Programma_2007_BioAppl

Programma 2007
vedere anche lezione 1-2 del 5 – 3 – 2007
il programma definitivo corrisponderà alla materia delle lezioni ed alle informazioni aggiuntive
messe sul sito web della didattica del corso di Biologia Applicata
finalità della Biologia Applicata (materia tecnica per lo studio della Biologia sperimentale)
applicazioni di metodologie per lo studio della genetica e funzioni cellulari : struttura e funzione
metodo sperimentale, uso dei controlli adeguati
cercare sequenze di DNA in banca dati: per analogia, per funzione, per specie e fila, per identità
banche dati per categorie: genomiche, EST, cDNA,
uso di parole chiave
Refresh Southern – Northern – Sonde
clonaggio librerie genomiche e di cDNA
genomica funzionale esperimenti olistici
vettori e plasmidi : da pBR322 a pBluescript SK fagemidi
pSV40
interference
vettori per interference RNA
trasfezione efficienza di trasfezione metodi virali chimici ed elettrici
dimostrazione che RNA interference è enzimatica
immunoprecipitazione
PCR, metodi e applicazioni (differenze Southern/ Northern/ PCR )
RT-PCR analisi della trascrizione, scelta primers, descrivere l’amplicone
coding sequence e cDNA strand + e strand quantitativa Real time Light cycler FRET e Taqman
controlli positivi, negativi, rischio contaminazione
RACE 5’ e 3’ ignoti (a partire da cloni EST)
nested PCR
clonaggio dei prodotti PCR
primers con le code
Competitiva
Analis SNPS
AFLPs adattatori con sito di restriz steaky, inneschi a 3 basi selettivi
eletroforesi su acrilamide e capillare
PCR inversa
PCR multiplex
Sistema Cre-Lox fago P1 sito lox core 8bp + 13 mer x 2 dyad palindrome
interferenza condizionale (cre-lox) con green fl.prot.
geni pleiotropici intervengono su più funzioni e possono essere mortali nello sviluppo
topi transgenici
iniezione nella blastocisti : DNA o clellule staminali ES
ricombinazione omologa controllo della integrazione
topi transgenici mutanti condizionali
costruzione geni floxed
topi che esprimono CRE per incroci con topi floxed
approccio olistico sistema victr 3 e victr 20
gene trapping