Diapositiva 1

•
• macronutrienti
carboidrati (zuccheri)
lipidi (grassi)
•
proteine
•
vitamine
• micronutrienti
•
minerali
macroelementi
Na
K
Cl
Ca
Mg
P
microelementi
I
Fe
Mn
Cr
Mo
Se
liquido
acqua
metanolo
etanolo
acetone
benzene
cloroformio
T fusione
°C
0
-94
-117
-93
5
-63
T
ebollizione
°C
100
65
78
56
80
62
calore
evapor.
cal/g
540
263
204
125
94
59
costante
dielettrica
80
33
24
21
2
5
orbitale ibrido sp3
Modello spaziale e sezione della mioglobina
aa idrofobici aa polari
REAZIONE NON CATALIZZATA
Substrato
(bastoncino)
Stato di transizione
(bastoncino piegato)
Energia libera G
ENERGIA
Prodotto
(bastoncino rotto)
REAZIONE CATALIZZATA DA UN ENZIMA
E
si formano molte interazioni
fra l’enzima e il substrato
ENERGIA
ES
E
Energia libera G
ENERGIA
non cat.
AUMENTO DELLA VELOCITA’DI
UNA REAZIONE CATALIZZATA
DA UN ENZIMA
Ciclofilina
105
Carbonico anidrasi
107
Trioso fosfato isomerasi
109
Carbossipeptidasi A
1011
Fosfoglucomutasi
1012
Succinil-CoA transferasi
1013
Ureasi
1014
Orotidina monofosfato decarbossilasi
1017
Cinetica delle reazioni enzimatiche
Leonor Michaelis, Maud Menten (1913)
Una reazione catalizzata da enzimi si divide in due fasi:
La demolizione del complesso
enzima – substrato con formazione
del prodotto finale
La formazione del complesso
enzima – substrato
E + S
k1
k-1
ES
ES
Tappa veloce
E + S
k1
k-1
ES
k2
k-2
k2
k-2
E + P Tappa lenta
E + P
(condiziona la vel.
complessiva della
reazione)
L’equazione globale della reazione è la seguente:
E + S
k1
ES
k2
E + P
k-1
k-2
dove, nella parte iniziale della razione, la concentrazione
di P è bassa e quindi k-2 è trascurabile
La relazione tra [S] e V espressa in termini quantitativi deve tenere conto di:
[S], V0, Vmax e le diverse costanti di dissociazione k1, k-1, k2 che risultano
raggruppate nella COSTANTE DI MICHAELIS MENTEN (Km)
Km = (k2 + k-1) / k1
L’equazione della curva che ne deriva è data da:
V0 =
Vmax [S]
Km + [S]
EQUAZIONE DI
MICHAELIS MENTEN
ENZIMI REGOLATORI
Generalmente la prima delle
reazioni di un ciclo è catalizzata
da un enzima regolatore, che quindi
“regola” la velocità dell’intero ciclo
treonina
Retroinibizione (Inibizione da feedback)
isoleucina
NAD+
(ac. nicotinico o niacina, vitamina B )
3
FAD
(riboflavina, vitamina B2)
COENZIMA A
(vitamina B5)
TIAMMINA PIROFOSFATO
(tiammina, vitamina B1)
- Gly - Pro - X - Gly - X - Hyp -
Res.
%
Gly
Pro
Hyp/Hyl
Ala
35
12
10
10
d
1.5 nm
l
300 nm
passo 0.3 nm
(3 res. aa)