Struttura 3D del lisozima HEW

LISOZIMA
Principali meccanismi di assistenza ala
m
catalisi enzimatica
•
•
•
•
•
•
Catalisi acido-base
C t li i covalente
Catalisi
l t
Catalisi da ioni metallici
Catalisi elettrostatica
Catalisi da effetti di prossimita’/orientam.
prossimita /orientam.
Catalisi per legame preferenziale dello
stato di transizione
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Diagramma schematico dell’involucro cellulare in (a)
gram-positive
r m p sitiv bacteria
b ct ri ; (b) gram-negative
r m n
tiv b
bacteria.
ct ri
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e 507
Il polisaccaride alternato NAG–NAM β(1Æ4) componente la
parete cellulare.
cellulare
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Struttura schematica del peptidoglicano.
(Gly)5
(Gly)5
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Struttura schematica del peptidoglicano
componente la parete cellulare in S. aureus.
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e 507
Struttura primaria del lisozima HEW
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e 509
Struttura 3D del lisozima HEW
Struttura 3D del lisozima HEW
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e 509
(kin 9)
(kin_9)
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e 508
Velocita’ di idrolisi di alcuni oligosaccaridi,
catalizzate da Lisozima HEW
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e 509
Struttura 3D del lisozima HEW in complesso con
NAG3 e in presenza di 3 unita’ NAG modellate (D, E,
F)
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e 510
Interazioni osservate/modellate tra lisozima e
substrato
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e 513
Mappatura delle energie libere di legame per i
sottositi del lisozima HEW
+
-
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e 510
Conformazioni a sedia e semi-sedia per un anello a 6
atomi
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e 511
Meccanismo catalizzato da H+ per l’idrolisi di un
acetale ad emiacetale
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e 512
Il meccanismo “classico” (Phillips) per la reazione
catalizzata da Lisozima (v. anim_fig 34 Cap.15)
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e 512
L’intermedio ione-ossonio e’ stabilizzato da risonanza.
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e 513
L’analogo δ-lattone di (NAG)4.
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e 515
Intermedio covalente (glicosil-enzima) osservato per il
lisozima HEW.
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e 504
Esigenze di prossimita’ e orientamento in
una reazione
i
SUPEROSSIDO
DISMUTASI
Cu-Zn
Superossido dismutasi
Enzima detossificante dal radicale
superossido. Lavora in tandem con la
catalasi.
Mutazioni del gene SOD1 sono associate al
20% di casi di FALS.
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e 480
Values of KM, kcat, and kcat/KM for Some Enzymes and
Substrates.
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e 481
Cross section through the active site of human superoxide
dismutase (SOD).
Regolazione dell’attivita’
enzimatica
i
i
• Necessita’
Necessita di risposta a stimoli ambientali
• Processi di crescita e differenziamento
• Coordinamento tra distretti metabolici
• ... SI REALIZZA ATTRAVERSO:
• Regolazione della disponibilita’ degli enzimi
(induzione della sintesi/degradazione)
• Controllo dell’attivita’ catalitica tramite transizioni
allosteriche (conformazionali)