ELENCO DELLE PRESTAZIONI DI

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ELENCO DELLE PRESTAZIONI
Di seguito si riporta l’elenco delle prestazioni offerte dall’U.O.C. di Microbiologia e Virologia. Esso è organizzato per
apparati indipendentemente che si tratti di ricerche batteriologiche, sierologiche, micologiche, parassitologiche o
virologiche. Qualora un microrganismo sia responsabile di più quadri clinici, le indagini relative sono riportate in tutte
le sezioni.
Nell’ambito delle indagini batteriologiche, ogni ceppo batterico isolato, patogeno o potenzialmente tale (opportunista)
viene sottoposto ad identificazione e, ove necessario, al saggio di sensibilità agli antibiotici.
Per ogni indagine viene riportata la sede di esecuzione (BR - Laboratorio presso il Policlinico Borgo Roma; BT Laboratorio presso l’ospedale di Borgo Trento), i tempi massimi di refertazione (TAT) espressi in giorni lavorativi
(nel calcolo sono esclusi il sabato, la domenica e le festività infrasettimanali) e la comunicazione telefonica () di
eventuali positività nel caso di indagini particolarmente lunghe o significative.
INFEZIONI APPARATO RESPIRATORIO
es. batteriologico tampone nasale
es. batteriologico tampone faringeo (ric. Streptococcus pyogenes)
ric. MDR (colonizzazione da batteri multiresistenti) su tampone faringeo
es. batteriologico espettorato
es. batteriologico broncoaspirato
es. batteriologico broncolavaggio
es. batteriologico liquido pleurico
es. batteriologico tubo endotracheale
es. batteriologico liquido di drenaggio
ric. colturale Bordetella pertussis su espettorato
ric. anticorpi anti Bordetella pertussis (su sangue – met. EIA)
ric. colturale Corynebacterium diphteriae su tampone faringeo
ric. colturale Neisseria meningitidis su tampone faringeo
ric. colturale Legionella pneumophila su broncoaspirato/broncolavaggio
ric. antigene Legionella pneumophila su urina
ric. antigene Streptococcus pneumoniae su urina
ric. anticorpi anti-Legionella pneumophila (su sangue – met. I.F. )
ric. anticorpi anti-Chlamydia pneumoniae (su sangue – met. EIA)
ric. anticorpi anti- Chlamydia psittaci (su sangue – met. EIA)
ric. anticorpi anti-Mycoplasma pneumoniae (su sangue – met. EIA)
ric. colturale Aspergillus spp su espettorato/broncoaspirato/broncolavaggio
ric. colturale miceti dimorfi su espettorato/broncoaspirato/broncolavaggio
ric. galattomannano (antigene Aspergillus spp) su broncoaspirato/broncolavaggio
ric. 1-3 Beta-D-glucano su broncoaspirato/broncolavaggio
ric. colturale micobatteri su espettorato / broncoaspirato / broncolavaggio
ric. sequenze genomiche di Micobacterium tuberculosis - DNA
ric. virus respiratori (Virus Respiratorio Sinciziale; Influenzavirus A/B; Parainfluenzavirus
1-3; Adenovirus) su aspirato nasofaringeo/broncoaspirato/broncolavaggio
ric. anticorpi anti Influenzavirus A (su sangue – met.EIA)
ric. anticorpi anti Influenzavirus B (su sangue – met.EIA)
ric. anticorpi anti Parainfluenzavirus (su sangue – met.EIA)
ric. anticorpi anti Virus Respiratorio Sinciziale (su sangue – met.EIA)
ric. anticorpi anti Adenovirus (su sangue – met.EIA)
ric. anticorpi anti Coxackievirus B (su sangue – met. EIA)
BR
INFEZIONI APP. UROGENITALE - MALATTIE A TRASMISSIONE SESSUALE
es. batteriologico tampone vulvare
es. batteriologico tampone vaginale
es. batteriologico tampone balano-prepuziale
es. batteriologico tampone uretrale
es. batteriologico liquido seminale
Test di Stamey
ric. Chlamydia trachomatis su tamp. cervicale / tamp. uretrale / urina / liq. seminale (met.
biologia molecolare)
BR
X
X
X
X
X
X
X
BT
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
TAT(gg)
5
5
6
5
5
5
6
5
6
8
5
6
6
8
1
1
10
5
5
5
6
20
6
6
42 
2
11
X
X
X
X
X
X
5
5
5
5
5
5
BT
TAT(gg)
4
5
4
4
4
4
2
ric. Mycoplasma spp / Ureaplasma urealyticum su tamp. cervicale/tamp. uretrale
ric. Neisseria gonorrheae su tamp. cervicale / tamp. uretrale / urina / liq. seminale (met.
biologia molecolare)
ric. colturale Neisseria gonorrheae su tamp. cervicale / tamp. uretrale
ric. colturale Streptococcus agalactiae su tamp. vaginale
urocoltura
ric. colturale micobatteri su urina
ric. Trichomonas spp su urina
ric. anticorpi anti-Treponema pallidum (su sangue – met. EIA)
ric. anticorpi anti HIV (su sangue; met. EIA)
ric. HIV-1 RNA (su sangue; met. EIA)
ric. colturale Virus Herpes Simplex (HSV) 1/2 da lesione cutanea o mucosa
ric. BK virus DNA (su sangue / su urina – met. biologia molecolare)
X
X
5
2
X
X
X
5
4
4
42 
2
5
5
12
10
6
X
X
X
X
X
X
X
INFEZIONI DELLA CUTE E ANNESSI
es. batteriologico tampone cutaneo
es. batteriologico tampone linguale (ric. Candida spp)
es. batteriologico tampone congiuntivale
ric. Chlamydia trachomatis su tamp. congiuntivale (met. I.F.)
es. batteriologico scraping corneale
es. batteriologico anello sclerocorneale
es. batteriologico tampone auricolare
es. batteriologico tampone ulcera
es. batteriologico tampone ferita chirurgica
es. batteriologico tampone inserzione catetere vascolare
es. batteriologico tampone zona ustione
es.batteriologico materiale purulento
ric. colturale Virus Herpes Simplex (HSV) da lesione cutanea o mucosa
ric. colturale Virus Varicella Zoster (VZV) da lesione cutanea
ric. colturale dermatofiti
ric. colturale miceti dimorfi
ric. micobatteri su biopsia cutanea
BR
INFEZIONI APPARATO OSTEOARTICOLARE
es. batteriologico liquido sinoviale
es. batteriologico frammento bioptico
ric. micobatteri su biopsia
ric. colturale miceti dimorfi
es. batteriologico tampone ferita chirurgica
es. batteriologico materiale purulento
INFEZIONI APPARATO GASTROENTERICO
coprocoltura (ric. Salmonella spp; Shigella spp, Campylobacter spp)
ric. Clostridium difficile
ric. Salmonella spp (controllo)
ric Escherichia coli enteroemorragici
ric. Yersinia enterocolitica
ric. Vibrio cholerae
ric. antigene Rotavirus
ric. antigene Adenovirus
ric. antigene Norovirus
ric. colturale Helicobacter pylori su biopsia gastrica
ric. antigene Helicobacter pylory su feci (met. EIA)
ric. anticorpi anti- Helicobacter pylori (su sangue; met. EIA)
ric. micobatteri su aspirato gastrico
es. coproparassitologico (ric. protozoi / elminti)
ric. microscopica Enterobius vermicularis (scotch test)
ric. antigene Giardia intestinalis su feci (met. ICT)
ric. antigene Cryptosporidium spp su feci (met. ICT)
BT
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
TAT(gg)
5
7
5
4
6
6
5
6
6
5
5
6
10
21
16
20
42, 
BR
BT
X
X
X
X
X
X
TAT (gg)
6
6
42, 
20
6
6
BR
BT
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
TAT (gg)
5
3
4
5
5
4
2
2
2
10
15
5
42 
4
3
2
2
X
X
ric. colturale larve di Strongyloides stercoralis su feci
ric. anticorpi anti-Strongyloides stercoralis (su sangue; met. EIA)
ric. anticorpi anti Echinococcus granulosus (su sangue – met EIA)
ric. anticorpi anti Entamoeba histolytica (su sangue – met. EIA)
ric. anticorpi anti Schistosoma mansoni (su sangue – met. EIA)
es. batteriologico bile
es. batteriologico liquido duodenale
es. batteriologico liquido peritoneale
es. batteriologico liquido di drenaggio
ric MDR (colonizzazione da batteri miltiresistenti) su tampone rettale
ric. marcatori epatite A (HAV) su sangue
ric. anticorpi anti-HAV
ric anticorpi anti HAV- IgM
ric. marcatori epatite B (HBV) su sangue
ric. antigene HBsAg
ric. anticorpi anti-HBsAg
ric. anticorpi anti HBcAg
ric. anticorpi anti HBcAg – IgM
ric. antigene HBeAg
ric. anticorpi anti HBeAg
ric. HBV-DNA (met. biologia molecolare)
ric. marcatori epatite Delta (HDV) su sangue
ric. antigene HDV
ric. anticorpi anti-HDV
ric. HDV-RNA (met. biologia molecolare)
ric. marcatori epatite C (HCV) su sangue
ric. anticorpi anti HCV
ric. HCV-RNA (met. biologia molecolare)
tipizzazione genomica HCV
X
X
X
X
X
X
X
X
X
7
10
5
3
3
6
6
6
6
6
X
X
4
4
X
X
X
X
X
X
5
4
5
5
4
4
10
X
X
6
6
30
X
5
10
15
BT
X
X
X
X
X
X
X
X
TAT (gg)
4, 
1, 
1
6
6
6
6
6
6
6
6
6
6
5
6
6
3
5
5
5
3
BT
X
X
X
X
X
TAT (gg)
5
42, 
5
5
6
X
X
X
X
X
INFEZIONI SISTEMA NERVOSO
es. batteriologico liquor
ric. antigeni batterici su liquor
ric. antigene Cryptococcus neoformans su liquor
ric.galattomannano (antigene Aspergillus spp) su liquor
ric. sequenze genomiche HSV-DNA su liquor
ric. sequenze genomiche CMV-DNA su liquor
ric. sequenze genomiche VZV-DNA su liquor
ric. sequenze genomiche EBV- DNA su liquor
ric. sequenze genomiche JCV- DNA su liquor
ric. sequenze genomiche virus del Morbillo - RNA su su liquor
ric. sequenze genomiche Enterovirus - RNA su liquor
ric. sequenze genomiche virus della Parotite - RNA su liquor
ric. sequenze genomiche Borrelia burgdorferi - DNA su liquor
ric. anticorpi anti Borrelia burgdorferi (su sangue/liquor – met. EIA)
ric. sequenze genomiche Mycobacterium tuberculosis - DNA su liquor
ric. sequenze genomiche Toxoplasma gondi - DNAsu liquor
ric. anticorpi anti Trypanosoma gambiense su sangue / liquor
ric. anticorpi anti Taenia solium (cisticercosi) su sangue – met. EIA
ric. anticorpi anti -Tick Borne Encephalitis su liquor / su sangue
ric. anticorpi anti - West Nile Virus su liquor / su sangue
ric. anticorpi anti-Treponema pallidum (VDRL su liquor)
BR
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
INFEZIONI APPARATO CARDIOVASCOLARE ED EMOPOIETICO
emocoltura (ric. colturale batteri aerobi / anaerobi / miceti)
ric. colturale micobatteri
es. batteriologico catetere vascolare
es. batteriologico liquido pericardico
es. batteriologico valvola cardiaca
BR
X
X
X
es. batteriologico protesi vascolare
ric. Plasmodium spp (malaria; su sangue- es. microscopico)
ric. parassiti ematici (microfilarie; Trypanosoma spp; Leishmania spp) su sangue/aspirato
midollare
ric. anticorpi anti Trypanosoma cruzy su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Leishmania spp su sangue (met. IF)
X
INFEZIONI IN GRAVIDANZA
ric. anticorpi complesso T.O.R.C. (su sangue; met. EIA)
ric. anticorpi anti HSV 1/2 (su sangue – met. EIA)
ric. anticorpi anti-Treponema pallidum (su sangue – met. EIA)
ric. anticorpi anti Parvovirus B19 (su sangue; met. EIA)
ric. sequenze genomiche Parvovirus B19 DNA su sangue / liq amniotico
ric sequenze genomiche Virus della Rosolia - RNA su sangue / liq.amniotico
ric sequenze genomiche CMV- DNA su sangue / liq amniotico
ric. sequenze genomiche Virus Varicella Zoster (VZV) – DNA su sangue / liq. amniotico
ric. sequenze genomiche Toxoplasma gondi - DNA su liquido amniotico
ric. Streptococcus agalactiae su tampone vaginale
ric. Streptococcus agalactiae su tampone rettale
BR
SCREENING INFEZIONI NEONATALI
ric. Streptococcus agalactiae su tampone congiuntivale
ric. Streptococcus agalactiae su tampone nasale
ric. Streptococcus agalactiae su tampone faringeo
ric. Streptococcus agalactiae su tampone auricolare
ric. Streptococcus agalactiae su tampone ombelicale
ric. colturale CMV su urina
ric. anticorpi anti Chlamydia trachomatis su sangue (met. IF)
BR
X
X
X
X
X
X
INFEZIONI SISTEMICHE
Monotest
ric. anticorpi anti Epstein Baar Virus (EBV) su sangue (met. EIA)
ric. sequenze genomiche EBV - DNA su sangue
ric. anticorpi anti Citomegalovirus (CMV) (su sangue; met. EIA)
ric. colturale CMV (antigene pp65) su sangue
ric. sequenze genomiche CMV- DNA su sangue
ric. anticorpi anti HIV 1-2 su sangue (met. EIA)
ric. sequenze genomiche HIV 1- RNA su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Virus del Morbillo su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Virus della Parotite su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Parvovirus B19 su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Enterovirus su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Virus della Rosolia su sangue (met EIA)
ric. anticorpi anti Virus Varicella Zoster (VZV) su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti virus Chikungunya su sangue (met. ICT)
ric. antigene virus Dengue su sangue (met. ICT)
ric. anticorpi anti virus Dengue su sangue (met. ICT)
ric. anticorpi anti - West Nile Virus su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti leptospire su sangue (met. ICT)
ric. anticorpi anti Brucella spp su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Salmonella – Brucella (reazione di Widal-Wright – met. agglutinazione)
ric. anticorpi anti Borrelia burgdorferi (mal. di Lyme) su sangue ( met. EIA)
ric. sequenze genomiche Borrelia burgdorferi - DNA su sangue
ric. anticorpi anti Bartonella henselae su sangue (met. IF)
ric. anticorpi anti Rickettsia conori su sangue (met. IF)
ric. anticorpi anti Coxiella burnetii su sangue (met. IF)
ric. anticorpi anti Francisella tularensis (su sangue – met. agglutinazione)
ric. anticorpi anti Leishmania donovani su sangue (met. IF)
ric. anticorpi anti Toxocara canis su sangue (met. EIA)
X
X
X
6
1
1
X
X
3
6
BT
X
X
X
X
TAT (gg)
5
5
5
5
6
6
6
6
6
4
4
BT
TAT (gg)
4
4
4
4
4
28
5
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
1
6
6
5
28
6
5
12
5
5
5
5
5
6
2
2
2
5
2
5
3
5
6
5
5
5
5
6
5
ric. anticorpi anti Toxoplasma gondii su sangue (met. EIA)
ric. galattomannano (antigene Aspergillus spp) su sangue (met. EIA)
ric 1-3 beta-D-glucano su sangue (met. EIA)
ric. antigene Cryptococcus neoformans su sangue (met. EIA)
ric. anticorpi anti Aspergillus spp (met. immunodiffusione)
ric. anticorpi anti Blastomyces dermatitidis (met. immunodiffusione)
ric. anticorpi anti Coccidioides immitis (met. immunodiffusione)
ric anticorpi anti Histoplasma capsulatum (met. immunodiffusione)
Indagine immunologica infezione tubercolare (quantiferon; su sangue)
ric. anticorpi anti streptoDNAasi B (su sangue – met. nefelometria)
ric. anticorpi anti streptolisina (TAS; su sangue – met. nefelometria)
X
X
X
X
X
X
X
X
X
5
6
6
5
11
11
11
11
10
1
1
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