Identificazione microorganismi (batteri, lieviti e muffe)

Identificazione
microrganismi mediante
sequenziamento
Grazie alla strumentazione a disposizione nel
Laboratorio di Biologia Molecolare, Eurofins
BioPharma Product Testing è in grado di fornire, in
accordo alle GMP, un servizio di identificazione di
microrganismi (batteri e funghi) mediante
sequenziamento capillare.
L’identificazione di microrganismi (batteri e funghi)
mediante sequenziamento si basa
sull’amplificazione di geni conservati (presenti in
tutti gli organismi) che contengono però regioni
divergenti utilizzabili per l’identificazione della
specie di appartenenza:

Identificazione batteri
o

Amplificazione regione 5 - terminale di
500 pb del gene 16S rRNA del
genoma batterico
Identificazione funghi
o
o
o
o
Amplificazione della regione D2 del
gene Large Subunit (LSU) rRNA del
genoma dei funghi
Sequenziamento mediante
elettroforesi capillare su ABI PRISM
310 Genetic Analyzer
Confronto delle sequenze ottenute con
quelle presenti in banche dati
specializzate
Identificazione a livello di genere
(omologia > 97%) e specie (omologia
> 99%).
I vantaggi dei servizi analitici offerti da
Eurofins BioPharma Product Testing
Rapidità e facilità di esecuzione
 Direttamente dalla piastra o dalla coltura
pura (non è richiesto effettuare una
sottocoltura)
 Applicabile a microrganismi con
particolare esigenze nutritive
Accuratezza e specificità
 Discriminazione di un elevatissimo numero
di specie
 Identificazione a livello di singola
mutazione nucleotidica
Riproducibilità
 Facilmente ripetibile anche da parte di
operatori diversi.