VEQ in Biologia Molecolare ciclo 2013
HBV DNA
HIV RNA
HCV RNA
Genotipo HCV
Firenze 21 ottobre 2014
Maria Grazia Colao
VEQ 2013
1
2
54
7
1
4
2
17
3
5
2
4
1
3
112 partecipanti
4
2
Metodi utilizzati
Gruppi di elaborazione dati
 Risultati QUALITATIVI
 TMA o PCR
 Risultati QUANTITATIVI
 bDNA
 PCR End Point
 PCR Real Time Abbott
 PCR Real Time Taqman Roche
 Altre amplificazioni Real Time
Gruppi di elaborazione dati
 Altre Real Time
Ditta
Strumento per
estrazione
Strumento per
amplificazione
Genedia
Rotor Gene 3000
Artus/Qiagen
Rotor Gene 3000
Qiagen
QiaCube
Rotor Gene 3000
Bio Merieux
Easy Mag
RT PCR Applera
System
Siemens
Versant Sample
preparation
Versant K PCR
HCV RNA
VEQ 2013
Campione 2 : genotipo 1a
108 risultati
Campione 5 : genotipo 2a2c 108 risultati * risultati quantitativi espressi in UI/ ml
Campione 8 : genotipo 1a
108 risultati **
*1 risultato inf. alla soglia di sensibilità della metodica utilizzata e **1 ris.
HCV RNA
VEQ 2013
VEQ 2013
HCV RNA
VEQ 2013
HCV RNA
VEQ 2013
VEQ 2013
HCV RNA
VEQ 2013
HCV RNA
VEQ 2013
VEQ 2013
HBV DNA
Campione 3 :
Campione 6 :
Campione 9 :
100 risultati
102 risultati
93 risultati
VEQ 2013
risultati quantitativi espressi in UI/ ml
HBV DNA
VEQ 2013
HBV DNA
VEQ 2013
HBV DNA
VEQ 2013
HIV RNA
Campione 1 :
Campione 4 :
Campione 7 :
81 risultati
77 risultati *
75 risultati
VEQ 2013
risultati quantitativi espressi in copie/ ml
*4 risultati neg/ inferiori alla soglia di sensibilità della metodica utilizzata
HIV RNA
VEQ 2013
HIV RNA
VEQ 2013
HIV RNA
VEQ 2013
HIV RNA
VEQ 2013
I test di Biologia Molecolare
nelle infezioni delle
epatiti (HBV e HCV) e di HIV
Infezioni virali croniche
Metodi molecolari
 Identificare l’agente infettivo
 Quantificare la carica virale
 Caratterizzare il genotipo
 Identificare le variazioni genetiche
Test molecolari NAT
 Utilizzati per lo screening dei donatori
 Molto sensibili
 Risultato qualitativo
Test molecolari NAT
Sensibilità analitica
Procleix Tigris
System (Chiron)
Standard
Test
OMS HIV1 (97/650)
dHIV 1 Ultrio Plus 19.6 (15.6-27.6) UI/ml
11.8 (9.4-16.6) copie/ml
OMS HCV (96798)
dHCV Ultrio Plus
3.3 (2.6-4.6) UI/ml
OMS HBV (97/750)
dHBV Ultrio Plus
2.5 (2.0-3.7) UI/ml
Sensibilità analitica
TaqScreen MPX
(Roche)
Standard
Test
Probabilità di rilevamento (limiti fiduciali 95%)
II Standard OMS
HIV 1 gruppo M
50.3 (43.3-59.9) UI/ml
30.2 (26.0- 35.9) copie/ml
II Standard OMS
HCV
6.8 (5.8-8.3) UI/ml
II Standard OMS
HBV
2.3 (2.0-2.8) UI/ml
Probabilità di rilevamento (limiti fiduciali 95%)
Rischio Residuo
Test molecolari per HIV
 Diagnosi precoce
 Inquadramento e gestione del paziente
 Decisione al trattamento
 Monitoraggio terapia
 Valutazione della farmacoresistenza
HIV
 Solo una diagnosi precoce ci consente di controllare
la trasmissione
 Non abbiamo un vaccino
 Disponiamo di molti farmaci ma non eradichiamo il
virus
 Obiettivo da raggiungere  “soppressione
virologica”
 Limita i danni provocativirus
 Limita l’insorgenza di mutazioni genetiche che rendono il
virus resistente ai farmaci e che proprio la terapia
farmacologica selezionerebbero
Test molecolari per HIV RNA
1° gen
2° gen
3° gen
Test molecolari Real Time
 Utilizzati per il monitoraggio
 Sensibilità e specificità elevata
 Semplicità d’uso e basso rischio di contaminazione
 Accuratezza ed ampio range dinamico (101-109)
 Risultati: quantitativi e “qualitativi”
Test Molecolari Real Time:
possibili risultati
 Valore > LLoQ e all’interno del range dinamico del
test
 Risultato quantitativo
 Valore < LLoQ
 TARGET NOT DETECTED
 < LLoQ
(DETECTABLE)
Che peso può avere questa distinzione?
HIV RNA e VIREMIA RESIDUA
Cinetica della viremia plasmatica in ART
From Hilldorfer BB et al. Curr HIV/AIDS Rep 2012
HIV RNA - VIREMIA RESIDUA e
rischio di rebound virologico
2012
2012
HIV RNA - VIREMIA RESIDUA e
rischio di rebound virologico
Test molecolari per HBV e HCV
 HBV
 HCV
 Test qualitativo
 Test qualitativo
 Test quantitativo
 Test quantitativo
 Genotipizzazione
 Genotipizzazione
 Test per la valutazione
 Test per la valutazione
della farmacoresistenza
della farmacoresistenza
Test molecolari per HBV DNA
 Diagnosi precoce
 Inquadramento e gestione del paziente
 Identificare portatori inattivi/attivi
 Diagnosticare epatite B occulta
 Decisione al trattamento
 Monitoraggio terapia
Linee guida EASL 2012
HBV DNA:
Monitoraggio della terapia
HBV DNA:
Monitoraggio della terapia
 Lo scopo della terapia è raggiungere e mantenere
l’inibizione della replicazione virale
 Possibile l’insorgenza di mutanti resistenti 
ha importanza la valutazione della viremia
residua?
Trattamento HBV e attività antivirale
Potenza: rapidità con cui un farmaco induce la soppressione della replica virale
Barriera genetica: n di mutazioni necessarie al virus per replicare in presenza di
quel farmaco bassa barriere genetica: alta probabilità di sviluppare resistenza
HBV DNA e VIREMIA RESIDUA
Test molecolari per HCV RNA
 Diagnosi precoce
 Inquadramento e gestione del paziente
 Decisioni per il trattamento (valutare anche genotipo)
 Monitoraggio terapia
 Rapida
 Completa
 Sostenuta
HCV terapia: obiettivo
Linee guida Europee 2014
RVG: Response Guided Therapy
HCV RNA:
Monitoraggio della terapia
 Lo scopo della terapia per HCV è raggiungere e
mantenere una SVR
 ha importanza la valutazione della viremia
residua?
HCV RNA e VIREMIA RESIDUA
HCV terapia standard e nuove terapie
 Terapia Standard Peg IFN + RBV
 Durata e dosi differenti a seconda del genotipo virale
 Risposte variabili a seconda del genotipo
insoddisfacente per g1 (30-50%)
 Triplice terapia  Peg IFN + RBV + 1DAA
 Migliora la risposta a g1 (60-70%)
 Profilo di tollerabilità complesso ed effetti collaterali
 Rapido emergere di resistenza farmacologica
 Monitoraggio a tempi definiti e tempi rapidi di
risposta
 Necessità di aderenza alle stopping rules
HCV RNA: confronto tra metodi
Cobas TaqMan
(Roche Molecular System)
≥ 15 IU/mL
Not Detected
< 15 IU/mL
(Detected)
Not Detected
9
12
1
< 15 IU/mL
(Detected)
3
12
2
≥ 15 IU/mL
2
19
82
Versant kPCR
(Siemens Healthcare
Diagnostic)
Turriziani - Università La Sapienza Roma
Grazie per l’attenzione