L22_AA2013-14_Biochimica_Lezione1

Università degli Studi Kore di Enna
Facoltà di Scienze dell’Uomo e della Società
CdL in “Scienze delle attività motorie e sportive”
AA 2013-2014
Biochimica
Domenico Ciavardelli - Ph.D.
email: [email protected]
AA 2013-2014
Biochimica-Lezione 1
Domenico Ciavardelli
Biochimica: dettagli
•36 ore
•Orario di Ricevimento:
Mercoledì 11,30 – 13,30 e giovedì 11,30 – 13,30,
Studio Docenti presso il Plesso di Psicologia; da
• Contatti:
concordare via e-mail.
[email protected]
•In ogni e-mail dovrete specificare nell’oggetto il corso
di laurea e indicare nome, cognome e recapito
telefonico!
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Biochimica-Lezione 1
Domenico Ciavardelli
Biochimica: libri di testo
Antonio Di Giulio, Amelia Fiorilli e Claudio Stefanelli
Biochimica per le Scienze Motorie,
prima edizione edizione
(Casa Editrice Ambrosiana, 2011)
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Biochimica-Lezione 1
Domenico Ciavardelli
Biochimica: libri di testo
+
Michele Samaja,
Massimo Stefani e Niccolò Taddei,
Chimica, Biochimica e Biologia Applicata, Corso di Biochimica per le Lauree Sanitarie,
seconda edizione (Piccin Nuova Libraria, 2007)
seconda edizione (Zanichelli, 2008)
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Biochimica-Lezione 1
Domenico Ciavardelli
Biochimica: programma
Struttura delle
lezioni frontali
N. ore
Contenuti
5
Introduzione alla Biochimica:
3
Molecole organiche: descrizione della struttura e delle proprietà chimico fisiche dei
acqua, soluzioni e loro proprietà; equilibri chimici;
acidi e basi: definizione; significato biologico del pH e delle sue variazioni.
principali gruppi funzionali (idrocarburi alifatici e aromatici; alcoli, tioli e ammine; aldeidi e
chetoni; acidi carbossilici e derivati anidridici, esterei e ammidici; tioesteri; derivati dell’acido
fosforico).
4
Struttura e
biomolecole:
proprietà
chimico-fisiche
delle
principali
carboidrati (il legame glicosidico; monosaccaridi, oligo- e polisaccaridi);
lipidi (legami estereo e fosfoestereo; trigliceridi, fosfolipidi, colesterolo e colesterilesteri);
acidi ribonucleici e deossiribonucleici (doppia elica, legame fosfodiestereo
e
interazione tra basi puriniche e pirimidiniche);
proteine (amminoacidi: proprietà chimico-fisiche e classificazione sulla base della catena
laterale; legame ammidico; struttura primaria, secondaria, terziaria e quaternaria delle proteine,
avvolgimento casuale; denaturazione: effetto della temperatura e del pH; proteine fibrose:
actina, miosina e collagene; proteine globulari: mioglobina ed emoglobina; affinità per
l’ossigeno: descrizione della curva di saturazione; definizione di allosterismo; effettori
allosterici positivi e negativi dell’emoglobina; emoglobina e pH ematico: regolazione e potere
tampone).
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Biochimica-Lezione 1
Domenico Ciavardelli
Struttura
delle lezioni
frontali
N. ore
5
Contenuti
Introduzione al metabolismo:
anabolismo e catabolismo.
Cenni di termodinamica; definizione di processo endoergonico ed esoergonico e variazione di energia libera di Gibbs; diagrammi
dell’energia: definizione di energia di attivazione, stato di transizione e intermedio di reazione.
Introduzione al catabolismo ossidativo:
reazioni di ossidoriduzione e differenza di potenziale normale di riduzione; relazione tra G° e E°.
Cenni di cinetica e catalisi.
Enzimi: classificazione, definizione di cofattore e coenzima, catalisi enzimatica, costante di Michaelis-Menten e regolazione
(inibizione diretta, indiretta, retroinibizione).
Bioenergetica: molecole ad alta energia (adenosina 5’-trifosfato, tioesteri; fosfocreatina): accoppiamento di reazioni e calcolo di
G° e E° per il processo complessivo.
Membrana cellulare: potenziale elettrochimico di membrana, osmosi e diffusione, trasporto passivo facilitato e trasporto attivo.
16
Metabolismo dei carboidrati:
digestione dei polisaccaridi: biodisponibilità; assorbimento intestinale del glucosio; prima fase della respirazione cellulare:
trasformazione del glucosio in piruvato e bilancio energetico; il destino anaerobico del piruvato: fermentazione omolattica e
fermentazione alcolica; destino aerobico del piruvato: il mitocondrio, ciclo di Krebs e bilancio energetico, reazioni anaplerotiche;
catena di tarsporto degli elettroni e fosforilazione ossidativa: ipotesi chemiosmotica e calcolo della resa energetica; glicogeno,
glicogenolisi e glicogenosintesi: descrizione, cenni sulla regolazione ormonale, modificazioni concertate di glicogenosintasi e
glicogenofosforilasi; gluconeogenesi: descrizione, cenni sulla regolazione ormonale e regolazione concertata di glicolisi e
gluconeogenesi; ciclo di Cori.
Metabolismo dei lipidi:
digestione dei lipidi: ruolo dei sali biliari, assorbimento intestinale, trasporto e complessi lipoproteici; il tessuto adiposo: cenni sulla
regolazione ormonale; beta-ossidazione e bilancio energetico; cenni sulla biosintesi degli acidi grassi; integrazione di catabolismo
glucidico e lipidico; corpi chetonici.
Metabolismo delle proteine:
digestione delle proteine ed enzimi proteolitici; transaminazione e deaminazione ossidativa: ruolo di glutammato, glutammina e
alanina; ciclo dell’urea ed integrazione con il ciclo di Krebs; amminoacidi gluconeogenici e chetogenici; ciclo glucosio-alanina;
cenni sulla biosintesi delle proteine.
3
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Elementi di Biochimica d’organo e di tessuto: integrazione del metabolismo glucidico, lipidico eBiochimica-Lezione
proteico in fegato e muscolo. 1
Adattamenti metabolici all’attività motoria.
Domenico Ciavardelli
E’ previsto che lo studente conosca i seguenti argomenti:
• Modello atomico e definizione di orbitale.
•Costruzione delle configurazioni elettroniche degli
elementi dei primi 3 periodi.
•Ibridazione del carbonio.
•Proprietà periodiche della materia ed elettronegatività.
•Definizione di valenza e numero di ossidazione.
•Legame: legame covalente puro, legame covalente polare,
legame dativo, legame ionico.
Tali argomenti sono stati trattati durante i CORSI DI
ORIENTAMENTO.
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Biochimica: metodi di valutazione
•L’esame prevede una prova scritta e una prova orale.
• L’ammissione alla prova orale è
CONDIZIONATA
dal superamento della prova scritta.
•La prova scritta prevede 15 domande a risposta multipla e 5
quesiti a risposta aperta.
•La valutazione minima per l’ammissione alla prova orale è di
15 punti su 30 complessivi.
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Perché Biochimica?
Biochimica
Fisiologia
Anatomia
“Human physiology is the science of the mechanical,
physical, and biochemical functions of humans, their
organs, and the cells of which they are composed.”
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Lezione 1:
Introduzione alla Biochimica
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
:

:
Vettore momento di dipolo, 
L’acqua è una molecola polare
χO-H = 1,3
Doppietti elettronici non condivisi dell’ossigeno
Ricordare che la configurazione elettronica dell’ossigeno è:
O:[He] 2s2 2p4
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Domenico Ciavardelli
Polarità e solubilità
Interazioni con il solvente.
Classificazione in base alla solubilita’:
•Sostanze idrofile: solubili in acqua (polarita’ maggiore).
Es: proteine citoplasmatiche, carboidrati, acidi nucleici.
•Sostanze lipofile o Idrofobe: scarsamente solubili in acqua, solubili in solventi
organici poco polari (polarita’ minore).
Es: lipidi, proteine di membrana.
•In generale
“ simile scioglie simile”.
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Interazioni Intermolecolari (Forze di Van der Waals).
Sono legami più deboli rispetto ai legami INTRAMOLECOLARI (covalente, ionico, dativo)
•Legame di idrogeno: interazione elettrostatica tra N, O, X e un atomo di idrogeno legato a O, N, X.
•Legame ione-dipolo: interazione elettrostatica tra una specie carica e una molecola polare.
•Interazioni Dipolo-Dipolo o dipolo-dipolo idotto: interazione elettrostatica tra dipoli (due molecole polari o
una molecola polare ed una apolare in cui viene GENERATO un momento di dipolo).
•Forze di dispersione (LONDON): interazione elettrostatica tra dipoli temporanei generati IN DUE
MOLECOLE APOLARI dalla repulsine tra le NUBI ELETTRONICHE (orbitali molecolari).
•OSS.: nel caso di MACROMOLECOLE come molte biomolecole tali interazioni potranno essere anche
intramolecolari.
Legame d’idrogeno
0.177nm
Legame covalente
0.0965nm
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Domenico Ciavardelli
Gross L., Mohn F., Moll N., Liljeroth P., Meyer G. “The chemical structure of a molecule
resolved by Atomic Force Microscopy” Science, 2009; 325: 11110-1114.
http://cen.acs.org/articles/87/i35/Molecules-Atoms-Bonds-Visualized.html
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Domenico Ciavardelli
SOLVATAZIONE degli ioni e stabilizzazione in soluzione acquosa
 I composti IONICI (ELETTROLITI) sono di solito molto
solubili in acqua (interazione ione-dipolo).
Ione Na+ solvatato
Ione Cl- solvatato
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Domenico Ciavardelli
Biomolecole polari, anfotere, lipofile
(forma ionica a pH=7)
Polari
Glucosio
Glicina
Gruppi polari
Gruppi lipofili
Molto solubili in acqua.
Aspartato
Lattato
Glicerolo
Lipofile
Esteri (Cere)
Solubili in solventi apolari.
Anfotere
Fenilalanina
Fosfatidilcolina
Molecole
amfipatiche
(contenenti
contemporaneamente gruppi polari e
apolari)
sono
i
DETERGENTI
comunemente utilizzati per solubilizzare
in acqua sostanze apolari.
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Domenico Ciavardelli
La solubilità ed in generale le proprietà chimico-fisiche delle
molecole organiche e quindi delle biomolecole dipendono dai
GRUPPI FUNZIONALI che le caratterizzano.
I GRUPPI FUNZIONALI sono insiemi di specifici atomi legati
e disposti nello spazio in modo definito.
I GRUPPI FUNZIONALI permettono la classificazione dei
composti organici.
Molte biomolecole sono caratterizzate da più di un gruppo
funzionale e quindi presentano le proprietà chimico fisiche di
diverse classi di composti organici.
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Biochimica-Lezione 1
Domenico Ciavardelli