 + CoA-SH + GTP + 2 CO2 pag. 8 CICLO DI KREBS Il ciclo di Krebs è funzionale alla fosforilazione ossidativa (catena di trasporto di elettroni) L'una non avrebbe senso senza l'altra La respirazione cellulare estrae energia da NADH e FADH2, producendo NAD+ e FAD, che tornano al ciclo di Krebs sostenendolo. Il ciclo di Krebs non usa ossigeno, che è invece utilizzato nella fosforilazione ossidativa. pag. 9 pag. 10 Reazione 1: citrato sintasi La citrato sintasi catalizza la condensazione di ossalacetato con acetil-CoA ad ottenere citrato. pag. 11 Reazione 2: aconitasi La aconitasi catalizza la isomerizzazione del citrato ad isocitrato attraverso la formazione di cis-aconitato. La reazione è reversibile. pag. 12 Reazione 3: isocitrato deidrogenasi I fase: l'enzima catalizza l'ossidazione dell'isocitrato ad ossalsuccinato, che genera una molecola di NADH a partire da NAD+ II fase: decarbossilazione che porta alla formazione di α-chetoglutarato pag. 13 Reazione 4: α-chetoglutarato deidrogenasi diidrolipoamide succiniltransferasi La α-chetoglutarato deidrogenasi (più correttamente ossoglutarato deidrogenasi) catalizza la decarbossilazione ossidativa dell'α-chetoglutarato che porta alla formazione del tioestere ad alta energia succinil CoA pag. 14 La α-chetoglutarato deidrogenasi è un complesso enzimatico composto di tre polipeptidi: E1, E2 , E3 La subunità E1 : 2-chetoglutarato deidrogenasi La subunità E2 : diidrolipoamide succiniltransferasi La subunità E3 : diidrolipoil deidrogenasi 29 Aprile 2005 Autore: Professoressa Carla Bovina pag. 15 pag. 16 Reazione 5: succinil-CoA sintetasi La catalizza la formazione di succinato a partire dal tioestere ad alta energia succinil-CoA L'energia proveniente dal tioestere viene utilizzata per fosforilare il nucleoside difosfato purinico GDP pag. 17 Reazione 6: succinato deidrogenasi La succinato deidrogenasi (complesso II della catena respiratoria) è un complesso enzimatico situato nella matrice della membrana mitocondriale interna, che catalizza la reazione: succinato + FAD (ubichinone) ⇄ fumarato + FADH2 ubichinolo pag. 18 Reazione 6: succinato deidrogenasi È l'unico enzima del ciclo di Krebs ad essere legato ad una membrana Tale posizione è funzionale al coinvolgimento dell'enzima nella catena di trasporto degli elettroni (complesso II). Gli elettroni passati sul FAD vengono dunque immessi direttamente nella catena, grazie al legame covalente tra l'enzima e FAD pag. 19 Reazione 7: fumarasi La fumarasi catalizza l'aggiunta in trans al fumarato di un H+ e di un gruppo OH- provenienti da una molecola d'acqua con formazione di Lmalato pag. 20 Reazione 8: malato deidrogenasi L'ultima reazione del ciclo catalizzata dalla malato deidrogenasi consiste nell'ossidazione del malato ad ossalacetato La reazione utilizza una molecola di NAD+ come accettore di idrogeno producendo NADH pag. 21 CICLO DI KREBS Stadio Enzima 1 2 3 4 5 6 7 8 Citrato sintetasi Aconitasi Isocitrato deidrogenasi a-Ketoglutarato deidrogenasi complesso Succinil-CoA sintetasi Succinato deidrogenasi Fumarasi Malato deidrogenasi DG°' (kJ/mol) -32.2 +6.3 -20.9 -33.5 -2.9 0.0 -3.8 +29.7 pag. 22 UNA REAZIONE DI “RIEMPIMENTO” piruvato carbossilasi Piruvato + CO2 + ATP ossalacetato + ADP + Pi Il ciclo di Krebs è una via anfibolica e cioè rappresenta la tappa terminale del catabolismo (carboidrati, trigliceridi, aminoacidi), ma fornisce anche intermedi per la biosintesi di svariate biomolecole (aminoacidi, porfirine). Quando la concentrazione degli intermedi diminuisce, e cioè essi sono sottratti per attuare processi di sintesi, esistono reazioni di “riempimento” cioè di rinforzo ad esempio della concentrazione di ossalacetato, con rinforzo conseguente della concentrazione degli altri intermedi del ciclo. L’acetil-CoA, sempre in alta concentrazione (derivante dal catabolismo di carboidrati ed acidi grassi) non si accumulerà ma troverà, in condizioni normali, molecole di ossalacetato disponibili per la sintesi di citrato. pag. 23 LA REGOLAZIONE DEL CICLO DI KREBS INIBITORI PIRUVATO ATTIVATORE ATP Ca2+ NADH ACETIL-CoA ossalacetato citrato La sua concentrazione è il fattore principale succinato per la sintesi del citrato alfa-chetoglutarato ATTIVATORE ADP pag. 24