scritto2008_5

BIOINFORMATICA – Esame scritto del 18 Settembre 2008
Nome e Cognome: ______________________________
1) Il Protein Data Bank: Descrizione ed utilizzo
2) Metodi euristici di allineamento multiplo
3) Metodi euristici di ricerca in database di sequenze
4) Quale database NON contiene sequenze nucleotidiche?
a) EMBL
b) TrEMBL
c) DDBJ
d) Genbank
5) Data la sequenza di un contig, come identifico i tratti corrispondenti agli esoni?
a) PSI-BLAST contro database proteico
b) BLASTN contro database di EST
c) BLASTN contro database genomico
6) L’analisi linguistica di sequenze genomiche permette di
a) identificare siti di splicing
b) identificare mutazioni puntiformi
c) identificare sequenze ripetute
7) La matrice BLOSUM45
a) contiene valori di probabilità di sostituzione tra coppie di aminoacidi in
blocchi di 45 sequenze ortologhe
b) contiene valori di probabilità di sostituzione tra coppie di aminoacidi in
blocchi di sequenze con il 45% di identità
c) contiene valori di probabilità di sostituzione tra coppie di aminoacidi in
sequenze omologhe divergenti per il 45% inteso come frequenza di
mutazione