ELENCO DELLE PRESTAZIONI Di seguito si riporta l’elenco delle prestazioni offerte dall’U.O.C. di Microbiologia e Virologia. Esso è organizzato per apparati indipendentemente che si tratti di ricerche batteriologiche, sierologiche, micologiche, parassitologiche o virologiche. Qualora un microrganismo sia responsabile di più quadri clinici, le indagini relative sono riportate in tutte le sezioni. Nell’ambito delle indagini batteriologiche, ogni ceppo batterico isolato, patogeno o potenzialmente tale (opportunista) viene sottoposto ad identificazione e, ove necessario, al saggio di sensibilità agli antibiotici. Per ogni indagine viene riportata la sede di esecuzione (BR - Laboratorio presso il Policlinico Borgo Roma; BT Laboratorio presso l’ospedale di Borgo Trento), i tempi massimi di refertazione (TAT) espressi in giorni lavorativi (nel calcolo sono esclusi il sabato, la domenica e le festività infrasettimanali) e la comunicazione telefonica () di eventuali positività nel caso di indagini particolarmente lunghe o significative. INFEZIONI APPARATO RESPIRATORIO es. batteriologico tampone nasale es. batteriologico tampone faringeo (ric. Streptococcus pyogenes) ric. MDR (colonizzazione da batteri multiresistenti) su tampone faringeo es. batteriologico espettorato es. batteriologico broncoaspirato es. batteriologico broncolavaggio es. batteriologico liquido pleurico es. batteriologico tubo endotracheale es. batteriologico liquido di drenaggio ric. colturale Bordetella pertussis su espettorato ric. anticorpi anti Bordetella pertussis (su sangue – met. EIA) ric. colturale Corynebacterium diphteriae su tampone faringeo ric. colturale Neisseria meningitidis su tampone faringeo ric. colturale Legionella pneumophila su broncoaspirato/broncolavaggio ric. antigene Legionella pneumophila su urina ric. antigene Streptococcus pneumoniae su urina ric. anticorpi anti-Legionella pneumophila (su sangue – met. I.F. ) ric. anticorpi anti-Chlamydia pneumoniae (su sangue – met. EIA) ric. anticorpi anti- Chlamydia psittaci (su sangue – met. EIA) ric. anticorpi anti-Mycoplasma pneumoniae (su sangue – met. EIA) ric. colturale Aspergillus spp su espettorato/broncoaspirato/broncolavaggio ric. colturale miceti dimorfi su espettorato/broncoaspirato/broncolavaggio ric. galattomannano (antigene Aspergillus spp) su broncoaspirato/broncolavaggio ric. 1-3 Beta-D-glucano su broncoaspirato/broncolavaggio ric. colturale micobatteri su espettorato / broncoaspirato / broncolavaggio ric. sequenze genomiche di Micobacterium tuberculosis - DNA ric. virus respiratori (Virus Respiratorio Sinciziale; Influenzavirus A/B; Parainfluenzavirus 1-3; Adenovirus) su aspirato nasofaringeo/broncoaspirato/broncolavaggio ric. anticorpi anti Influenzavirus A (su sangue – met.EIA) ric. anticorpi anti Influenzavirus B (su sangue – met.EIA) ric. anticorpi anti Parainfluenzavirus (su sangue – met.EIA) ric. anticorpi anti Virus Respiratorio Sinciziale (su sangue – met.EIA) ric. anticorpi anti Adenovirus (su sangue – met.EIA) ric. anticorpi anti Coxackievirus B (su sangue – met. EIA) BR INFEZIONI APP. UROGENITALE - MALATTIE A TRASMISSIONE SESSUALE es. batteriologico tampone vulvare es. batteriologico tampone vaginale es. batteriologico tampone balano-prepuziale es. batteriologico tampone uretrale es. batteriologico liquido seminale Test di Stamey ric. Chlamydia trachomatis su tamp. cervicale / tamp. uretrale / urina / liq. seminale (met. biologia molecolare) BR X X X X X X X BT X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X TAT(gg) 5 5 6 5 5 5 6 5 6 8 5 6 6 8 1 1 10 5 5 5 6 20 6 6 42 2 11 X X X X X X 5 5 5 5 5 5 BT TAT(gg) 4 5 4 4 4 4 2 ric. Mycoplasma spp / Ureaplasma urealyticum su tamp. cervicale/tamp. uretrale ric. Neisseria gonorrheae su tamp. cervicale / tamp. uretrale / urina / liq. seminale (met. biologia molecolare) ric. colturale Neisseria gonorrheae su tamp. cervicale / tamp. uretrale ric. colturale Streptococcus agalactiae su tamp. vaginale urocoltura ric. colturale micobatteri su urina ric. Trichomonas spp su urina ric. anticorpi anti-Treponema pallidum (su sangue – met. EIA) ric. anticorpi anti HIV (su sangue; met. EIA) ric. HIV-1 RNA (su sangue; met. EIA) ric. colturale Virus Herpes Simplex (HSV) 1/2 da lesione cutanea o mucosa ric. BK virus DNA (su sangue / su urina – met. biologia molecolare) X X 5 2 X X X 5 4 4 42 2 5 5 12 10 6 X X X X X X X INFEZIONI DELLA CUTE E ANNESSI es. batteriologico tampone cutaneo es. batteriologico tampone linguale (ric. Candida spp) es. batteriologico tampone congiuntivale ric. Chlamydia trachomatis su tamp. congiuntivale (met. I.F.) es. batteriologico scraping corneale es. batteriologico anello sclerocorneale es. batteriologico tampone auricolare es. batteriologico tampone ulcera es. batteriologico tampone ferita chirurgica es. batteriologico tampone inserzione catetere vascolare es. batteriologico tampone zona ustione es.batteriologico materiale purulento ric. colturale Virus Herpes Simplex (HSV) da lesione cutanea o mucosa ric. colturale Virus Varicella Zoster (VZV) da lesione cutanea ric. colturale dermatofiti ric. colturale miceti dimorfi ric. micobatteri su biopsia cutanea BR INFEZIONI APPARATO OSTEOARTICOLARE es. batteriologico liquido sinoviale es. batteriologico frammento bioptico ric. micobatteri su biopsia ric. colturale miceti dimorfi es. batteriologico tampone ferita chirurgica es. batteriologico materiale purulento INFEZIONI APPARATO GASTROENTERICO coprocoltura (ric. Salmonella spp; Shigella spp, Campylobacter spp) ric. Clostridium difficile ric. Salmonella spp (controllo) ric Escherichia coli enteroemorragici ric. Yersinia enterocolitica ric. Vibrio cholerae ric. antigene Rotavirus ric. antigene Adenovirus ric. antigene Norovirus ric. colturale Helicobacter pylori su biopsia gastrica ric. antigene Helicobacter pylory su feci (met. EIA) ric. anticorpi anti- Helicobacter pylori (su sangue; met. EIA) ric. micobatteri su aspirato gastrico es. coproparassitologico (ric. protozoi / elminti) ric. microscopica Enterobius vermicularis (scotch test) ric. antigene Giardia intestinalis su feci (met. ICT) ric. antigene Cryptosporidium spp su feci (met. ICT) BT X X X X X X X X X X X X X X X TAT(gg) 5 7 5 4 6 6 5 6 6 5 5 6 10 21 16 20 42, BR BT X X X X X X TAT (gg) 6 6 42, 20 6 6 BR BT X X X X X X X X X X X X X X X X X TAT (gg) 5 3 4 5 5 4 2 2 2 10 15 5 42 4 3 2 2 X X ric. colturale larve di Strongyloides stercoralis su feci ric. anticorpi anti-Strongyloides stercoralis (su sangue; met. EIA) ric. anticorpi anti Echinococcus granulosus (su sangue – met EIA) ric. anticorpi anti Entamoeba histolytica (su sangue – met. EIA) ric. anticorpi anti Schistosoma mansoni (su sangue – met. EIA) es. batteriologico bile es. batteriologico liquido duodenale es. batteriologico liquido peritoneale es. batteriologico liquido di drenaggio ric MDR (colonizzazione da batteri miltiresistenti) su tampone rettale ric. marcatori epatite A (HAV) su sangue ric. anticorpi anti-HAV ric anticorpi anti HAV- IgM ric. marcatori epatite B (HBV) su sangue ric. antigene HBsAg ric. anticorpi anti-HBsAg ric. anticorpi anti HBcAg ric. anticorpi anti HBcAg – IgM ric. antigene HBeAg ric. anticorpi anti HBeAg ric. HBV-DNA (met. biologia molecolare) ric. marcatori epatite Delta (HDV) su sangue ric. antigene HDV ric. anticorpi anti-HDV ric. HDV-RNA (met. biologia molecolare) ric. marcatori epatite C (HCV) su sangue ric. anticorpi anti HCV ric. HCV-RNA (met. biologia molecolare) tipizzazione genomica HCV X X X X X X X X X 7 10 5 3 3 6 6 6 6 6 X X 4 4 X X X X X X 5 4 5 5 4 4 10 X X 6 6 30 X 5 10 15 BT X X X X X X X X TAT (gg) 4, 1, 1 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 5 6 6 3 5 5 5 3 BT X X X X X TAT (gg) 5 42, 5 5 6 X X X X X INFEZIONI SISTEMA NERVOSO es. batteriologico liquor ric. antigeni batterici su liquor ric. antigene Cryptococcus neoformans su liquor ric.galattomannano (antigene Aspergillus spp) su liquor ric. sequenze genomiche HSV-DNA su liquor ric. sequenze genomiche CMV-DNA su liquor ric. sequenze genomiche VZV-DNA su liquor ric. sequenze genomiche EBV- DNA su liquor ric. sequenze genomiche JCV- DNA su liquor ric. sequenze genomiche virus del Morbillo - RNA su su liquor ric. sequenze genomiche Enterovirus - RNA su liquor ric. sequenze genomiche virus della Parotite - RNA su liquor ric. sequenze genomiche Borrelia burgdorferi - DNA su liquor ric. anticorpi anti Borrelia burgdorferi (su sangue/liquor – met. EIA) ric. sequenze genomiche Mycobacterium tuberculosis - DNA su liquor ric. sequenze genomiche Toxoplasma gondi - DNAsu liquor ric. anticorpi anti Trypanosoma gambiense su sangue / liquor ric. anticorpi anti Taenia solium (cisticercosi) su sangue – met. EIA ric. anticorpi anti -Tick Borne Encephalitis su liquor / su sangue ric. anticorpi anti - West Nile Virus su liquor / su sangue ric. anticorpi anti-Treponema pallidum (VDRL su liquor) BR X X X X X X X X X X X X X INFEZIONI APPARATO CARDIOVASCOLARE ED EMOPOIETICO emocoltura (ric. colturale batteri aerobi / anaerobi / miceti) ric. colturale micobatteri es. batteriologico catetere vascolare es. batteriologico liquido pericardico es. batteriologico valvola cardiaca BR X X X es. batteriologico protesi vascolare ric. Plasmodium spp (malaria; su sangue- es. microscopico) ric. parassiti ematici (microfilarie; Trypanosoma spp; Leishmania spp) su sangue/aspirato midollare ric. anticorpi anti Trypanosoma cruzy su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Leishmania spp su sangue (met. IF) X INFEZIONI IN GRAVIDANZA ric. anticorpi complesso T.O.R.C. (su sangue; met. EIA) ric. anticorpi anti HSV 1/2 (su sangue – met. EIA) ric. anticorpi anti-Treponema pallidum (su sangue – met. EIA) ric. anticorpi anti Parvovirus B19 (su sangue; met. EIA) ric. sequenze genomiche Parvovirus B19 DNA su sangue / liq amniotico ric sequenze genomiche Virus della Rosolia - RNA su sangue / liq.amniotico ric sequenze genomiche CMV- DNA su sangue / liq amniotico ric. sequenze genomiche Virus Varicella Zoster (VZV) – DNA su sangue / liq. amniotico ric. sequenze genomiche Toxoplasma gondi - DNA su liquido amniotico ric. Streptococcus agalactiae su tampone vaginale ric. Streptococcus agalactiae su tampone rettale BR SCREENING INFEZIONI NEONATALI ric. Streptococcus agalactiae su tampone congiuntivale ric. Streptococcus agalactiae su tampone nasale ric. Streptococcus agalactiae su tampone faringeo ric. Streptococcus agalactiae su tampone auricolare ric. Streptococcus agalactiae su tampone ombelicale ric. colturale CMV su urina ric. anticorpi anti Chlamydia trachomatis su sangue (met. IF) BR X X X X X X INFEZIONI SISTEMICHE Monotest ric. anticorpi anti Epstein Baar Virus (EBV) su sangue (met. EIA) ric. sequenze genomiche EBV - DNA su sangue ric. anticorpi anti Citomegalovirus (CMV) (su sangue; met. EIA) ric. colturale CMV (antigene pp65) su sangue ric. sequenze genomiche CMV- DNA su sangue ric. anticorpi anti HIV 1-2 su sangue (met. EIA) ric. sequenze genomiche HIV 1- RNA su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Virus del Morbillo su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Virus della Parotite su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Parvovirus B19 su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Enterovirus su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Virus della Rosolia su sangue (met EIA) ric. anticorpi anti Virus Varicella Zoster (VZV) su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti virus Chikungunya su sangue (met. ICT) ric. antigene virus Dengue su sangue (met. ICT) ric. anticorpi anti virus Dengue su sangue (met. ICT) ric. anticorpi anti - West Nile Virus su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti leptospire su sangue (met. ICT) ric. anticorpi anti Brucella spp su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Salmonella – Brucella (reazione di Widal-Wright – met. agglutinazione) ric. anticorpi anti Borrelia burgdorferi (mal. di Lyme) su sangue ( met. EIA) ric. sequenze genomiche Borrelia burgdorferi - DNA su sangue ric. anticorpi anti Bartonella henselae su sangue (met. IF) ric. anticorpi anti Rickettsia conori su sangue (met. IF) ric. anticorpi anti Coxiella burnetii su sangue (met. IF) ric. anticorpi anti Francisella tularensis (su sangue – met. agglutinazione) ric. anticorpi anti Leishmania donovani su sangue (met. IF) ric. anticorpi anti Toxocara canis su sangue (met. EIA) X X X 6 1 1 X X 3 6 BT X X X X TAT (gg) 5 5 5 5 6 6 6 6 6 4 4 BT TAT (gg) 4 4 4 4 4 28 5 X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X 1 6 6 5 28 6 5 12 5 5 5 5 5 6 2 2 2 5 2 5 3 5 6 5 5 5 5 6 5 ric. anticorpi anti Toxoplasma gondii su sangue (met. EIA) ric. galattomannano (antigene Aspergillus spp) su sangue (met. EIA) ric 1-3 beta-D-glucano su sangue (met. EIA) ric. antigene Cryptococcus neoformans su sangue (met. EIA) ric. anticorpi anti Aspergillus spp (met. immunodiffusione) ric. anticorpi anti Blastomyces dermatitidis (met. immunodiffusione) ric. anticorpi anti Coccidioides immitis (met. immunodiffusione) ric anticorpi anti Histoplasma capsulatum (met. immunodiffusione) Indagine immunologica infezione tubercolare (quantiferon; su sangue) ric. anticorpi anti streptoDNAasi B (su sangue – met. nefelometria) ric. anticorpi anti streptolisina (TAS; su sangue – met. nefelometria) X X X X X X X X X 5 6 6 5 11 11 11 11 10 1 1