settore tessuto - Istituto Giannina Gaslini

Riconoscimento delle Biobanche per Diagnosi e Ricerca in Regione Liguria. Biobanca Integrata Tessuto (BIT)
Istituto
Giannina Gaslini
per la cura, difesa, ed
assistenza
dell’infanzia e della
fanciullezza
Rev. 26/03/2009
Pagina 1 di 3
Attività e attrezzature dedicate
SETTORE TESSUTO
ACCETTAZIONE E PRIMO
TRATTAMENTO DEL
MATERIALE TISSUTALE IN
CONDIZIONI DI STERILITA’ E
SICUREZZA PER L’OPERATORE
IL PATOLOGO EFFETTUA VALUTAZIONE ,
PREPARAZIONE E CAMPIONAMENTO DEL
MATERIALE, CHE PERVIENE
DIRETTAMENTE DALL’ISTITUTO O DA
STRUTTURE ESTERNE PRESSO L’U.O.
ANATOMIA PATOLOGICA
IL PATOLOGO EFFETTUA
VALUTAZIONE , PREPARAZIONE E
CAMPIONAMENTO DEL MATERIALE
PRESSO LA SALA OPERATORIA
PROCESSAZIONE AUTOMATICA
DEL CAMPIONE DA AVVIARE
ALL’ESAME ISTOPATOLOGICO
CONGELAMENTO DI PARTE DEL
CAMPIONE, SPECULARE AL CAMPIONE
DESTINATO ALLA PROCESSAZIONE PER
LA DIAGNOSI
VALUTAZIONE BIOMOLECOLARE
DEL CONTENUTO DI DNA ( DNA
INDEX)
INCLUSIONE IN PARAFFINA PER
DARE CONSISTENZA AL CAMPIONE
CHE DOVRA’ ESSERE TAGLIATO
AD UNO SPESSORE DI 3MICRON
TAGLIO AL MICROTOMO ROTATIVO
ED ALLESTIMENTO DEL
PREPARATO DA OSSERVARE AL
MICROSCOPIO DOPO OPPORTUNE
COLORAZIONE
CONSERVAZIONE DEL CAMPIONE IN
VAPORI DI AZOTO IN CRIOCONGELATORE
SERVOASSISTITO, PER UN PERIODO DI
TEMPO INDEFINITO
ARCHIVIAZIONE INFORMATICA DEI
DATI IN DATABASE BIT (settore tessuto).
I CAMPIONI SONO IDENTIFICABILI
MEDIANTE UN CODICE UNIVOCO.
IL SOGGETTO DA CUI ESSO PROVIENE
E’ SEMPRE RICONOSCIBILE DA PARTE
DI OPERATORI AUTORIZZATI .
IMMUNOCOLORAZIONE
AUTOMATICA DEL PREPARATO
PER FENOTIPIZZARE LA
LESIONE TISSUTALE E FISH
PARTE DEL CAMPIONE, SPECULARE AL CAMPIONE DESTINATO ALLA PROCESSAZIONE PER LA DIAGNOSI
CONSEGNATO ALL LABORATORIO DI BIOLOGIA MOLECOLAREPER ANALISI MOLECOLARE
SETTORE GENOMICA
BIT-IRCCS Istituto Giannina Gaslini – Largo Gerolamo Gaslini 5, 16147 Genova Quarto – Italia
Telefono:++39 010 5636 210 / ++39 010 5636 633 e-mail: [email protected]; [email protected]
Riconoscimento delle Biobanche per Diagnosi e Ricerca in Regione Liguria. Biobanca Integrata Tessuto (BIT)
Istituto
Giannina Gaslini
per la cura, difesa, ed
assistenza
dell’infanzia e della
fanciullezza
Rev. 26/03/2009
Pagina 2 di 3
Attività e attrezzature dedicate
SETTORE GENOMICA
IL CAMPIONE PERVIENE AL LABORATORIO DI BIOLOGIA MOLECOLARE IN
CONTENITORI CON CONSERVANTE ADEGUATO (ALLPROTECT TISSUE REAGENT)
E VIENE REGISTRATO IN SOFTWARE DEDICATO.
VIENE VALUTATO IL VOLUME DEL CAMPIONE E VIENE TRATTATO PER
L’ESTRAZIONE DI DNA E RNA E PROTEINE.
TUTTI I DERIVATI GENOMICI VENGONO VALUTATI QUANTITATIVAMENTE CON
ANALISI SPETTROFOTOMETRICA AD ALTA RISOLUZIONE
(NANODROP
THERMOSCIENTIFIC) .
IL DNA È VALUTATO QUALITATIVAMENTE CON ANALISI DI ELETTROFORESI,
MENTRE L’RNA, IL miRNA E LE PROTEINE SONO STUDIATI NELLA LORO
QUALITÀ ATTRAVERSO UN ANALISI DI ELETTROFORESI CAPILLARE
EFFETTUATA MEDIANTE LA STRUMENTAZIONE AGILENT 2100 BIOANALYZER
SITUATA NELLA CORE FACILITY DELL’ISTITUTO GASLINI.
IL MATERIALE DERIVATO VIENE ETICHETTATO, TRATTANDO I DATI ANAGRAFICI
DEL PAZIENTE SEGUENDO LA NORMATIVA VIGENTE (CODICE DELLA PRIVACY.)
LA CONSERVAZIONE DEL CAMPIONE AVVIENE IN CONGELATORE SERVOASSISTITO.
BIT-IRCCS Istituto Giannina Gaslini – Largo Gerolamo Gaslini 5, 16147 Genova Quarto – Italia
Telefono:++39 010 5636 210 / ++39 010 5636 633 e-mail: [email protected]; [email protected]
Riconoscimento delle Biobanche per Diagnosi e Ricerca in Regione Liguria. Biobanca Integrata Tessuto (BIT)
Istituto
Giannina Gaslini
per la cura, difesa, ed
assistenza
dell’infanzia e della
fanciullezza
Rev. 26/03/2009
Pagina 3 di 3
Attività e attrezzature dedicate
I DATI QUALITATIVI E QUANTITATIVI DEL MATERIALE ESTRATTO
VENGONO INSERITI NEL DATABASE CHE VIENE COSTANTEMENTE
AGGIORNATO
UNA ALIQUOTA DI RNA VIENE
UTILIZZATO PER LA TIPIZZAZIONE
MOLECOLARE
UNA ALIQUODA DI DNA
VIENE INVIATO PER IL
CGH ARRAY
IN
ALCUNE
CIRCOSTANZE
VENGONO
STAMPATE
CHIPS
DEDICATE
UTILIZZANDO
IL
SISTEMA
DI
DISPENSAZIONE
AUTOMATICA FREEDOM EVO 75
TECAN PER LA PREPARAZIOJE DI
OLIGONUCLEOTIDI
L’INTEGRITA’ DEL DNA VIENE
VALUTATA TRAMITE CGH
ARRAY I CUI RISULTATI
VENGONO MISURATI TRAMITE
LO SCANNER AGILENT
(AGILENT TECHNOLOGIES)
L’ELABORAZIONE BIOINFORMATICA
DEI DATI VIENE EFFETTUATA GRAZIE
ALL’IMPIEGO
DI
SOFTWARE
DEDICATI
CHE
PERMETTONO
L’ANALISI INTEGRATA DEI DATI DI
TIPIZZAZIONE MOLECOLARE (CGH,
miRNA ED ESPRESSIONE GENICA) E I
DATI CLINICI.
I
DERIVATI
GENOMICI
SUBISCONO UN PROCEDIMENTO
PREPARATIVO
ALLA
TIPIZZAZIONE
GENOMICA
TRAMITE MICROARRAY. QUESTI
VENGONO
PREPARATI
ATTRAVERSO L’UTILIZZO DELLO
SPOTARRAY 24 MICROARRAY
PRINTING
SYSTEM
(PERKINELMER).
LA
RIPRODUCIBILITA’
E
L’OTTIMIZZAZIONE
DELL’IBRIDIZZAZIONE
DELLE
CHIPS ALLE SONDE MARCATE
VIENE GARANTITO DALL’UTILIZZO
DELLO
STRUMENTO
HS400
IBRIDIZZATORE TECAN
I
DATI
DELL’ANALISI
DI
MICROARRAY VENGONO ACQUISITI
TRAMITE
SCANSIONE
LASER
GRAZIE
AL
GENEPIX
4000B
MICROARRAY SCANNER (AXON).
BIT-IRCCS Istituto Giannina Gaslini – Largo Gerolamo Gaslini 5, 16147 Genova Quarto – Italia
Telefono:++39 010 5636 210 / ++39 010 5636 633 e-mail: [email protected]; [email protected]