Scarica la presentazione - regione campania

Laboratorio Fitopatologico
Regione Campania
Organizzazione
Presentazione del personale
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Responsabile del Laboratorio: Paola Spigno
Sezione di batteriologia: Agronomo Daniela Benchi
Sezione di entomologiae acarologia: Benchi – Spigno
Sezione di malerbologia: Agronomo Giuseppe D’Auria
Sezione di micologia: Agronomo Paola Spigno
Sezione nematologia: Biologo Maria Fantini
Sezione virologia: Agronomo Gennaro Cennamo
Tecnico di laboratorio: Chimico Vincenzo Morrone
Tecnico di laboratorio: P. chimico Alfredo De Blasio
Amministrativo: sig.ra Silvana Cardinale
Gestione serra: Viridia Srl
Arrivo campione
ƒ Accettazione dei campioni vegetali e di
terreno
ƒ Valutazione della conformità alla
procedura interna
ƒ Codificazione e inserimento dati sul
programma informatico
Valutazione tecnica
ƒ Valutazione sintomatologica
ƒ Assegnazione dei sottocampioni alle
sezioni di analisi
ƒ Attribuizione delle priorità (codice bianco,
verde e rosso)
Sezioni di analisi
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Virologia,
Nematologia,
Micologia,
Batteriologia,
Entomologia e acarologia,
Malerbologia,
Sezione di Virologia: procedura
1. Studio dei dati riportati nella scheda di
accompagnamento,
2. Esame dei sintomi e relativa foto,
3. Ipotesi di diagnosi,
4. Prescrizioni esami analitici.
Sezione di Virologia: sistemi di analisi
1. analisi delle avversità (virus e viroidi) riportate nella
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normativa fitosanitaria con protocolli ufficiali mediante
sistemi di estrazione e di identificazione con metodi:
Polimerase chain reaction (PCR) diretta e nested,
Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA),
test biologici su piante indicatrici;
2. Analisi delle comuni avversità con protocolli presenti in
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bibliografia mediante sistemi di estrazione e di
identificazione con metodi:
Polimerase chain reaction (PCR) diretta e nested,
Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA),
test biologici su piante indicatrici;
Sezione di Virologia:
formulazione della diagnosi
ƒ Interpretazione dei risultati in conformità
con i dati in possesso
ƒ Invio dei risultati all’elaborazione del
referto
Sezione nematologia: procedura
1.
2.
3.
4.
Analisi dati scheda di accompagnamento,
Esame dei sintomi sul vegetale e relativa foto,
Ipotesi di diagnosi,
Prescrizioni esami analitici.
Sezione nematologia: sistemi di analisi
ƒ analisi delle avversità riportate nella normativa
fitosanitaria attraverso protocolli ufficiali
mediante estrazioni dei parassiti da vegetali e
da terreno e valutazione morfologica e
morfometrica con eventuale foto al microscopio;
ƒ analisi delle avversità comuni attraverso
protocolli riportati in bibliografia mediante
estrazioni dei parassiti dalle piante e da terreno
e valutazione morfologica e morfometrica con
eventuale foto al microscopio;
Sezione nematologia: formulazione della
diagnosi
ƒ Interpretazione dei risultati in conformità
con i dati in possesso,
ƒ Invio dei risultati all’elaborazione del
referto.
Sezione di micologia: procedura
1.
2.
3.
4.
Analisi dati scheda di accompagnamento,
Esame dei sintomi e relativa foto,
Ipotesi di diagnosi,
Prescrizioni esami analitici
Sezione di micologia: sistemi di analisi
1. analisi delle avversità riportate nella normativa
fitosanitaria con protocolli ufficiali mediante
inoculazione e identificazione attraverso la
valutazione morfologica e morfometrica, PCR
test biologici su piante indicatrici;
2. Analisi delle comuni avversità con protocolli
presenti in bibliografia mediante inoculazione e
identificazione attraverso la valutazione
morfologica e morfometrica, test biologici su
piante indicatrici;
Sezione micologia: formulazione della diagnosi
ƒ Interpretazione dei risultati in conformità
con i dati in possesso,
ƒ Eventuale foto al microscopio;
ƒ Invio dei risultati all’elaborazione del
referto.
Sezione di batteriologia: procedura
1.
2.
3.
4.
Analisi dati scheda di accompagnamento
Esame dei sintomi e relativa foto
Ipotesi di diagnosi
Prescrizioni esami analitici
Sezione di batteriologia: sistemi di analisi
1. analisi delle avversità (batteri e fitoplasmi) riportate
nella normativa fitosanitaria con protocolli ufficiali
mediante :
ƒ Immunofluorescenza,
ƒ Inucolazione su terreni selettivi
ƒ Polimerase chain reaction (PCR) diretta e nested,
ƒ Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA),
ƒ test biologici su piante indicatrici;
2. Analisi delle comuni avversità (batteri e fitoplasmi) con
protocolli presenti in bibliografia mediante inoculazione
su terreni selettivi, test biochimici e biologici su piante
indicatrici;
Sezione batteriologia: formulazione della diagnosi
ƒ Interpretazione dei risultati in conformità
con i dati in possesso;
ƒ Invio dei risultati all’elaborazione del
referto.
Sezione di acarologia e entomologia: sistemi
di analisi
Osservazione allo stereomicroscopio del
parassita e valutazione morfologica e
morfometrica, foto dei particolari.
Sezione di acarologia ed entomologia: procedura
1.
2.
3.
4.
Analisi dati scheda di accompagnamento,
Esame dei sintomi e, relativa foto
Ipotesi di diagnosi,
Prescrizioni esami analitici.
Sezione acarologia ed entomologia:
formulazione della diagnosi
ƒ Interpretazione dei risultati in conformità
con i dati in possesso;
ƒ Invio dei risultati all’elaborazione del
referto.
Problematica fitosanitaria di interesse
straordinario
ƒ Su campioni sospetti per la presenza di
organismi di lotta obbligatoria e/o di
quarantena, mai rinvenuti sul nostro
territorio, si inviano ai laboratori nazionali
di riferimento per la conferma delle analisi,
ƒ Su campioni sospetti per la presenza di
organismi mai rinvenuti sul nostro territorio
si inviano a: Facoltà di Agraria o CNR IPP
o CRA PAV.
Sezione malerbologia
ƒ E’ stata da poco istituita con due
obiettivi:
1. Costruire uno schedario delle erbe
“aliene” previste dal D.Lgs. n. 214 del
29/08/2005 e schede EPPO;
2. Costruire uno schedario per l’archivio
delle Erbe Infestanti monocotiledoni e
dicotiledoni presenti comunemente sul
nostro territorio;
Elaborazione del referto
ƒ Il referto, elaborato grazie ad un programma informatico,
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contiene dati su:
Campione,
provenienza,
azienda,
tecnico prelevatore
sintomatologia manifestata,
tipologia di analisi effettuata,
metodi impiegati,
diagnosi,
profilassi e/o terapia secondo le indicazione dei
disciplinari di difesa integrata.
Metodologie strumentali
1. Studio dei protocolli di biologia molecolare,
2.
3.
4.
delle tecniche sierologiche, dei test biologici in
sinergia con le Istituzioni di ricerca;
Ricerca di protocolli innovativi;
Elaborazione dei protocolli,
Invio dei risultati dei test alle relative sezioni.
Metodologie strumentali
ƒ
1.
2.
3.
Gestione delle attività svolte in serra:
Innesto su erbacee,
Saggi biologici,
Prove sperimentali,
Elaborazione di protocolli in:
ƒ Microscopia,
ƒ Microbiologia,
ƒ Sierologia,
ƒ Biologia molecolare.
Strumentazioni presenti
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Microscopi Polivar, Leica e Nikon a fluorescenza;
Stereomicroscopi Leica e Nikon;
Kappe: chimica, a flusso laminare, per biologia molecolare;
Autoclave,
bidistillatore
Bagnomaria;
Centrifughe a diverse velocità, accessoriate e/o refrigerate;
Frigoriferi standard,
Congelatori a -20°C e –80°C;
Stufe e incubatori;
Cella fito-climatica,
Lavavetreria e macchina del ghiaccio;
Contenitori per azoto liquido;
Spettrofotometri: per test sierologici e per Biologia molecolare;
Camere per elettroforesi orizzontale e verticale;
PCR……..ecc
Thermomixer
Thermocycler
analisi specifiche per la ricerca di
organismi di Quarantena o misure
supplementari nel 2008- 2009
positivi
organismo
2008
Citrus tristeza virus vivaio
253
334
Citrus tristeza virus campo
220
137
Plum pox virus vivaio
112
114
Plum pox virus campo
153
Pepino mosaic virus vivaio
199
142
Potato spindle tuber viroid
vivaio
128
227
Phytophthora ramorum vivaio
64
60
Ceratocystis fimbriata f.s. platani 32
Colletotrichum acutatum pre
trapianto
11
56
18
2009
296
45
15
Flavescenza dorata vivaio
97
Nematodi in vivaio
183
positivi
68
19
Sorveglianza generale ANNO 2008
analisi effettuate
ƒ Nematologia
ƒ Micologia
ƒ Batteriologia
ƒ Virologia
ƒ Entomologia
ƒ Fitoplasmi
ƒ Tot
103
246
111
873
54
7
1394
Sorveglianza generale ANNO
2009 analisi effettuate
ƒ Nematologia
ƒ Micologia
ƒ Batteriologia
ƒ Virologia
ƒ Entomologia
ƒ Fitoplasmi
ƒ Tot
190
291
143
388
140
0
1152
analisi 2009
385
fitoplasmi
723
1541
miceti
batteri
insetti
747
974
154
nematodi
virus
analisi 2008
139
fitoplasmi
708
miceti
1952
batteri
566
556
68
insetti
nematodi
virus