ALCUNI TEMI DI BASE DELLA BIOINFORMATICA MEDICA
Metodi matematici. Reti di Petri, funzioni booleane e sistemi dinamici finiti,
catene di Markov, analisi formale dei concetti.
Metodi speciali della statistica medica. Scoperta di configurazioni statistiche significative mediante tecniche geometriche. Ottimizzazione della predittività di test statistici in dipendenza dalla popolazione considerata. Rappresentazione grafica e proiezione di dati in alta dimensione e applicazioni nell’analisi
delle discriminanti e nel raggruppamento automatico.
Genetica matematica. Analisi del genoma con tecniche della statistica e della
teoria dell’informazione. Costruzione di banche dati per geni noti. Metodi della
genetica delle popolazioni.
Epidemiologia di malattie tumorali. Sistematica e classificazione delle malattie tumorali. Analisi di microarray.
Tecniche speciali nella modellazione di malattie tumorali. Analisi di curve di crescita e ottimizzazione di terapie mediante differenziazione numerica.
Simulazione di tumori tramite automi cellulari. Modellazione matematica dei
sistemi comunicativi intercellulari.
Metodi matematici nello sviluppo di farmaci. Descrizione di molecole, ottimizzazione e variazione di strutture guida.
Temi attuali della bioinformatica matematica. Reti di Petri; statistica multivariata (proiezioni ottimali e funzioni discriminanti ottimali); modellazione di
circuiti biologici.
Metodi recenti o più astratti. Ottimizzazione genetica, reti neuronali, sistemi di Lindenmayer. Sviluppo di linguaggi speciali ad esempio per banche dati
o sistemi informativi. Teoria delle categorie applicata a reti di Petri e modelli
affini.
COMPITI FORMATIVI
Formazione matematica. Introduzione al linguaggio della matematica moderna: insiemi e funzioni, insiemi ordinati, grafi, reti di Petri, funzioni booleane,
sistemi dinamici finiti, catene di Markov e analisi formale dei concetti, metodi
matematici della statistica e in particolare della statistica multivariata. Introduzione alla letteratura matematica rilevante e alle informazioni disponibili
nell’Internet.
Linguaggi di programmazione. Programmazione in R (il linguaggio attualmente più popolare in statistica), Python, C, C++, Java.
Formazione multidisciplinare. Corsi brevi in statistica medica e informatica
frequentati in comune da medici e statistici.
1