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Silvia Zucchelli, Ph.D. Curriculum vitae DATI ANAGRAFICI Nome: Silvia Cognome: ZUCCHELLI Data e luogo di nascita: 28/04/1971 Milano (MI), Italia Cittadinanza: Italiana Stato civile: Coniugata Lingue straniere conosciute: Inglese CURRICULUM VITAE ET STUDIORUM 2001 Dottorato in Immunologia, Università di Roma “Tor Vergata”, Roma (Italia) 1995 Laurea cum laude in Scienze Biologiche, Università degli Studi di Milano, Milano (Italia) CARRIERA ACCADEMICA 2013‐ 2010‐2013 2006‐2010 2003‐2006 2000‐2003 1996‐2000 1995‐1996 1994‐1995 Ricercatore a tempo determinato (RTD) in genetica (BIO‐18), Università del Piemonte Orientale “A. Avogadro”, Novara (Italia) Ricercatore post‐doc, Fondazione Telethon, SISSA, Trieste (Italia) Ricercatore a tempo determinato, SISSA, Trieste (Italia) Ricercatore post‐doc, senior, SISSA, Trieste (Italia) Ricercatore post‐doc, Joslin Diabetes Center, Harvard Medical School, Boston MA (USA) Studente di dottorato, IRBM, Merck Research Laboratories, Pomezia, Roma (Italia) Borsa di studio pre‐dottorato, IRBM, Merck Research Laboratories, Pomezia, Roma (Italia) Studente pre‐laurea, Università degli studi di Milano, Milano (Italia) INCARICHI SCIENTIFICI 2011‐ 2011‐ Membro del consorzio di ricerca internazionale FANTOM5, RIKEN, Jokohama (Giappone) Consulente Scientifico per TransSINE Technologies, Yokohama, (Giappone) CAMPI DI INDAGINE DELLA RICERCA 1. Genomica funzionale del cervello 2. RNA lunghi non‐codificanti 3. Malattie neurodegenerative TEMI CORRENTI DI RICERCA 1. Studio dei meccanismi molecolari e delle possibili applicazioni terapeutiche di RNA lunghi non‐codificanti in grado di aumentare la sintesi di proteine bersagio (tecnologia SINEUP). Le SINEUPs sono molecole di RNA non‐codificanti in grado di aumentare la sintesi di proteine bersaglio (Carrieri C., et al., Nature 2012). Esse sono composte da due domini funzionali: 1) una regione “di legame” che definisce la specificità di azione della SINEUP verso una determinata proteina bersaglio; 2) una regione “di attivazione” che stimola la sintesi della proteina bersaglio (Zucchelli S., et al., RNA Biology, 2015). Molecole SINEUPTM possono pertanto essere disegnate artificialmente per attivare la sintesi di virtualmente qualsiasi proteina bersaglio d’interesse (Zucchelli S., Fasolo F., et al., Frontiers in Neuroscience, 2015; Patrucco L., et al., Gene, 2015). I valori d’incremento di sintesi proteica ottenuti tramite la tecnologia SINEUP sono di tipo fisiologico, nell’ordine delle 2‐3 volte. Questo rende la tecnologia SINEUP interessante per applicazioni terapeutiche di malattie di aploinsufficienze (Indrieri A., et al., Scientific Reports, 2016). Lo scopo del laboratorio è di studiare i meccanismi molecolari che sono alla base del funzionamento delle SINEUPs all’interno della cellula e di valutarne applicazioni in vivo per correggere difetti dovuti ad insufficienze di produzione di proteine bersaglio. 2. Mappa trascrizionale dei principali loci associati alle malattie neurodegenerative La collezione del Consorzio FANTOM5 di libraries di sequenziamenti a singola molecola di tipo Helicos associate alla tecnologia CAGE (CAP Analysis of Gene Expression) rappresenta una fonte molto ampia di mappe transcrizionali per loci d’interesse in una vasta gamma di tessuti, cellule primarie e linee cellulari sia umane che murine. Come laboratorio membro del consorzio, abbiamo potuto rivelare la complessità del “Promoterome” che sta alla base della funzionalità di cellule e tessuti (Forrest A.R.R., et al., Nature, 2014). Lo scopo del laboratorio è di analizzare il profilo trascrizionale dei principali loci di geni associati a malattie neurodegenerative, tra le quali la Corea di Huntington, le malattie di Alzheimer e Parkinson e la Sclerosi Laterale Amiotrofica. Analizzando il profilo trascrizionale di diverse zone del cervello di campioni post‐mortem umani, abbiamo potuto dimostrare l’esistenza di RNA antisenso non‐codificanti per i geni dell’alfa‐sinucleina, della Proteina Precursone Amiloide (APP) di DJ‐1 e di LRRK2 (Zucchelli S., et al., FANTOM5 satellite manuscript, submitted). Studi successivi saranno volti a determinare la funzione degli RNA non‐codificanti antisenso a geni coinvolti in malattie neurodenegerative. PROGETTI FINANZIATI IN CORSO BANDO Bando CARIPLO 2014 TITOLO DEL PROGETTO “THE ROLE OF DNA DAMAGE IN NORMAL BRAIN AGING AND IN PATHOLOGICAL NEURODEGENERATION ASSOCIATED WITH ALZHEIMER’S DISEASE” Rif. 2014‐0812) LE CINQUE PUBBLICAZIONI PIÙ SIGNIFICATIVE DELLA CARRIERA 1. Forrest AR, Kawaji H, Rehli M, Baillie JK, de Hoon MJ, Lassmann T, Itoh M, Summers KM, Suzuki H, Daub CO, Kawai J, Heutink P, Hide W, Freeman TC, Lenhard B, Bajic VB, Taylor MS, Makeev VJ, Sandelin A, Hume DA, Carninci P, Hayashizaki Y, FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT) Nature (2014) Mar 27;507(7493):462‐70. (IF 38.597) 2. Carrieri C, Cimatti L, Biagioli M, Beugnet A, Zucchelli S, Fedele S, Pesce E, Ferrer I, Collavin L, Santoro C, Forrest AR, Carninci P, Biffo S, Stupka E, Gustincich S. (2012). Long non‐coding antisense RNA controls Uchl1 translation through an embedded SINEB2 repeat. Nature (2012) 491(7424):454‐7 (IF 38.597) 3. Pifferi S, Pascarella G, Boccaccio A, Mazzatenta A, Gustincich S, Menini A, Zucchelli S. Bestrophin‐2 is a candidate calcium‐activated chloride channel involved in olfactory transduction. Proc Natl Acad Sci USA (2006) 103(34):12929‐34 (IF 9.737) 4. Zucchelli S., Holler P., Yamagata T., Roy M. Benoist C. and Mathis D. “Defective central tolerance induction in NOD mice: genomics and genetics” Immunity (2005); 22: 385‐396 (IF 19.266) 5. Zucchelli S., Roccasecca R., Meola A., Bruni Ercole B., Tafi R., Dubuisson J., Galfre’ G., Cortese R., and Nicosia A. “Mimotopes of the hepatitis C virus hypervariable region 1, but not the natural sequences, induce cross‐reactive antibody response by genetic immunization” Hepatology (2001); 33(3): 692‐703 (IF 10.734) ULTERIORI INFORMAZIONI La dott.ssa Silvia Zucchelli è titolare del brevetto “FUNCTIONAL NUCLEIC ACID MOLECULE AND USE THEREOF” depositato presso USPTO ‐Serial No. 61/469,399.