Benjamin LEWIN Benjamin LEWIN IL GENE Edizione compatta IL GENE VIII Zanichelli (€ 101) Zanichelli (€ 65) James D. Watson, Tania A. Baker, Stephen P. Bell, Alexander Gann, Michael Levine, Richard Losick BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE Zanichelli (€ 98) Definizioni • Acidi nucleici: • Gene: molecole che codificano l’informazione genetica. DNA, RNA segmento di DNA che codifica per una catena polipeptidica • Genoma: insieme delle sequenze di DNA di un organismo Biologia Molecolare • In che modo viene conservato il materiale genetico? • Come viene decodificata l’informazione contenuta nel materiale genetico? 1865 1903 1910 1913 1927 1931 1944 1945 1953 1958 1961 1977 1997 Primi studi chimici sul DNA I geni sono dei fattori particolati I cromosomi sono unità ereditarie I geni sono localizzati nei cromosomi I cromosomi contengono degli insiemi lineari di geni Le mutazioni sono dei cambiamenti fisici nei geni La ricombinazione è causata dal “crossing-over” Il DNA è il materiale genetico Un gene codifica una proteina Il DNA ha una struttura a doppia elica Il DNA si replica in maniera semiconservativa Il codice genetico è costituito da triplette di basi Sequenziamento del DNA Sequenziamento di interi genomi Friedrich Miescher (1844-1895) The laboratory located in the vaults of an old castle where Miescher isolated nuclein (1879) Levene working in the lab Levene's laboratory with some of his students (1909). Strutture del tetranucleotide proposte nel 1935 da Levene e Tips da Takahashi 1865 1903 1910 1913 1927 1931 1944 1945 1953 1958 1961 1977 1997 I geni sono dei fattori particolati I cromosomi sono unità ereditarie I geni sono localizzati nei cromosomi I cromosomi contengono degli insiemi lineari di geni Le mutazione sono dei cambiamenti fisici nei geni La ricombinazione è causata dal “crossing-over” Il DNA è il materiale genetico Un gene codifica una proteina Il DNA ha una struttura a doppia elica Il DNA si replica in maniera semiconservativa Il codice genetico è costituito da triplette di basi Sequenzamento del DNA Sequenzamento di interi genomi Esperimento di "trasformazione" batterica: Griffith, 1929 Pneumococco (Streptococcus pneumoniae) S muore R ceppo S ucciso al calore vive R S vive muore • Un principio “trasformante” converte il ceppo R in S Oswald Avery at work in the laboratory, around 1930 Trasformazione di pneumococchi mutanti R in tipo S mediante estratto cellulare Alfred Hershey and Martha Chase (1953) L'esperimento del "frullatore” - Hershey e Chase, 1952 Fagi marcati con P32 nel DNA e con S35 nelle proteine infettano i batteri frullatore I capsidi fagici contengono l'80 % del S35 mentre i batteri infettati contengono il 70 % del P32 lisi La progenie fagica contiene il 30 % del P32 e < 1% del S35 B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007 La struttura chimica del DNA Componenti chimici degli acidi nucleici 2-desossiribosio ( 2-deoxyribose ) 6 ribosio NH 2 7 5 1N N N N 8 2 N 4 N9 H 3 N purina N H adenina guanina NH 2 4 3N 5 2 6 N 1 N H pirimidina citosina N O uracile timina O CH2OH O -O -O O OH P O CH2 O- OH O OH P O O- (Pirimidina) 3'- monofosfato (Purina) 5'- monofosfato I nucleotidi possono portare il gruppo fosfato in posizione 5' o 3' -O O O O P O P O P O CH2 O- O- g O- b a OH O OH Basi, nucleosidi e nucleotidi Base Nucleoside Nucleotide RNA DNA Adenina Adenosina Adenosina-5’-fosfato (Acido adenilico) AMP dAMP Guanina Guanosina Guanosina-5’-fosfato (Acido Guanilico) GMP dGMP Citosina Citidina Citidina-5’-fosfato (Acido citidilico) CMP dCMP Timina Timidina Timidina-5’-fosfato (Acido timidilico) Uracile Uridina Uridina-5’-fosfato (Acido uridilico) dTMP UMP B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007 Erwin Chargaff Per primo misurò accuratamente la percentuale dei quattro nucleotidi nel DNA Composizione in basi del DNA di varie specie Organismo Escherichia coli Mycobact. tuberc. Lievito Bue Maiale Uomo A G C T A/T G/C G+C Py/Pu 26.0 15.1 31.7 29.0 29.8 30.4 24.9 34.9 18.3 21.2 20.7 19.9 25.2 35.4 17.4 21.2 20.7 19.9 23.9 14.6 32.6 28.7 29.1 30.1 1.08 1.03 0.97 1.01 1.02 1.01 0.99 0.99 1.05 1.00 1.00 1.00 50.1 70.3 35.7 42.4 41.4 39.8 1.04 1.00 1.00 1.01 1.01 1.01 La struttura fisica del DNA Maurice Wilkins (1916 - 2004) Francis Crick (1916 - 2004) Linus Pauling (1901 - 1994) Rosalind Franklin (1920 - 1958) James Watson (1928 ) Diffrazione dei raggi X di fibre di DNA configurazione B Franklin R.E. & Gosling R., 1953 configurazione A Wilkins M.H.F., 1956