CURRICULUM VITAE Dr. Antonio Piralla INFORMAZIONI PERSONALI Nome Nazionalità Data di nascita Piralla Antonio Italiana 25/08/1980 ESPERIENZA LAVORATIVA • da luglio 2011 • 2008-2011 • 2006-2008 • 2005-2006 • 2003-2005 Contratto di collaborazione coordinata e continuativa presso la struttura complessa di Virologia e Microbiologia della Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo, via Taramelli 5, 27100, Pavia Borsa di studio sul tema ”le infezioni respiratorie di origine virale nei pazienti ricoverati” presso il Servizio di Virologia (responsabile Prof. G.Gerna), Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo, via Taramelli 5, 27100, Pavia. Contratto di collaborazione coordinata e continuativa presso il Servizio di Virologia (responsabile Prof. G.Gerna), Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo, via Taramelli 5, 27100, Pavia Attività di ricerca a titolo volontario presso il Servizio di Virologia, Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo di Pavia (responsabile Prof. G.Gerna). Internato biennale di laurea presso il Servizio di Virologia, Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo di Pavia (responsabile Prof. G.Gerna). ISTRUZIONE E FORMAZIONE Corso di perfezionamento in bioinformatica applicata all’evoluzione molecolare e filogenesi degli agenti infettivi presso l’Università degli studi di Milano. Corso avanzato di Metodi Statistici in Epidemiologia. Istituto Superiore di Sanità (Roma). Specialità in Microbiologia e Virologia presso l’Università degli Studi di Pavia. Votazione finale 108/110. Partecipazione al “14th International Bioinformatics workshop on virus evolution and molecular epidemiology”, corso avanzato. Città del Capo (Sudafrica). Partecipazione al “12th International Bioinformatics workshop on virus evolution and molecular epidemiology”, corso base. Atene (Grecia). Abilitazione all’esercizio della professione di Biologo. Laurea in Scienze Biologiche presso l’Università degli Studi di Pavia. Tesi sperimentale “Circolazione dei virus respiratori in pazienti pediatrici ricoverati nel triennio 2001-2004”. Votazione finale 99/110. Diploma di Maturità Scientifica, ITI Cobianchi di Verbania, 83/100. • 2012 • 2009 • 2009 • 2008 • 2006 • 2006 • 2005 • 1999 Pagina 1 - Curriculum vitae di [ PIRALLA, Antonio ] Principali materie /abilità professionali VIROLOGIA CLINICA E DI LABORATORIO, BIOINFORMATICA, STATISTICA. Attività di diagnostica e di ricerca in virologia. Particolare esperienza nello studio delle infezioni respiratorie causate da virus nei pazienti pediatrici e trapiantati. Conoscenze di base in diagnostica batteriologica, parassitologica e micologica. Particolare esperienza nelle tecniche di biologia molecolare per l’identificazione e la quantificazione dei genomi virali (PCR, RT-PCR, real-time), disegno e messa a punto di metodiche di PCR, RT-PCR, real-time e sequenziamento con metodo sanger e di next generation sequencing (GS junior; Roche). Applicazione delle tecniche di sequenziamento per tipizzare le specie virali mediante analisi filogenetiche. Analisi di evoluzione molecolare dei virus. Particolare esperienza nell’analisi statistica e del trattamento dei dati sperimentali. Nell’ambito della batteriologia: Disegno e sviluppo di sistemi quantitativi per l’identificazione dei genomi batterici (Mycoplasma Pneumoniae e Chalmydhopila Pneumoniae). Sviluppo di un sistema di tipizzazione della specie per tutti i batteri mediante sequenziamento dell’rRNA 16s batterico. Sequenziamento gene bla per la conferma della produzione di Carbapenemasi in ceppi di Klebisiella Pneumoniae. Autore e co-autore di 36 lavori scientifici pubblicati su riviste internazionali indicizzate (vedi elenco) e di oltre 40 comunicazioni a congressi nazionali ed internazionali. Attività di revisore di articoli scientifici per riviste scientifiche internazionali (Emerging Infectious Diseases, http://wwwnc.cdc.gov/eid/pages/reviewers.htm e Journal of Clinical Virology). MADRELINGUA ITALIANO ALTRE LINGUA INGLESE • Capacità di lettura • Capacità di scrittura • Capacità di espressione orale CAPACITÀ E COMPETENZE TECNICHE Con computer, attrezzature specifiche, macchinari, ecc. buono buono buono Competenze informatiche nell’utilizzo di software: Word, Excel, Powerpoint, Acces, Filemaker, Per analisi di filogenesi: Paup, Mega, Phylip, Bioedit, Treepuzzle, Per studio evoluzione molecolare dei virus: HYPHY, Beast. Per primers design: FastPCR, PrimerSelect Per analisi statistiche: Prism (Graphpad version 3,4, o 5), Stat, Origin, Epi-info, NCSS-PASS Per analisi densitometriche su gel: GelDoc Competenze nell’utilizzo di apparecchiature per biologia molecolare: - termociclatore ABI 9600 ABI 9700, sequenziatore 3100 Applied Biosystem, Bio-rad GelDoc 2000, Bio-rad 200-300, Bio-rad 1000, spettrofotometro, Hereaus Biofuge fresco, microscopio ottico, GS Junior (Roche). Pagina 2 - Curriculum vitae di [ PIRALLA, Antonio ] ELENCO PUBBLICAZIONI 1. Gerna G, Percivalle E, Sarasini A, Campanini G, Piralla A, Rovida F, Genini E, Marchi A, Baldanti F. Human respiratory coronavirus HKU1 vs other coronavirus infections in italian hospitalized patients. J Clin Virol 2007;38:244-250. (IF2007 3,468). 2. Gerna G, Piralla A, Campanini G, Marchi A, Stronati M, Rovida F. The human bocavirus role in acute respiratory tract infections of pediatric patients as defined by viral load quantification. New Microbiologica 2007;30:383-392. (IF2007 0,956) 3. Gerna G, Campanini G, Rognoni V, Marchi A, Rovida F, Piralla A, Percivalle E. Correlation of viral load as determined by real-time RT-PCR and clinical characteristics of respiratory syncytial virus lower respiratory tract infections in early infancy. J Clin Virol 2008;41:45-48. (IF2008 3,32) 4. Revello MG, Campanini G, Piralla A, Furione M, Percivalle E, Zavattoni M, Gerna G. Molecular epidemiology of primary human cytomegalovirus infection in pregnant women and their families. J Med Virol 2008;80:1415-1425. (IF2008 2,576) 5. Percivalle E, Rovida F, Piralla A, Rognoni V, Zavattoni M, Baldanti F, Marchi A, Gerna G. Rapid typing, subtyping and RNA quantification of influenza virus type A strains in respiratory secretion. New Microbiologica 2008;31:319-327. (IF2008 0,912) 6. Piralla A, Percivalle E, Di Cesare-Merlone A, Locatelli F, Gerna G. Multicluster nosocomial outbreak of parainfluenza virus type 3 infection in a pediatric oncohematology unit: a phylogentic study. Haematologica 2009;94:833-839. (IF2009 6,416) 7. Piralla A, Rovida F, Campanini G, Rognoni V, Marchi A, Locatelli F, Gerna G. Clinical Severity and molecular typing of human rhinovirus C strains during a fall outbreak affecting hospitalized patients. J Clin Virol 2009;45:311-317. (IF2009 3,124) 8. Gerna G, Piralla A, Rovida F, Rognoni V, Marchi A, Locatelli F, Meloni F. Correlation of rhinovirus load in the respiratory tract and clinical symptoms in hospitalized immunocompetent and immunocompromised patients. J Med Virol 2009;81:14981507. (IF2009 2,470) 9. Gerna G, Percivalle E, Piralla A, Rognoni V, Marchi A, Baldanti F. Surveillance of influenza virus B circulation in northern Italy: summer-fall 2008 isolation of three strains and phylogenetic analysis. New Microbiologica 2009;32:399-404.(IF2009 0,974) 10. Campanini G, Piralla A, Rovida F, Puzzelli S, Facchini M, Locatelli F, MinoliI L, Percivalle E, Donatelli I, Baldanti F, and Surveillance Group for New Influenza A/H1N1v investigation in Italy. First case in Italy of acquired resistance to oseltamivir in an immunocompromised patient with influenza A/H1N1v infection. J Clin Virol 2010;48:220-222. (IF2010 4,023) 11. Piralla A., Rovida F., Baldanti F., Gerna G.. Enterovirus genotype EV-104 in Humans, Italy 2008-2009. Emerg Infect Dis 2010;16:1018-1021. (IF2010 6,859) 12. Revello MG, Genini E, Gorini G, Klersy C, Piralla A, Gerna G. Comparative evaluation of eight commercial human citomegalovirus IgG avidity assays. J Clin Virol 2010;48:255-259. (IF2010 4,023) 13. Campanini G, Piralla A, Paolucci S, Rovida F, Percivalle E, Maga G, Baldanti F. Genetic divergence of influenza A NS1 gene in 2009 pandemic H1N1v isolates with respect to H1N1 and H3N2 isolates from previous seasonal epidemics. Virology J 2010;7:209. (IF2010 2,546) 14. Baldanti F, Campanini G, Piralla A, Rovida F, Braschi A, Mojoli F, Iotti G, Belliato M, Conaldi P, Arcadipane A, Pariani E, Zanetti A, Minoli L, Emmi V. Severe outcome of influenza A/H1N1/09v infection associated with 222G/N polymorphisms in the haemagglutinin: a multicenter study. Clin Microbiol Infect 2011;17:1166-1169 (IF2011 4,540) 15. Rovida F, Percivalle, Campanini G, Piralla A, Novati S, Muscatello A, Baldanti F. Viremic dengue virus infection in travellers: potential for local outbreak in Northern Italy. J Clin Virol 2011;50:76-79. (IF2011 3,969). 16. Piralla A, BaldantiI F. Gerna G. Phylogenetic patterns of human respiratory picornavirus species, including the newly identified group C rhinoviruses, during one-year surveillance of a hospitalized patient population in Italy. J Clin Microbiol 2011;49:373-376 (IF 2010 4,153) 17. Piralla A, Paolucci S, Gulminetti R, Comolli G, Baldantri F. HIV integrase variability and genetic barrier in antiretroviral naive and experienced patients. Virology J 2011;8:149. (IF 2010 2,343) 18. Pariani E, Piralla A, Frati E, Anselmi G, Campanini G, Rovida F, Percivalle E, Amendola A, Baldanti F, Zanetti A. Early cocirculation of different clades of influenza A/H1N1v pandemic virus in Northern Italy. J Prev Med Hyg 2011;52:17-20. 19. Esposito S, Daleno C, Tagliabue C, Scala A, Tenconi R, Borzani I, Fossali E, Pelucchi C, Piralla A, Principi N. Impact of rhinoviruses on pediatric community-acquired pneumonia. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2012;31:1637-1645. (IF2011 2,859) 20. Piralla A, Pariani E, Rovida F, Campanini G, Muzzi A, Emmi V, Iotti G, Pesenti A, Conaldi PG, Zanetti A, Baldanti F and the Severe Influenza A Task Force. Segregation of Virulent Influenza A(H1N1) Variants in the Lower Respiratory Tract of Critically Ill Patients During the 2010-2011 Seasonal Epidemic. PLoS One 2011;6:e28332. Epub 2011 Dec 14. (IF 2010 4,411) Pagina 3 - Curriculum vitae di [ PIRALLA, Antonio ] 21. Piralla A, Lilleri D, Sarasini A, Marchi A, Zecca M, Stronati M, Gerna G, Baldanti F. Human rhinovirus and human respiratory enterovirus (EV68 and EV104) infections in hospitalized patients in Italy, 2008-2009. Diagn Microb Infect Dis 2012;73:162-167. (IF2011 2,528) 22. Piralla A, Furione M, Rovida F, Marchi A, Stronati M, Gerna G, and Baldanti F. Human parechovirus infections in patients admitted to hospital in Northern Italy, 2008-2010. J Med Virol 2012; 84:686-690. (IF2011 2,820) 23. Paolucci S. Piralla A, Zanello C, Minoli L, Baldanti F. Xenotropic and polytropic murine leukemia virus-related sequences are not detected in the majority of patients with chronic fatigue syndrome. New Microbiologica 2012; 35(3):341-344. (IF2011 1,000) 24. Selleri M, Piralla A, Rozera G, Giombini E, Bartolini B, Abbate I, Campanini G, Rovida F, Dossena L, Capobianchi MR, Baldanti F. Ultra-deep detection of hemagglutinin 222 polymorphisms in influenza A(H1N1)pdm09-infected patients. Clin Microb Infect in press DOI:10.1111/j.1469-0691.2012.03984.x (IF2011 4,540) 25. Daleno C, Piralla A, Scala A, Baldanti F, Usonis V, Principi N, Esposito S. Complete genome sequence of a novel human enterovirus c (HEV-C117) identified in a child with community-acquired pneumonia. J Virol 2012;86(19):10888-10889. (IF2011 5,402) 26. Piralla A, Daleno C,Pariani E, Conaldi PG, Esposito S, Zanetti A, Baldanti F. Quantification of influenza A virus in clinical sample based on cycle threshold value: a useful ready quantification tool. J Clin Virol 2012 Oct 16. doi:ppi S13866532(12)00358-7. 10.1016/j.jcv.2012.09.011. (IF2011 3,969) 27. Daleno C, Piralla A, Usonis V, Scala A, Ivaskevicius R, Baldanti F, Principi N, Esposito S. Novel Human Enterovirus C Infection in Child with Community-Acquired. Emerg Infect Dis 2012;18(11):1913-1915. (IF2011 6,169) 28. Paolucci S, Fiorina L, Piralla A, Gulminetti R, Novati S, Barbarini G, Sacchi P, Gatti M, Dossena L, Baldanti F. Naturally occurring mutations to HCV protease inhibitors in treatment-naïve patients. Virol J 2012 9(1):245. (IF2011 2,343). 29. Rovida F, Campanini G, Sarasini A, Adzasehoun KMG, Piralla A, Baldanti F. Comparison of immunologic and molecular assays for the diagnosis of gastrointestinal viral infections. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013 Jan;75(1):110-1 (IF2011 2,528) 30. Zehender G, Pariani E, Piralla A, Lai A, Gabanelli E, Ranghiero A, Ebranati E, Amendola A, Campanini G, Rovida F, Ciccozzi M, Galli M, Baldanti F, Zanetti A. Reconstruction of evolutionary dynamics of the A(H1N1)pdm09 influenza virus in Italy during the pandemic and post-pandemic phase. PLoS One 2012; 7(11):e47517 Epub 2012 Nov 9 (IF2011 4,092) 31. Ciccocioppo R, Bernardo ME, Russo ML, Vanoli A, Franco C, Martinetti M, Catenacci L, Giorgiani G, Zecca M, Piralla A, Baldanti F, Locatelli F, Corazza G. Hematopietic stem cell transplantation restores gluten tolerance in celiac disease. Journal of Pediatric Gastroenterology & Nutrition: 18 October 2012; doi: 10.1097/MPG.0b013e318276a6a7 (IF2011 2,298) 32. Daleno C, Greenberg D, Piralla A, Scala A, Baldanti F, Principi N, Esposito S. A novel human enterovirus C (EV-C118) indentified in two children hospitalised because of acute otitis media and community-acquired pneumonia in Israel. J Clin Virol. 2013 56(2):159-62. (IF2011 3,969) 33. Renna S, Bergamino L, Pirlo D, Rossi A, Furione M, Piralla A, Mascaretti M, Cristina E, Marazzi MG, Di Pietro P. A case of nenonatal human parechovirus encephalitis with a favorable outcome. Brain Dev. 2013 Jan 18 DOI: 10.1016/j.braindev.2012.12.006 (IF2011 ) 34. Daleno C, Piralla A, Scala A, Baldanti F, Greenberg D, Principi N, Esposito S. Full genome sequence of a novel human enterovirus C (HEV-C118) isolated from two children with acute otitis media and community-acquired pneumonia in Israel. Genome Announc. 2013 Jan;1(1). doi:pii: e00121-12. 10.1128/genomeA.00121-12. 35. Piralla A, Pariani E, Campanini G, Rovida F, Ranghiero A, Fiorina L, Amendola A, Zanetti A, Baldanti F. Multiple clusters of A(H1N1)pdm09 circulating in severe cases of influenza during the 2010-2011 season: a phylogenetic and molecular analysis of the neuraminidase gene. J Med Virol 2013 (in press). 36. Piralla A, Daleno C, Scala A, Greenberg D, Usonis V, Principi N, Baldanti F, Esposito S for the CAP-PRI Study Group. Genome characterization of enterovirus 117 and 118: a new group within human enterovirus species C. PLoS ONE 2013 (in press). Pagina 4 - Curriculum vitae di [ PIRALLA, Antonio ]