Testi del Syllabus

Testi del Syllabus
Resp. Did.
DATO Serena
Anno offerta:
2014/2015
Insegnamento:
27002163 - GENOMICA
Corso di studio:
0734 - BIOLOGIA
Matricola: 006033
Anno regolamento: 2013
CFU:
6
Settore:
BIO/18
Tipo Attività:
B - Caratterizzante
Anno corso:
2
Periodo:
Secondo Semestre
Sede:
UNIVERSITA' DELLA CALABRIA
Testi in italiano
Tipo testo
Testo
Lingua insegnamento
italiano
Contenuti
Introduzione al corso. Definizione di “Genomica”. Scopi e ambiti di studio
della genomica. Banche dati in
genomica. Genomica strutturale. Mappatura dei genomi. Sequenziamento
del genoma umano e di organismi
modello. Tecniche di sequenziamento. Assemblaggio. Identificazione ed
annotazione genica. Organizzazione dei
genomi eucariotici. Sequenze ripetute nei genomi. DNA satellite.
Pseudogeni. Genetica del DNA mitocondriale.
Genomica funzionale. Funzionamento dei genomi. Trascrittomi e
Proteomi. Analisi dell’espressione genica mediante
SAGE, PCR quantitativa, microarray. Meccanismi di controllo
dell’espressione genica. Principi di epigenomica.
Studio della variabilità del genoma umano. Polimorfismi a singolo
nucleotide (SNPs). Identificazione e metodi di
genotipizzazione degli SNPs. Varianti strutturali della sequenza del
genoma. Metodi di caratterizzazione dei CNVs.
Genomica comparata. Organismi modello. Evoluzione dei geni e dei
genomi. Cluster di geni conservati. Mappe di
sintenia.
Testi di riferimento
Genomi 3- Brown T.- Ed. EDISES; Introduzione alla Genomica - Gibson G,
Muse S - Ed. Zanichelli
Obiettivi formativi
Conoscenza della struttura, funzionamento e regolazione del
genoma umano e dei principali genomi sequenziati di organismi modello
in genetica, del trascrittoma e del proteoma,
in un’ottica integrata di biologia dei sistemi.
Metodi didattici
Lezioni frontali
Tipo testo
Testo
Modalità di verifica
dell'apprendimento
Esame scritto e orale
Testi in inglese
Tipo testo
Testo
Lingua insegnamento
Italian
Contenuti
Introduction. Definition of "Genomics." Aims and fields of study of
genomics. Genomic databases. Structural
Genomics. Genome mapping . Sequencing of the human genoma and
model organisms’. Sequencing Technologies.
Assembly. Identification and gene annotation. Organization of the
eukaryotic genomes. Repeated sequences in the
genomes. Dna satellite. Pseudogenes. Genetics of mitochondrial.
Functional Genomics. Functioning of the genomes.
Transcriptome and proteome. Analysis of the gene expression by SAGE,
quantitative PCR, microarray. Mechanisms
of control of the gene expression. Principles of epigenomics. Study of the
variability of the human genome. Single
nucleotide polymorphisms (SNPs). Methods for SNP identification and
genotyping. of the SNPs. Structural variants of the genomics sequence
(Copy Number Variations). Characterization of CNVs. Compared
Genomics. Model
organisms. Evoluion of genes and genomes. Cluster of conserved genes.
Sintenic maps.
Testi di riferimento
Genomi 3- Brown T.- Ed. EDISES; Introduzione alla Genomica - Gibson G,
Muse S - Ed. Zanichelli
Obiettivi formativi
Learning of structure, functioning and regulation of human genome and
main sequenced genomes from experimental
organisms in genetics, of transcriptome and proteome, with a view to
system biology.
Metodi didattici
Front
Modalità di verifica
dell'apprendimento
Written and oral examination