Scheda da utilizzare per la progettazione ed erogazione dei moduli didattici d’insegnamento Università degli Studi di Bari Facoltà di Scienze Biotecnologiche Corso di Laurea in Biotecnologie per l’Innovazione di Processi e Prodotti Settore scientifico disciplinare: BIO/18 Docente Attività Ore attività Crediti Pre-requisiti Titolo insegnamento: Genetica molecolare ed ingegneria genetica Dott. R. M. Marsano Telefono: 0805443338 E-mail: [email protected] Lezioni frontali Esercitazioni 48 Orario di ricevimento: Presso: DIGEMI Laboratorio 24 Totale 72 6 2 8 Concetti basilari di genetica classica e di biologia molecolare. Obiettivi formativi Far acquisire agli studenti i concetti relativi alla struttura del genoma ed alla regolazione dell’espressione genica. Tali acquisizioni mirano alla comprensione dei meccanismi molecolari che sottendono all’espressione del fenotipo. I concetti acquisiti riguarderanno organismi unicellulari e complessi, oltre che a sistemi virali sia eucariotici che procariotici. Acquisire le basi teoriche e applicative delle tecniche e metodologie specifiche della Genetica Molecolare e dell’Ingegneria Genetica. Sviluppare capacita’ di progettazione basate sulle nozioni acquisite. Contenuto STRUTTURA DEL GENOMA Organizzazione del genoma Eterocromatina ed eucromatina Centromeri e telomeri Complessita genomica e paradosso del valore C Sequenze a copia singola e sequenze ripetute. Sequenze di DNA mobili nel genoma. Classificazione. Meccanismi di trasposizione. Elementi trasponibili e loro uso nella genetica molecolare e nell’ingegneria genetica. Gli elementi trasponibili P di Drosophila e la disgenesia degli ibridi. Mutagenesi con elementi trasponibili. Trasformazione della linea germinale mediata da elementi P e selezione di individui transgenici. Screening genetici mediante mutagenesi inserzionale condotta con elementi P. Gli elementi P ingegnerizzati. CONTROLLO TRASCRIZIONALE E POST-TRASCRIZIONALE DELL’ESPRESSIONE GENICA Concetto di operone. Operoni inducibili e reprimibili. Operone lac. Operone trp. Attenuazione Controllo dell’espressione genica nei fagi temperati e lisogeni. Struttura ed espressione dei geni eucariotici. Regolazione per riarrangiamento del DNA. Elementi di controllo dell’espressione dei geni eucariotici. Promotori, enhancers, silencers, insulators. Regolazione post trascrizionale; splicing e splicing alternativo; editing. RNA inteference: origine e funzione di miRNAs e siRNAs. Cromatina e cromosomi; struttura della cromatina e regolazione genica; imprinting; effetti epigenetici. Uso delle sequenze regolative nell’ingegneria genetica. GENETICA CLASSICA E GENETICA INVERSA. Approcci e strategie sperimentali in era post geomica. INGEGNERIA GENETICA Vettori fagici: caratteristiche generali; vettori fagici avanzati Il ruolo del batteriofago lambda nelle applicazioni biotecnologiche. Vettori per il clonaggio di grandi frammenti di DNA: cosmidi, BAC, PAC, vettori che producono DNA a singolo filamento, vettori di espressione, vettori per la preparazione di ribosonde. Clonaggio in Saccharomices cerevisiae; plasmidi replicativi di lievito, cromosomi artificiali; costruzione di plasmidi mediante ricombinazione omologa in lievito; gene targeting e gene transplacement. Ibridazione molecolare: principi e metodi; ibridazione di Southern blot, Northern blot, colony hybridization, Ibridazione fluorescente in situ (FISH). Le genoteche di DNA genomico in vettori ad alta capacità; Strategie di screening delle genoteche. Genoteche di cDNA; metodi per il clonaggio direzionale del cDNA; uso delle expressed sequence tags (EST) nella genomica; RACE delle estremità 5’ e 3’. Microarray, qRT-PCR SAGE, RNAseq. Panoramica sulle strategie e vettori usati nel trasferimento genico. Virus SV40 – Cellule COS, Baculovirus, Herpes virus, retrovirus e vettori retrovirali, Produzione di proteine da geni clonati in procarioti: vettori di espressione, vettori con promotori inducibili; cassette e fusioni di geni; metodi di purificazione di proteine. Produzione di proteine da geni clonati in eucarioti: vettori di espressione di lievito. LABORATORIO Introduzione alla Drosophila come organismo modello Preparazione di cromosomi politenici da ghiandole salivari di Drosophila Preparazione di cromosomi in metafase di Drosophila Localizzazione subcellulare di proteine espresse in cellule in coltura Microiniezione in embrioni di Drosophila Utilizzo di tools bioinformatici Testi DNA ricombinante. Geni e genomi Watson Caudy Myers Witkowski Consigliati Seconda edizione Zanichelli Propedeuticità Da consultare Genetica Principi di analisi formale Griffiths, Zanichelli iGenetica Fondamenti, Russel, EdiSES Obbligatorie: Consigliate: Genetica, Biologia molecolare Metodi di Valutazione Collocazione Prova scritta Prova di laboratorio NO Colloquio Orale SI NO Prove di esonero Parziale NO Anno di Corso TERZO Semestre PRIMO Data d’inizio Data fine OTTOBRE GENNAIO