Daniele Santoni - Curri culum Vitae
Dati personali:
Luogo e data di nascita:
Roma, Italia, 31 luglio 1971
Cittadinanza:
Italiana
E-mail:
[email protected]
Sesso:
Maschile
Lingue:: Inglese, Frances e, Portoghese.
Formazione:
Novembre 2006 - presente: Dottorando all'Universtà “La Sapienza” di Roma, Dipartimento di
Genetica e Biologia Molecolare - Charles Darwin.
Settembre 2008: Scuola estiva di Calcolo Avanzato – CASPUR – Quarta Edizione – Villa Florio
Grottaferrata, Roma, Italia.
Agosto 2008: Borsa di studio per la scuola estiva “3rd Annual Summer School in Computational
Immunology” - Symposium “Systems Biology of Innate Immunity” - School of
medicine - Yale University – New Haven, USA.
Maggio 2008: Corso analisi dati di Microarray - “Bioinformatics training course Microarray Data
Analysis using GEPAS and Babelomics – MDAGBA08” - Instituto Gulbenkian de
Ciência, Lisbona, Portogallo.
2003:
Master di secondo livello in Bioinformatica, Università “La Sapienza” di Roma (cum
laude).
1999:
Laurea in Matematica (110/110), Università “La Sapienza” di Roma sotto la direzione
del Prof. Aldo de Luca. Argomento della tesi: DNA Computing, Information theory.
Title: Modelli di computazione, Problemi NP e DNA.
1990:
Diploma di Maturità Scientifica (Liceo Scientifico Statale Cavour, Rome) votazione
60/60.
Esperienze di lavoro:
Febbraio 2009 – Presente: Post-Doc position presso “Institute for Research in Biomedicine” (IRB)
Barcellona Spagna.
Aprile 2007 – Febbraio 2009: Assegnista di ricerca presso l’IAC (Istituto per le Applicazioni del
Calcolo) CNR.ComplexDis - Analisi, studio e disegno di modelli computazionali ad agenti per la
simulazione della risposta immunitaria in pazienti atopici.
Ottobre 2008: Vincitore della borsa di studio "Short-term mobility program of researchers", del CNR Dipartimento Scambi Internazionali; visiting-scholar program a “Knowledge Discovery and Bioinformatics
group - Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores: Investigação e Desenvolvimento INESCID” – Lisbona - Portogallo.
Ottobre 2006 - 2007: Docente del corso IN2 Modelli di Calcolo (esercitazioni) all'Università Roma III
Roma – Italia.
Settembre 2003 – Aprile 2007: Assegnista di ricerca presso lo IUSM (Istituto Universitario di Scienze
Motorie - Dipartimento di Scienze della Salute – Laboratorio di Bioinformatica) Roma – Italia.
Febbraio 2007: Ricercatore visitante al NUGEN (Nucleo di genomica e bioinformatica) presso
l'Universidade Estadual do Cearà – Fortaleza – Brasile.
Settembre-Ottobre 2006: Vincitore della borsa di studio "Short-term mobility program of researchers",
del CNR - Dipartimento Scambi Internazionali; visiting-scholar program a “The Technical University
of Denmark - Center for Biological Sequence Analysis -Comparative microbial genomics group”.
Marzo-Giugno 2004: Docente al Corso post laurea: Bioinformatica e Biotecnologie in Sanità Pubblica,
IUSM, Roma-Italia.
Marzo 2002 Settembre 2003: Borsa di studio presso il CASPUR (Consorzio per l'Appplicazione del
Superercalcolo Per Università e Ricerca) Roma - Italia su: Applicazioni per simulazioni di onde
sismiche (WISA).
Dicembre 2000 Marzo 2002: Isinet srl, Roma - Italia: Analisi e sviluppo di progetti nell'ambito di
applicazioni web. Web programming in ambiente UNIX (perl javascript CGI-PHP) e Windows
(VBScript javascript ASP).
Computer Science Skills: Sistemi operativi: UNIX, Linux, Windows. Linguaggi di programmazione:
Perl, Fortran, C, Pascal, Javascript, Vbscript, Matlab, SQL, HTML. DBMS: MySql.
Pubblicazioni:
Bhatt TK, Kapil C, Khan S, Jairajpuri MA, Sharma V, Santoni D, Silvestrini F, Pizzi E, Sharma A. (2009).
A genomic glimpse of aminoacyl-tRNA synthetases in malaria parasite Plasmodium falciparum. BMC
Genomics. 10:644.
Pedone F, Santoni D. (2009) Sequence-dependent DNA Helical Rise and Nucleosome Stability. BMC Mol
Biol. 10:105.
Santoni D, Romano-Spica V. (2009) Comparative genomic analysis by microbial COGs self-attraction rate.
J Theor Biol. 258: 513-520.
Cacchiarelli D, Santoni D and Bozzoni I. (2008) MicroRNAs as prime players in a combinatorial view of
evolution. RNA biol. 5(3).
Santoni D, Pedicini M and Castiglione F. (2008) Implementation of a regulatory gene network to simulate
the TH1/2 differentiation in an agent-based model of hyper-sensitivity reactions. Bioinformatics. 24(11): 13741380.
Paparini A, Ripani M, Giordano GD, Santoni D, Pigozzi F and Romano-Spica V. (2007). ACTN3
Genotyping by Real-Time PCR in the Italian Population and Athletes. Med Sci Sports Exerc. 39(5):810-815.
Brandi G, Sisti M, Paparini A, Gianfranceschi G, Schiavano GF, De Santi M, Santoni D, Magini V,
Romano-Spica V. (2007). Swimming pools and fungi: an environmental epidemiology survey in Italian indoor
swimming facilities. Int J Environ Health Res.17(3):197-206.
Paparini A, Santoni D, Romano-Spica V. (2006). Bioinformatics and microbial biodiversity: analysis of
vibrios by the GenEnv system. J Prev Med Hyg. 47(3):100-104.
Santoni D, Romano-Spica V. (2006). A gzip-based algorithm to identify bacterial families by 16S rRNA.
Lett Appl Microbiol. 42:312-314.
Pedone F, Mazzei F, Santoni D. (2004). Sequence-dependent DNA torsional rigidity: A tetranucleotides
code. Biophysical Chemistry. 112: 77-88.
Robaud V, Magini V, Sabatini A, Montuori E, Santoni D, Pascale S, Paparini A, Romano-Spica V. (2004).
Obesità infantile e dati antropometrici in una scuola elementare: aspetti legati alla suscettibilità genetica ed al
ruolo delle attività motorie adattate. J Prev Med Hyg, 45(4):394 in italian.
Romano-Spica V, Santoni D, Paparini A, Orsini M, Castrignanò T. (2004). Il database GenEnv: un nuovo
strumento di bioinformatica per la sanità pubblica. J Prev Med Hyg, 45(4):160-161 in italian.
Magini V, Robaud V, Montuori E, Sabatini A, Santoni D, Pascale S, Paparini A, Romano-Spica V. (2004).
Attività motorie e prevenzione dell'obesità infantile: aspetti genetici e antropometrici. L’Igiene Moderna. 123:
49-69 in italian.
Romano-Spica V, Santoni D, Paparini A, Orsini M, Canali A, Giammanco G, Castrignanò T.
(2004) Bioinformatics and GenEnv database in biological risk management. Sanità Pubblica 60:401420 in italian.
