Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi 1980 La Corte Suprema Americana, durante il processo S.A. Diamond vs. A. M. Chakrabarty, stabilì che: “… tutto quello che esiste sotto il cielo, prodotto dalle mani dell’uomo, inclusi quindi gli organismi modificati con le biotecnologie, è brevettabile.” Ciò consentì alla Exxon di brevettare un microrganismo che “mangia idrocarburi” Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi 1988 Phil Leder e Tim Stewart brevettarono il primo organismo transgenico multicelluare, il topo OncoMouse. OncoMouse® Sequenze LTR del virus del tumore mammario murino (MMTV) e dell’oncogene umano myc, codificante per un potente fattore di trascrizione umano. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Mammiferi transgenici : come si producono? 1) Vettori retrovirali 2) Microiniezione del DNA GFP 3) Manipolazione di Cellule ES Corso di Genetica Molecolare Transgenesi dei mammiferi Prof. Catello Polito 25.09.09 Requisiti generali per la produzione di organismi transgenici 1) Una metodica che consenta fisicamente di far entrare in contatto il transgene con il DNA dell’organismo da trasformare. 2) Un sistema molecolare che consenta il trasferimento della molecola di DNA ricombinante nel genoma dell’organismo ospite. 3) Un marcatore molecolare che l’avvenuto trasferimento genico. 4) Un sistema di espressione all’organismo da modificare. consenta del di transgene monitorare appropriato 5) Un sistema che consenta la trasformazione di tutte le cellule dell’organismo bersaglio. Trasformazione di cellule della linea germinale Animali Piante Propagazione clonale di cellule totipotenti Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi 25.09.09 b) Integrazione illegittima a) Ricombinazione omologa Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Integrazione illegittima 25.09.09 Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi 1) I vettori retrovirali Ciclo vitale di un retrovirus • Genoma a RNA, 2 copie. • L’enzima trascrittasi inversa converte l’RNA in DNA a doppio filamento nel citoplasma della cellula infetta. • Il DNA lineare migra nel nucleo e viene integrato nel DNA della cellula ospite. Il DNA integrato è chiamato provirus. •L’apparato della cellula ospite trascrive il provirus producendo RNA virali che fungono sia da mRNA che da genomi e saranno impaccati nei nuovi virioni. • 2 copie di RNA genomico vengono inserite in ogni virione. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Struttura genomica ed espressione genica di un retrovirus • Un tipico genoma retrovirale contiene 3 “regioni”: – Gag (geni per componenti del core proteico del capside) – Pol (geni per trascrittasi inversa, integrasi e proteasi) – Env (geni per le proteine della superficie esterna) Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Genoma retrovirale 25.09.09 Trascrittasi inversa e integrasi Proteine strutturali capside Proteine per involucro Regione Psi+ non codificante ma indispensabile. per confezionamento dell’RNA nel capside. Lunga sequenza terminale ripetuta (inserzione) Vettore retrovirale Inserito nelle cellule eucariotiche con bassissima efficienza tramite trasfezione o elettroporazione Lunghezza massima: 8Kb Con alta efficienza Mediante INFEZIONE Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Accoppiamento con maschio e prelievo di ovociti fecondati. Infezione in cellule in divisione (i retrovirus infettano solo queste). Impianto in una madre “adottiva”, resa pseudo gravida dall’accoppiamento con un maschio vasectomizzato. Selezione dei topi transgenici (Southern blot o PCR su frammento di coda). Per incroci successivi si può ottenere una linea transgenica pura. 1) Vettori retrovirali 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Vettori Retrovirali 25.09.09 Vantaggi • Alta efficienza di trasduzione Svantaggi • Possibilità di generare nuovi virus patogeni per ricombinazione con eventuali virus presenti nell’ospite. • Mutagenesi inserzionale (per quelli che si integrano in maniera casuale nel genoma). • Molecole di DNA di dimensioni limitate (8 Kb). • Reazioni immunitarie. • Costi elevati. Corso di Genetica Molecolare Transgenesi dei mammiferi Prof. Catello Polito 2) Microiniezione di DNA 25.09.09 Gli organismi transgenici possono essere ottenuti modificando cellule embrionali totipotenti mediante iniezione di materiale genetico ricombinante. Promotore Pronucleo femminile Introne 1 2 ATG Pronucleo maschile poly-A 3 4 5 * Iniezione di costrutti di espressione lineari, che si integrano spesso sotto forma di concatameri a partire dai primissimi stadi di sviluppo. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Stimolazione della ovulazione di femmine donatrici con iniezione di siero di cavalla gravida e, dopo 48h, di gonadotropina corionica umana. Si ottengono così fino a 35 ovuli per femmina. Le femmine superovulate vengono accoppiate con maschi e poi sacrificate per la raccolta delle uova fecondate. Prima della fusione dei nuclei si effettua la microiniezione del costrutto ricombinante nel pronucleo maschile, più grande e facile da localizzare. Impianto delle uova iniettate in una madre “adottiva”, resa pseudo - gravida dall’accoppiamento con un maschio vasectomizzato. Selezione dei topi transgenici (Southern blot o PCR su frammento di coda). Per incroci successivi si può ottenere una linea transgenica pura. 2) Microiniezione di DNA 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Microiniezione di DNA 25.09.09 Vantaggi • Possibilità di integrare costrutti più grandi di 8Kb. • Costi relativamente bassi. Svantaggi • Integrazione casuale del transgene. • Mutagenesi inserzionale. • Spesso integrazioni multiple e conseguente effetto tossico per l’organismo accettore. • Bassa efficienza di integrazione (50 transgenici per 1000 uova iniettate). Nonostante tutto è la metodica ad oggi più utilizzata per generare topi transgenici ed in generale mammiferi transgenici Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Efficienza della microiniezione del DNA 25.09.09 Nei topi al massimo il 5% degli ovuli inoculati genera prole transgenica. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Using the mammary gland as a bioreactor (see adjacent figure): •Increase casein content in milk. •Express lactase in milk (to remove lactose). •Resistance to bacterial, viral, and parasitic diseases. Some exogenous proteins that have been expressed in the mammary glands of transgenic animals: •Erythropoietin •Factor IX •Factor VIII •Fibrinogen •Growth hormone •Hemoglobin •Insulin •Monoclonal antibodies •Tissue plasminogen activator (TPA) • α1-antitrypsin Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Pesci transgenici 25.09.09 AquAdvantage Salmon In normal salmon, the gene that controls the production of Growth Hormone is activated by light, so the fish generally grow only during the sunny summer months. But by attaching a constitutive "promoter sequence", Aqua Bounty ended up with salmon that make growth hormone all year round. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi 3) Manipolazione di Cellule staminali embrionali (ES cells) Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi 3) Manipolazione di Cellule staminali embrionali (ES cells) Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi 3) Manipolazione di Cellule staminali embrionali (ES cells) Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi 3) Manipolazione di Cellule staminali embrionali (ES cells) •Le cellule ES sono cellule embrionali pluripotenti, che possono dare origine a cellule di tutti i tessuti embrionali. •Le cellule ES vengono prelevate dalla massa cellulare interna della blastocisti (cellula embrionale indifferenziata) e mantenute in coltura in presenza di cellule o fattori che ne impediscono il differenziamento. •In queste condizioni le cellule ES mantengono intatta la loro capacità di differenziarsi in modo appropriato in qualunque tessuto, una volta reintrodotte in un embrione Nodo embrionale Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Come si coltivano le cellule ES? 25.09.09 •Le cellule del nodo embrionale si possono prelevare mediante l’utilizzo di un micromanipolatore e possono essere messe in coltura su piastre contenenti un monostrato di cellule “nutrici”. Nodo embrionale •Le cellule “nutrici” sono di solito cellule embrionali epidermiche, trattate in modo che non possano più dividersi. Tali cellule forniscono il substrato per l’adesione ed il rilascio di nutrienti per le cellule ES. •Le cellule ES, a differenza di molte altre linee cellulari animali, possono essere mantenute in coltura per molte generazioni. Blastocisti Cellule “nutrici” Embrione Cloni di ES in coltura Corso di Genetica Molecolare Transgenesi dei mammiferi Prof. Catello Polito Cellule totipotenti 25.09.09 Leukemia Inhibitory Factor (L. I. F.) Serum free medium neuroectoderma days BMP4 Epidermide 1 2 3 4 5 6 7 Oct3/4, Fgf4, etc. mesoderma endoderma Sox-1 Cellule βpancreatiche Neuroni Cardiomiociti Muscolo liscio Eritrociti Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Accoppiamento con maschio e prelievo di ovociti fecondati. Prelievo cellule del nodo embrionale. Allestimento della coltura di cellule ES. Trasformazione delle cellule ES mediante una delle tecniche convenzionali (Calcio Fosfato, Lipofezione o Elettroporazione. Arricchimento delle cellule trasformate mediante selezione (resistenza Neo). Microiniezione delle cellule ES trasformate in una nuova blastocisti ricevente. Il topo transgenico che si svilupperà dalla blastocisti manipolata sarà una “chimera”. Impianto in una madre “adottiva”, resa pseudo - gravida dall’accoppiamento con un maschio vasectomizzato. Selezione dei topi transgenici (Southern blot o PCR su frammento di coda). Per incroci successivi si può ottenere una linea transgenica pura. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Introduzione di cellule ES nella blastocisti 25.09.09 Cellule ES derivanti dalla “blastocisti” donatrice da Topo nero (oppure ES trasformate contenenti un transgene) Blastocisti “ricevente” da topo albino (oppure da topo wild-type) Chimera transgenica (nel caso delle cellule ES transgeniche l’effetto chimera potrebbe essere non visibile) Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Manipolazione di Cellule staminali embrionali (ES cells) Vantaggi • Buona efficienza di integrazione • Possibilità di utilizzare le metodiche di ricombinazione omologa e sito-specifica. Svantaggi • Necessità di avere a disposizione delle linee cellulari ES. • Mutagenesi inserzionale (se si sfrutta il meccanismo dell’inserzione illegittima). • Costi abbastanza elevati. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Types of Recombination Homologous - occurs between sequences that are nearly identical (e.g., during meiosis). Site-Specific - occurs between sequences with a limited stretch of similarity; involves specific sites. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Tipi di eventi di Ricombinazione Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi L’esistenza della ricombinazione e della possibilità di trasformare le cellule ES in coltura prima dell’impianto in una blastocisti rendono possibile le metodiche di Gene Targeting, cioè la sostituzione o l’inserimento in punti precisi del genoma di una molecola di DNA con un’altra. Nel caso dei mammiferi con genoma completamente sequenziato tale metodica consente di scegliere il sito esatto di inserzione/sostituzione. Questo consente di eliminare il problema dell’effetto di posizione e della mutagenesi inserzionale. Come si produce un ceppo transgenico per Gene Targeting? Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi 25.09.09 Costrutto per Gene Targeting in topi Sequenze di DNA per RICOMBINAZIONE OMOLOGA nel genoma bersaglio Gene che conferisce resistenza alla G418 TRANSGENE di interesse Geni della Timidina Kinasi (virus herpes simplex). In presenza di GANCICLOVIR: MORTE Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 ASPECIFICA SPECIFICA Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 ASPECIFICA SPECIFICA Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 ASPECIFICA SPECIFICA Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi SELEZIONE POSITIVA e NEGATIVA 25.09.09 ASPECIFICA SPECIFICA 1) 2) Aggiunta di G418: SELEZIONE POSITIVA di cellule che hanno INTEGRATO il DNA Aggiunta di GANCICLOVIR: SELEZIONE NEGATIVA di cellule con INTEGRAZIONE ASPECIFICA Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Accoppiamento con maschio e prelievo di ovociti fecondati. Prelievo cellule del nodo embrionale. Allestimento della coltura di cellule ES. Trasformazione delle cellule ES mediante una delle tecniche convenzionali (Calcio Fosfato, Lipofezione o Elettroporazione. Arricchimento delle cellule trasformate mediante doppia selezione (resistenza Neo + TK). Microiniezione delle cellule ES trasformate in una nuova blastocisti ricevente. Il topo transgenico che si svilupperà dalla blastocisti manipolata sarà una “chimera”. Impianto in una madre “adottiva”, resa pseudo - gravida dall’accoppiamento con un maschio vasectomizzato. Selezione dei topi transgenici (Southern blot o PCR su frammento di coda). Per incroci successivi si può ottenere una linea transgenica pura. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Knock-In Knock-Out Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi La ricombinazione sito-specifica: il sistema Cre-lox 25.09.09 Il limite principale dei topi transgenici Knock-Out (KO) per un gene e’ la possibile mortalità degli omozigoti durante lo sviluppo. Soluzione : l’induzione della mutazione in modalità tempo e tessuto specifica. Corso di Genetica Molecolare Transgenesi dei mammiferi Prof. Catello Polito Il sistema Cre-lox 25.09.09 Sistema alla base della tecnica: Meccanismo di ricombinazione del fago P1 con i siti Lox e la ricombinasi sito-specifica Cre. Cre Recombinase LoxP: locus di crossover (2 sequenze palindromiche di 13bp + regione centrale di 8bp) LoxP “attira” la ricombinasi CRE la quale ricombina le sequenze di DNA adiacenti. Corso di Genetica Molecolare Transgenesi dei mammiferi Prof. Catello Polito Il sistema Cre-lox 25.09.09 Sistema alla base della tecnica: Meccanismo di ricombinazione del fago P1 con i siti Lox e la ricombinasi Cre. Lox Lox Lox Lox CRE Recombinase Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Il sistema Cre-lox 25.09.09 Con questo sistema si possono ottenere dei mutanti che perdono una data regione solo attivando la ricombinasi Cre. Per fare questo si devono costruire dei vettori con la regione genetica da eliminare fiancheggiata da siti Lox. Con questa strategia si possono ottenere topi transgenici per geni che sono letali in fasi diverse e soprattutto, con l’espressione della ricombinasi Cre tessuto specifica, si può far avvenire il knock-out del gene solo in particolari tessuti dove si esprime o dove si induce Cre. Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi 25.09.09 G418 Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi 25.09.09 I siti Lox derivano da fago P1 (non esistono nel genoma animale/vegetale) quindi non possibilità di ricombinazione in altri siti del genoma Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Il SISTEMA Cre-Lox permette il controllo dell’espressione genica nello SPAZIO e nel TEMPO Utilizzo di un PROMOTORE TESSUTO SPECIFICO Utilizzo di un PROMOTORE: -dipendente dallo STADIO di SVILUPPO -INDUCIBILE Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito 25.09.09 Transgenesi dei mammiferi Corso di Genetica Molecolare Prof. Catello Polito Transgenesi dei mammiferi Referenze 25.09.09 1) Curr Gene Ther. 2009 Dec;9(6):459-74. State-of-the-art lentiviral vectors for research use: risk assessment and biosafety recommendations. Pauwels K, Gijsbers R, Toelen J, Schambach A, Willard-Gallo K, Verheust C, Debyser Z, Herman P. 2) Proc Natl Acad Sci U S A. 1980 Dec;77(12):7380-4. Genetic transformation of mouse embryos by microinjection of purified DNA. Gordon JW, Scangos GA, Plotkin DJ, Barbosa JA, Ruddle FH. 3) Cell. 1986 Feb 14;44(3):419-28. High frequency targeting of genes to specific sites in the mammalian genome. Thomas KR, Folger KR, Capecchi MR. 4) Science. 1995 Sep 8;269(5229):1427-9. Inducible gene targeting in mice. Kühn R, Schwenk F, Aguet M, Rajewsky K. 5) Transgenic Res. 2010 Jun;19(3):363-71. Epub 2009 Sep 26. Zinc-finger nucleases: a powerful tool for genetic engineering of animals. Rémy S, Tesson L, Ménoret S, Usal C, Scharenberg AM, Anegon I.