Tornabene_Salvatore_Tesina di Biologia Molecolare 2

Erica Tornabene (matr. 591864)
Biologia Molecolare II
Prof. Giorgio Valle
TITOLO: Trova l'ortologo in C. elegans del gene che produce Bcl-2 nei
mammiferi.
Dalla ricerca su quale fosse l’ ortologo in C. elegans del gene che nei
mammiferi produce Bcl-2 ho trovato numerosi articoli inerenti a tale
argomento. Di seguito riporto 2 esempi che reputo significativi.
1) Nature 385, 653 - 656 (13 February 1997); doi:10.1038/385653a0
Interaction between the C. elegans cell-death regulators CED-9 and
CED-4
MONA S. SPECTOR*, SERGE DESNOYERS*, DANIEL J. HOEPPNER*† & MICHAEL O. HENGARTNER*
*
†
Cold Spring Harbor Laboratory, 1 Bungtown Road, Cold Spring Harbor, New York 11724, USA
Graduate Program in Genetics, Department of Molecular Microbiology, SUNY at Stony Brook, Stony Brook, New York 11794, USA
“La morte cellulare programmata (apoptosi) è un processo evolutivo di conservazione usato
dagli organismi multicellulari per eliminare le cellule che non servono o che sono
potenzialmente dannose per l’ organismo. I membri della famiglia proteica Bcl-2 di mammifero
sono implicati nella regolazione dell’ apoptosi, ma il loro preciso meccanismo d’ azione rimane
irrisolto. In C. elegans CED-9, l’ omologo di Bcl-2, impedisce la morte cellulare ostacolando l’
attività di CED-3, un membro della famiglia delle Caspasi, e di CED-4, una proteina della quale
non ci dono omologhi noti in mammifero. […] “
2)
1994 Feb 25;76(4):665-76.
C. elegans cell survival gene ced-9 encodes a functional homolog of the
mammalian proto-oncogene bcl-2.
Hengartner MO, Horvitz HR
Howard Hughes Medical Institute, Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge 02139.
“[…] ced-9 codifica per una proteina da 280 aa che mostra sequenza e struttura simili al protooncogene di mammifero bcl-2. La sovraespressione di bcl-2 può mimare gli effetti protettivi di
ced-9 in C. elegans e impedisce l’ ectopica morte cellulare che si manifesta negli individui che
hanno subito una mutazione per perdita di funzione nel gene ced-9. Questi risultati
suggeriscono che ced-9 e bcl-2 sono omologhi e che il meccanismo di morte cellulare
programmata è conservato dai nematodi ai mammiferi.”
PMID: 7907274 [PubMed - indexed for MEDLINE]
Cercando informazioni su CED-9 nel database NCBI, alla voce RefSeq viene
riportato che il gene ced-9 codifica in C. elegans l’ omologo dell’ inibitore della
morte cellulare programmata di mammifero (Bcl-2). Durante lo sviluppo l’
attività di CED-9 è essenziale per prevenire che nella cellula si inneschi il
processo di morte cellulare programmata. CED-9 agisce legando e reprimendo
l’ attività di CED-4, una proteina simile ad APAF-1 nell’ uomo, la quale regola
positivamente l’ attività della Caspasi CED-3. CED-9 è localizzata nei
mitocondri.
Questi dati sono confermati anche da Wormbase, database specifico per C.
elegans. Come mostrato in Figura 1, tra le sequenze più simili a CED-9, in
accordo con BLASTP c’ è anche Bcl-2 che presenta un E-value (probabilità di
trovare per caso un allineamento con punteggio maggiore o uguale a quello
considerato) pari a 1.3*10-6.
In Figura 2 infine è schematizzato il confronto tra le proteine che intervengono
nel processo di apoptosi in C. elegans (colore nero) e in mammifero (colore
rosso).
Figura 1. Ricerca in Wormbase del gene ced-9
Figura 2. Confronto tra le proteine che intervengono nel processo di apoptosi in
C. elegans e in mammifero.