Una breve presentazione della nostra esperienza “Esercizi di Genotipizzazione” presso i laboratori Fondazione Rita-Levi-Montalcini, nell’ambito del progetto Genetica e DNA-Bioform 12 aprile 2012 PROGETTO BIOFORM 2012 PRESENTAZIONE Dopo un lavoro di approfondimento su alcune tematiche di Genetica necessario per una preparazione adeguata alla esercitazione del 12 aprile 2012 presso la Fondazione Rita-Levi-Montalcini, siamo pronti per iniziare l’esperienza. L’esperienza consiste nell’esaminare l’inserzione Alu nel locus PV92, sul cromosoma 16. Vi sono due varianti con o senza Alu e quindi tre possibili genotipi nel locus PV92 : omozigoti + + eterozigoti + ‐ omozigoti ‐ ‐ Alcuni momenti delle varie fasi sperimentali. La determinazione del genotipo PV92 viene effettuata applicando la tecnica della PCR (Polymerase Chain Reaction). Con questa tecnica, si amplifica milioni di volte uno specifico frammento di DNA genomico, così riusciamo ad isolarlo dal suo contesto. Possiamo distinguere gli alleli + e ‐, differenti per grandezza, grazie all’elettroforesi su gel di agarosio. Questa tecnica analitica e separativa è basata sul movimento di particelle elettricamente cariche immerse in un fluido per effetto di un campo elettrico. Maggiore è la massa del frammento, minore sarà la mobilità. L’individuazione del genotipo sara’ possibile in base al differente peso del DNA, quello contenente Alu PV92 sara più pesante e quindi in ritardo rispetto agli altri. Il primo pozzetto contiene un marker (MK) a peso molecolare noto; gli altri (1 – 22) contengono il DNA di ogni singolo studente. Dalla nostra analisi abbiamo ottenuto i seguenti risultati: Peano-Monterotondo Nome Scuola Data esperimento Studenti studente 1 studente 2 studente 3 studente 4 studente 5 studente 6 studente 7 studente 8 studente 9 studente 10 studente 11 studente 12 studente 13 studente 14 studente 15 studente 16 studente 17 studente 18 studente 19 studente 20 studente 21 studente 22 Totale studenti 30 12/04/12 Reazione riuscita? Allele + (presenza di ALU nel locus PV92) Allele (Assenza di ALU nel locus PV92) Omozigote -/- Omozigote +/+ Eterozigote +/- e -/+ si si si si si si si si si 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 si 0 2 1 0 0 si 1 1 0 0 1 si 1 1 0 0 1 si 0 2 1 0 0 si 0 2 1 0 0 no 0 0 0 no 0 0 0 si 0 2 1 0 0 si 0 2 1 0 0 si 0 2 1 0 0 si 1 1 0 0 1 si 1 1 0 0 1 si 1 1 0 0 1 Totale omozigoti +/+ Totale eterozigoti -/+ e +/- 0 9 Totale Totale Totale alleli Totale alleli omozigoti Studenti + /con rezione riuscita 9 31 11 20 percentuale percentuale percentuale percentuale percentuale omozigoti - omozigoti eterozigoti alleli + alleli /+/+ +/- e -/+ 23% 78% 55% 0% 45% Note percentuali di alleli nella classe 23% 78% percentuale alleli + percentuale alleli - Percentuali di omozigoti ed eterozigoti nella classe 45% 55% percentuale omozigoti -/- percentuale omozigoti +/+ percentuale eterozigoti +/- e -/+ La discussione finale ci ha ulteriormente aiutato a chiarire i nostri dubbi e curiosità inerenti al lavoro svolto. Abbiamo infine ricevuto degli attestati di partecipazione Un ringraziamento alla nostra Scuola che ci ha permesso questa interessante esperienza!