Allegato V - Modello per la Presentazione dei Programmi di Tirocini/Stage1
Consorzio 21
Edificio 2- Polaris
Programma Master and Back
Loc. Piscina Manna
09010 Pula
1. Soggetto Proponente (Operante in Sardegna)
Ragione Sociale: Dipartimento di Scienze Biomediche, Università di Sassari, Sezione di Microbiologia
Sperimentale e Clinica
Indirizzo Viale S.Pietro 43/B, 07100, Sassari
Telefono 079 228299 Fax 079212345 E-mail [email protected]
Rappresentante Legale Prof. Andrea Montella
Referente per il Programma Prof. Pier Luigi Fiori
Tipologia
X
Università
Centro di Ricerca Pubblico o Privato
Impresa
Associazione Imprenditoriale o di Categoria
Istituzione Pubblica
Agenzia di Sviluppo Economico e/o Territoriale
1
Da compilare a cura del Soggetto Proponente il Programma di Tirocini/Stage su carta intestata. La scheda deve essere inviata al
Consorzio 21 anche via mail all’indirizzo: mailto:[email protected].
Breve Presentazione del Soggetto Proponente Operante in Sardegna
La sezione di Microbiologia del Dipartimento di Scienze Biomediche svolge attività di ricerca scientifica e di
assistenza nel campo delle infezioni microbiche, ottenendo rilevanti risultati scientifici a livello internazionale.
I ricercatori collaborano attivamente con colleghi di diverse Università ed enti di ricerca internazionali, e sono
titolari di numerosi progetti scientifici nazionali ed internazionali. In particolare le principali linee di ricerca
sono:
1. Studio e caratterizzazione di marcatori di diversi microorganismi, per la messa a punto di tecniche di
identificazione molecolare e di epidemiologia molecolare.
2. Caratterizzazione dei meccanismi molecolari di patogenicità di microorganismi procarioti, eucarioti e
virus: caratterizzazione di geni e proteine coinvolti nei meccanismi di virulenza
3. Caratterizzazione di molecole microbiche, e dei geni che le codificano, al fine della messa a punto di
vaccini protettivi per infezioni trasmesse da microorganismi procarioti, eucarioti e virus
4. Caratterizzazione di nuove molecole ad azione antimicrobica
Il gruppo del Prof. Fiori fa parte del progetto di sequenziamento completo del genoma del protozoo
Trichomonas vaginalis (NIH, TIGR).
Oltre l’attività di ricerca, il personale universitario è impegnato in attività didattiche presso numerosi corsi di
laurea, master, specializzazione, dottorati. Presso la sezione fa capo la Scuola di Specializzazione in
Microbiologia e Virologia, Direttore prof. P.L. Fiori
2. Soggetto Ospitante (Operante Fuori dalla Sardegna)
Ragione Sociale: Department Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics University of California, Los
Angeles (UCLA), USA
Indirizzo: Box 951489, Los Angeles, CA 900095 - 1419
Telefono: 001 (310) 825 3578 Fax: 001 (310) 2006 5231 E-mail: [email protected]
Rappresentante Legale: Prof. Jeffrey F. Miller
Referente per il Programma; Prof. Patricia Johnson
Tipologia
X
Università
Centro di Ricerca Pubblico o Privato
Impresa
Associazione Imprenditoriale o di Categoria
Istituzione Pubblica
Agenzia di Sviluppo Economico e/o Territoriale
Breve Presentazione del Soggetto Ospitante
Il Department Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics University of California, Los Angeles (UCLA),
USA, è uno dei più prestigiosi centri di ricerca degli USA e del mondo, preso il quale si conducono lavori di
altissima qualità scientifica nel campo della microbiologia, genetica molecolare ed immunologia. In
particolare il laboratorio diretto dalla Prof. Johnson rappresenta uno dei laboratori di punta nello studio del
protozoo patogeno Trichomonas vaginalis, la più frequente causa di infezioni a trasmissione sessuale di
origine non virale, legato alla trasmissione del virus HIV ed all’insorgenza di tumori del tratto genitale
femminile. L’altissimo livello è testimoniato dalla produzione scientifica, dai progetti di ricerca e dal grande
numero di ricercatori di ogni parte del mondo che ambiscono lavorare nella struttura. Per ulteriori
informazioni sul dipartimento, si può consultare il sito http//www.mimg.ucla.edu.
3. Accordo/Programma di Collaborazione
Tipologia dell’Accordo/Programma di Collaborazione
X
Sviluppo della Ricerca Scientifica e Tecnologica.
Formazione del Capitale Umano.
Cooperazione Economica e Sociale.
Descrizione dell’Accordo/Programma di Collaborazione
Obiettivi
Determinazione del ruolo di molecole espresse dal protozoo flagellato Trichomonas vaginalis coinvolte con il
meccanismo molecolare di patogenicità o nell’induzione di meccanismi di immunità innata, al fine della
messa a punto di vaccini protettivi. Per raggiungere gli obiettivi previsti, gli stagisti dovranno
necessariamente acquisire conoscenze tecniche di alto livello, derivate dalla comprovata esperienza e
prestigio internazionale del laboratorio ospitante.
Attività Realizzate e/o Previste
Sono attualmente in corso esperimenti in collaborazione per la valutazione delle attività attivatorie di
lipofosfoglicani protozoari. Nel corso dello stage presso il laboratorio ospitante, sono previsti:
1. esperimenti di caratterizzazione molecolare di effettori di patogenicità di T.vaginalis
2. determinazione del ruolo di fosfoglicani nell’indurre una risposta da parte del sistema immunitario innato
dell’ospite
3. messa a punto di sistemi genetici per l’espressione di molecole eterologhe in T.vaginalis, e per
l’iperespressione di geni propri ( in particolare quelli codificanti tossine quali le pore-forming proteins,
responsabili del danno tissutale nell’ospite umano)
4. determinazione del ruolo di meccanismi di RNA interferenza nel controllo dell’espressione genica
Tutti i sistemi descritti rientrano nella linea di ricerca in collaborazione tra il laboratorio ospitante e quello di
Sassari, e sono finalizzati al chiarimento dei meccanismi che producono e mantengono il danno tissutale nel
corso dell’infezione, favorendo l’instaurarsi dell’infezione da HIV. I risultati che si intende raggiungere sono la
necessaria base per la messa a punto di vaccini protettivi. I due laboratori proponenti sono tra i gruppi di
punta internazionale nello studio del protozoo, e condividono tecnologie e esperienze complementari. Inoltre
entrambi i gruppi sono tra i più attivi collaboratori al progetto di sequenziamento totale del genoma di
T.vaginalis coordinato dal TIGR, recentemente concluso.
Risultati Attesi
1. Determinazione del ruolo di molecole protozoarie nel controllo della risposta immune innata in
T.vaginalis
2. Sistemi di espressione (anche transitoria) di proteine eterologhe ed omologhe in T.vaginalis e di
manipolazione genica
3. Caratterizzazione degli eventuali meccanismi di RNA interferenza in T.vaginalis, al fine di controllare ed
inibire l’espressione di molecole di patogenicità
4. Caratterizzazione del ruolo di molecole protozoarie coinvolte con il mantenimento dell’infezione
5. Studi preliminari sulla messa a punto di vaccini protettivi
Per raggiungere questi obiettivi, gli stagisti dovranno prendere confidenza e maneggiare con abilità
piattaforme tecnologiche avanzate, applicando tecniche di avanguardia nel campo della genetica ed
immunologia molecolare, la cui applicazione è stata messa a punto nel laboratorio del gruppo ricevente.
Piano di Lavoro
Una prima fase sarà dedicata alla purificazione di molecole espresse da T.vaginalis, in particolare
lipofosoglicani (LPG) e pore-forming proteins. Una volta ottenuti i vari prodotti microbici e coltivate le cellule
bersaglio (ad esempio cellule dendritiche o monociti umani), verrà valutato il pattern di citochine prodotte (ad
esempio TNF, IL-1 beta, TNF alfa, IL-6, IL-10, IL-12, IFN alfa e gamma) in seguito a stimolazione con LPG o
perforine o con le cellule protozoarie intere. Il pattern citochinico sarà anche valutato dopo pre-trattamento
dei monociti e delle cellule dendritiche mediante anticorpi monoclonali specifici per CD14 e per i TLRs noti.
La produzione di citochine verrà valutata sia mediante metodi immunoenzimatici (ELISA) che,
eventualmente, mediante tecniche di RT-PCR quantitativa, utilizzando tecniche descritti in letteratura. Il ruolo
di NFkB nei fenomeni attivatori verrà costantemente valutato mediante “mobilty shift assay”, ben descritti in
letteratura.
Dopo analisi informatica delle banche dati che riportano le sequenze geniche di T.vaginalis, che hanno già
confermato la presenza di geni coinvolti con meccanismi di RNA interferenza nel protozoo, sarà studiate la
possibilità di “spegnere” selettivamente alcuni geni, al fine di ottenere microorganismi non esprimenti effettori
di patogenicità. Gli organismi “mutati” verranno saggiati per valutare l’effettiva perdita della virulenza.
L’attenzione sarà focalizzata su proteine della famiglia delle saposine (Saplip), il cui ruolo nell’indurre un
danno citopatico alle cellule dell’ospite umano è stata da poco ipotizzata. I geni per queste proteine sono
infatti coinvolti con la sinstesi delle perforine di T.vaginalis, e la loro caratterizzazione è stata resa possibile
dai risultati ottenuti dall’analisi delle sequenze espresse da protozoo.
Risorse Professionali Impegnate
Per l’ottenimento dei risultati previsti, sarà necessario il lavoro di due ricercatori laureati in discipline
scientifiche (in particolare Laurea in Scienze Biologiche). Tali ricercatori dovranno avere una comprovata
esperienza generale di lavoro in laboratori di ricerca nel campo della biologia cellulare e molecolare
(acquisita per l’elaborazione della tesi di laurea), nonché una esperienza post-laurea in laboratori che da
diverso tempo operano nel campo degli studi di patogenicità protozoaria ed in particolare nel campo della
biologia molecolare di T.vaginalis.
Risorse Finanziarie Impegnate
I costi legati alla ricerca, specie materiale di consumo, spese per pubblicazioni comuni, missioni di altri
ricercatori ecc, saranno parzialmente coperti dai progetti di ricerca coordinati dal Prof. Fiori, in particolare
progetti PRIN 2005 del MIUR, che prevedono spese per queste circa di circa 30.000 euro.
Modalità di Formalizzazione dell’Accordo/Programma di Collaborazione
Esiste da tempo tra la Prof. Patricia Johnson, Department Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics
University of California, Los Angeles (UCLA), USA, e il gruppo coordinato dal Prof. Fiori, Dip. Scienze
Biomediche, Università di Sassari, una collaborazione per la conduzione di ricerche sul comune campo della
patogenicità del protozoo T.vaginalis. La collaborazione è stata recentemente formalizzata con un
“Agreement of Collaboration” che comprende le attività di stage previste nel programma “Master and Back”
(Vedi allegato)
4. Piano del Tirocinio/Stage2
Obiettivi Formativi
•
Esperienza di lavoro in laboratori di ricerca di elevato prestigio scientifico per due laureati sardi
•
Acquisizione di tecniche molecolari per lo studio di protozoi patogeni per l’uomo, finalizzate
all’acquisizione di strategia per la messa a punto di vaccini protettivi
•
Uso di piattaforme tecnologiche avanzate nel campo della genetica ed immunologia molecolare
Obiettivi Professionali
•
Acquisizione di esperienze nel campo della ricerca scientifica di base ed applicata da spendere
presso laboratori ed enti di ricerca pubblici e privati, in particolare nello studio di malattie trasmissibili
2
Sezione da compilare per ciascun Tirocinio/Stage previsto dal Programma
ad alta incidenza.
•
Raggiungimento di autonomia di ricerca, analisi ed interpretazione di risultati scientifici, capacità di
proporre, scrivere e condurre progetti scientifici.
Piano Analitico delle Attività Formative e Professionali
•
Seminari scientifici presso l’Università che accoglie i ricercatori
•
Addestramento al lavoro di laboratorio da parte di ricercatori di elevata esperienza
•
Conduzione ed impostazione di sistemi sperimentali complessi
•
Interpretazione dei risultati ottenuti
•
Scrittura di articolo scientifici su riviste internazionali
Requisiti Professionali Richiesti3
Laurea in Scienze Biologiche
Votazione tra 110/110 e 110/110 e lode: punti 10
Votazione tra 107/110 e 109/110: punti 7
Votazione tra 105/110 e 106/110: punti 3
Altra laurea in campo scientifico
Per votazione superiore a 109/110: punti 3
Comprovata esperienza (certificata da Periodo superiore ai 12 mesi: punti 20
parte del responsabile del laboratorio)
presso strutture di ricerca specializzate Periodo superiore ai 6 mesi: punti 15
nello
studio
dei
meccanismi
di
patogenicità di Trichomonas vaginalis
Periodo superiore ai 3 mesi: punti 10
Periodo superiore a un mese: punti 5
Tesi di laurea sperimentale nel campo punti 10
della biologia cellulare e molecolare
Tesi di laurea sperimentale nel campo
microbiologico
punti 5
Tesi di laurea sperimentale nel campo punti 3
della parassitologico
Costi del Tirocinio/Stage4
I costi dello stage sono legati alle spese di viaggio e di soggiorno, non completamente prevedibili al
momento della presentazione della presente proposta. Pertanto si propongono i costi previsti dal presente
bando (1200 euro al mese per il soggiorno e 1000 euro per il viaggio). Non sono previste spese per
l’iscrizione.
Partecipazione Finanziaria degli Organismi Proponenti5
3
Questi requisiti dovranno essere utilizzati per la valutazione dei Soggetti interessati ai tiocini/stage e quindi devono essere esplicitati
in maniera puntuale sotto forma di griglia di valutazione
4
Vedasi Paragrafo 3.4.1 della presente Guida.
5
Indicare l’importo e le modalità di erogazione.
I costi legati alla ricerca, specie materiale di consumo, spese per pubblicazioni comuni, missioni di altri
ricercatori ecc, saranno parzialmente coperti dai progetti di ricerca coordinati dal Prof. Fiori, in particolare
progetti PRIN 2005 del MIUR, che prevedono spese per queste circa di circa 30.000 euro.
Piano di Valorizzazione Professionale del Tirocinante/Stagista6
La naturale prosecuzione del lavoro svolto durante il soggiorno all’estero sarà l’inquadramento nei progetti di
ricerca gestiti dal laboratorio coordinato dal Prof. Fiori; infatti questo laboratorio è attualmente inserito in una
rete di collaborazioni internazionali che comprende il partner USA che formerà gli stagisti. L’esperienza
acquisita nel periodo trascorso da due laureati presso il laboratorio della Prof. Patricia Johnson, Department
Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics University of California, Los Angeles (UCLA), USA, sarà
comunque fondamentale per la futura carriera professionale dei ricercatori. Tale esperienza fornirà le basi
per un coinvolgimento in gruppi ed enti di ricerca pubblici e/o privati che lavorano nel campo delle
biotecnologie avanzate. L’esperienza acquisita sarà un requisito di priorità nell’eventuale assegnazione di
assegni di ricerca nel settore microbiologico. In particolare l’esperienza sarà requisito fondamentale sia per
la prosecuzione degli studi presso corsi di alta formazione che per l’assunzione presso ditte private che
attualmente collaborano con il gruppo di lavoro del Prof. Fiori (ad esempio Lab System, Proteomics). Infine,
il recente finanziamento di numerosi progetti di ricerca che prevedono il reclutamento di ricercatori di
esperienza internazionale, sarà ulteriore occasione di inserimento nel mondo del lavoro.
Data di Presentazione delle Candidature per il Tirocinio/Stage
23 aprile
Data di Inizio del Tirocinio/Stage
1 Giugno 2006. La data di inizio risentirà comunque dei tempi tecnici per l’acquisizione della
documentazione per le formalità di visto da parte dell’Ambasciata USA.
Data di Conclusione del Tirocinio Stage
6
Indicare le modalità attraverso le quali gli Organismi proponenti intendono valorizzare, nei 12 mesi successivi alla conclusione del
tirocinio/stage, le competenze e le esperienze acquisite dal Tirocinante/Stagista. La realizzazione del Piano di Valorizzazione
costituisce un impegno formale per gli Organismi proponenti.
Un anno dopo la data di inizio, indicativamente il 1 Giugno 2007
Durata del Tirocinio/Stage (mesi)
Un tirocinio di 12 mesi (due ricercatori)
Data, 06.02.06
_____________________________________________
(Firma Legale Rappresentante del Soggetto Proponente)
Si autorizza la Regione Autonoma della Sardegna, anche attraverso i Soggetti Attuatori del Programma
Master and Back a:
r pubblicizzare sul sito internet del Programma Master and Back e su altra documentazione specifica la
presente scheda relativa al Programma di Tirocinio/Stage per il quale si richiede l’erogazione del
voucher;
r fornire i propri riferimenti di posta elettronica ai Soggetti interessati a partecipare al Programma di
Tirocini/Stage presentato nella presente scheda.
Data, 06.02.2006
____________________________________________
(Firma Legale Rappresentante del Soggetto Proponente)
